不同的甘薯品种有不同的贮藏特点，从耐冻性这一点来说，北方和本地品种比南方品种更耐冻耐贮。相对而言，苏薯8号、北京553、红香蕉等品种比较耐冻。广东的广紫薯1号、福建的岩薯5号、浙江的一些黄心食用甘薯，在江苏产后贮藏期都会有较高的腐烂损耗，冬季损耗率一般达20%~50%。
在本地品种中，食用甘薯品种的含水量比较高，在发生冻害、渍害及机械损伤后，易诱发软腐病、黑斑病等而导致腐烂。
冬季甘薯贮藏主要围绕保温防渍进行。
在生产上，随着食用甘薯产业化规模的扩大及鲜薯产量的增加，鲜薯冬季贮藏成为许多甘薯种植户及经纪人必须掌握的技术。对没有甘薯冬季贮藏经验的农户来说，常常会因1~2项贮藏措施不到位而引起甘薯大量腐烂，造成重大经济损失。另一方面，在产业化生产中，大量的鲜薯仅需要1~3个月的临时贮藏或周转，许多农业技术人员对传统的贮藏方法进行了改进。相对安全的主要有斜坡岗地半地下坑式贮藏窖贮藏、田间就地堆藏、室内贮藏(包括袋装、散堆及圈席圆柱式贮藏)等，这些贮藏方法操作简便，成本低，是解决大量甘薯贮藏的重要途径。
(一)室内贮藏
当甘薯收获量大，没有专用的贮藏窖(屋)等条件时，可以利用空余房间进行室内贮藏。在江苏东南部的太湖地区，地下水位较高，夜间田间湿度较大，不适合田间堆藏，不少专业户常用室内贮藏的方法来保存甘薯。从品种上来看，宁紫1号、济南黄、红香蕉等高产、高水分品种，更适合室内贮藏。
室内贮藏主要有以下几个优点：管理简单，不需要像田间堆藏那样每天揭盖薄膜；温度容易控制，气温过低时可以人工加温；甘薯进出货方便，可以分批出货。室内贮藏方式很多，如果栽种1~2亩地，贮藏量1~3吨，则可以用塑料编织袋、蔬菜网袋包装或纸箱、塑料周转箱包装后码放室内。如果有一些特别工具，如贮藏粮食用的圈席，则可以在屋内圈成圆筒状，中间放甘薯，边上填充40厘米厚的麦糠、稻谷壳等隔热层；如果是甘薯经营的经纪人，贮藏规模一般在数百吨左右，常用整屋散堆，较方便实用。
1.基本方法
(1)贮藏室消毒选择需要贮藏甘薯的空余房间，用多菌灵、甲基托布津粉剂加水500倍喷洒地面及墙壁；也可以用生石灰块化水后取上层清液兑水后喷洒，重复使用过的贮藏室消毒还可以用熏蒸的方法，主要有甲醛熏蒸。用甲醛熏蒸方法为：消毒前检查房间的密闭性，关闭门窗，若有缝隙，则应贴上塑料布、报纸或胶带等，以防漏气。以20平方米的房间为例，将500克高锰酸钾和500克水放入容器，并略搅拌，将1升福尔马林倒入容器后迅速撤离并关门。福尔马林具有腐蚀性，操作人员要避免其与皮肤接触。容器中加水主要是起延缓反应的作用，使人安全撤离；如果不在容器中加高锰酸钾和水，也可以将福尔马林装在容器中，但要在3秒钟内完成倒入高锰酸钾和离开容器周围，因为混合后反应放热，可在3~5秒钟内达到沸点，变成剧烈反应，福尔马林挥发成气体的同时，会有少量以液体状向盆外溅射，人员应迅速撤离房间并关门。反应一般持续10~30分钟，甲醛气体能使菌体蛋白质变性凝固和溶解菌体类脂，可以杀灭物体表面和空气中的细菌繁殖体、真菌和病毒，消毒效果较好。房间消毒2天后可打开门窗通气。
(2)贮藏如果采用整屋散堆式贮藏，则要将四周墙壁铺稻草30厘米；地面铺一层红砖，中间留多条3~5厘米宽、通向门口的透气槽。另外，在屋中央用红砖“井”字形堆垒，形成20~30厘米高烟囱式通气道，每个通气道相距1米，并在以后薯块堆放时不断加高。如果采用包装袋、包装箱包装，则不需要垫草铺砖，只要注意袋、箱码堆时留有通气通道就可以了。
薯块装筐后用车运回，堆放时随时剔除破薯、坏薯。薯块先从一角堆起，向上堆高时要在脚踩的地方垫放稻草把，必要时在稻草把上架一跳板。薯块最高可堆1.6~1.7米，薯堆上面起初只散撒少量稻草，以能看得见薯块为宜。
2.贮藏期管理
早期要保持较低的室温(10~18益)，应尽量打开门窗通风，温度过高病菌容易繁殖而发生病害，如果室温在20益以上且时间又长，湿度又较大，就容易引起黑斑病及软腐病，导致造成烂堆。15~20天后，关闭西面及北面门窗，仅留南面门窗通风。寒流到达前，关闭所有门窗，薯堆上覆盖稻草5~10厘米或遮挡一块无纺布，用防止冷凝滴水从屋顶渗入薯堆。由贮藏甘薯一般用楼房下层，大冷天时，薯块上方楼板会因温差产生大量冷凝水，要经常用拖把去除。有条件时，在北边墙外堆放玉米秆保暖，外界温度过低(夜间最低气温在-5益以下，或贮藏室气温降到5益以下时)，可以用小型取暖器适当加温，白天外界气温回升到8益以上时，可微开南面气窗换气，数小时后及时关闭。春天透风时要防止空气温度过低引起烂薯。
室内散堆贮藏方法有以下几方面优点：贮藏量较大，适合规模化生产，一般每间屋可以贮藏5吨左右；由室内比较温暖，薯堆可以随时取用。这种方法较适宜短期贮藏，主要用元旦前后出货。春节前后出货或当种薯保存时，要防止发生黑斑病。
(二)半地下坑式贮藏窖贮藏
半地下坑式贮藏窖又称坑窖、棚窖，通过地下挖坑，地面盖土、地上搭棚来贮藏甘薯，是江苏省丘陵地区比较普遍的一种低投资甘薯贮藏方法。因为坑窖通常建在甘薯地附近，所以运输比较方便；薯块埋在地下可充分利用地温，保温性能较好；管理简单，不需要每天照看；薯块损耗率低，损耗率一般不超过5%~10%(不计失水、掉土等损耗率)。缺点是窖底在雨雪天容易进水；挖坑时土方多，较费工时，主要适合中小型规模的甘薯贮藏。
1.基本方法
(1)挖坑在岗坡地选择避风向阳地势较高的地方，挖深1.5米、宽1.5~2米、长4~6米的长方形坑(类似加宽的战壕)。地势较低端挖一斜坡，用运输时人员或拖拉机进出。坑窖四周要挖沟，用防止渗漏。
(2)贮藏通过周转箱等将薯块运到坑窖底部并倒出，同时每隔1米竖一捆玉米或芝麻秸秆扎成的秸把作为透气孔。薯堆高度应略低地面。坑上用树枝架起，盖上一层高粱秸、稻草、薯藤等遮盖物，以防止太阳直晒引起表层薯块失水或表皮受冻。下雨前要在坑窖上方覆盖薄膜防止薯块淋水。
一般坑窖贮量为1~5吨。每窖可贮藏1~3亩地的薯块。但也有甘薯经纪人使用挖掘机，挖成宽8~10米、长度在15米以上的大型坑窖，这种窖四周加砌砖墙，顶上横架钢梁，加盖油毛毡或防雨板。一般可贮藏200~300吨，投资需要8万~10万元。
2.贮藏期管理
贮藏初期以透气散热为主，不需要另外覆盖。2周后薯块覆盖一层5~10厘米薄土，立冬后气温下降覆土层加厚至10~20厘米，到冬至前后，覆土厚可达到0.6~1米。覆土时应保留2~3个透气孔，并用稻草覆盖。坑窖上方常用木料架成“人”字形屋顶，用高粱秸或稻草等搭成防雨避风的简易棚。也可以在坑窖上方覆盖薄膜，或铺上20~50厘米高粱秸、稻草、薯藤后再覆盖薄膜。下雪后要扫去窖顶及四周积雪，以免雪水浸漏到窖内。
在平原地下水位较高的地区，坑窖深度要浅一点，坑底周边要挖深、宽均为5厘米左右的防渗沟，薯堆可高出地面。
(三)田间就地堆藏
这种贮藏方式又称蒙古包式贮藏，是由安徽省来安县农民根据地瓜的露地贮藏方法演变而来的。因冬天田野空旷，白色薄膜覆盖的薯堆似蒙古包群点缀其间而得名，主要优点是：田间收获仅需剔除破损薯、病薯，操作简单省事；贮藏前薯块不需要长距离运输，减少了相应的机械损伤；前期保管简单，没有场地限制，可以任意选地堆放，因此，可以连薯拐及薯表泥块一起贮藏(薯块表皮泥土会在贮藏期间自然脱落)。
近年来，随着该种贮藏技术的完善，蒙古包式贮藏的安全性得到了保障，目前已成为江苏及安徽沿江丘陵地区进行苏薯8号产业化贮藏的主要方法。
1.基本方法
(1)整床堆薯在收获后的甘薯田中，就近选择地势较高的地段，整平成长方形堆床，将收获薯块在堆床上堆放成1.2~1.6米高的长方形薯堆，堆床宽度为3.5~4.5米(主要使用宽度为8~9米的大棚盖膜，除覆盖整个薯堆外，四周还需向外边延伸1~1.5米，用防止雨水和冷风进入)，堆床长度取决甘薯收获面积及收获产量。一个长6~7米的堆床可贮藏15~20吨鲜薯。薯堆不宜过长，其原因是除了不方便盖土、盖膜等操作外，出薯时每个薯堆必须一次性销售或处理，否则余下部分容易腐烂。如果要贮藏的甘薯量大，则可以做成多个薯堆。如果薯田收获薯块中出现黑皮病、黑斑病、软腐病，应更换堆床地点，选择无病地做堆床。如果薯田地势较低，易积水，则应将堆床填高或运至家前屋后，选择干燥向阳平地做床。如果贮藏期较长，计划在春天销售或做种，则必须将堆床选在向阳面的屋前或向阳斜坡；留种用堆薯过程中，每层可喷洒少量300~1000倍多菌灵或甲基托布津药液，用防腐杀菌。
(2)制作透气孔在堆放薯块过程中，需设置透气孔。
可以将玉米、芝麻秸秆扎成直径15~20厘米的圆捆(俗称秸把)，在开始堆码薯块时，间隔1米竖薯堆中，并用薯块固定住，每个薯堆放置5~6捆，作用原理是利用玉米秆间隙在薯堆中透气、散热、散湿。也可以放置5~6根将毛竹通节、壁上打孔后做成的透气竹筒。透气用的秸把或竹筒末端应略高出薯堆(图7.1)。
2.贮藏期管理
(1)覆盖层的变化根据不同的时期及外界温度，薯堆表面覆盖不同厚度的土层，加上薯藤或稻草，最外面用塑料薄膜覆盖，形成3层隔热保暖层。
在初期外界温度较高时，薯堆表面覆细土3~5厘米，顶部保留20厘米宽的长条形纵向透气槽，纵向透气槽和透气孔一起对薯堆起透气散热作用。平时透气槽上用少量薯藤遮盖，夜间及下雨前盖薄膜防水。白天可将薄膜全部揭去或仅保留北侧覆盖状态。
天气变冷，出现霜冻后，薯堆应覆土8~10厘米，覆盖薯藤或稻草15~20厘米。冬季覆土及盖草时始终要将透气用秸把的端部保留在外，毛竹透气筒则要用薯藤覆盖出口端。
寒流到达前将土层加厚至20厘米，薯堆四周基部要将土层加厚至35厘米以上，纵向透气槽覆盖薯藤或稻草厚度应在50~60厘米。白天是否透气根据温度而定，晴天温度在0益以上需揭膜透气，因为覆盖薄膜后的薯堆在阳光下会形成温室效应，午后温度可比外界高10~20益，薯堆温度经常达到20益时薯块会萌动发芽；寒流后温度较低，透气方式应适当调整，将薯堆两端薄膜掀开一部分，或将薄膜在透气孔处剪开，白天打开，晚上扎紧。在春节前后，随着气温进一步下降，这种贮藏方式的风险性加大，应尽早出货销售。
(2)蒙古包式贮藏注意点
周围及时挖沟：周围开挖排水沟以保证薯堆基部不被水淹。
严防漏水：覆盖用的塑料薄膜不可有划伤或孔洞；下雨、下雪前排气孔开口要用较大的薄膜遮住并扎紧，严防漏水。
一次性出货：与井窖、坑式贮藏一样，在寒冷冬季开窖取薯需一次性取完，不可以分期出货，否则极易腐烂；冬季个别偷盗现象常会导致整个薯堆的腐烂。因此，一旦发现薯堆“进风”，需立即出货销售。
管理要精细：由薯堆温度易受外界影响，因而需要精细管理。有甘薯贮藏经验者用此方法贮藏甘薯的损耗率和风险性较没有甘薯贮藏经验的要低。如果发现薯堆有异味，应立即出货销售。异味主要有霉味和酒味2种：霉味产生的主要原因为甘薯重茬连作，尤其是紫心甘薯等易感染黑斑病的品种，在收获时混入较多带有黑斑病的薯块，或混入较多伤口没有充分干燥硬化的破损薯块，在温度、湿度较高时容易导致病原在整个薯堆中扩散，在25益有黑斑病病源条件下，只要1周时间，黑斑病可以感染整个甘薯薯堆，由黑斑病薯块带有苦腥味且对人畜有害，不可以食用，也不可以作为种薯使用，所以应在薯堆中病害没有完全扩散前尽快销售处理，从而避免损失；产生酒味原因是甘薯在缺氧条件下进行缺氧呼吸而产生酒精中毒，引发烂薯。说明薯堆中温度过高，通气不良，不宜继续贮藏。
虞适宜作为短期甘薯贮藏：春节前后常会有较长时期的冰雪低温天气，会加大长期贮藏的风险。在目前的技术条件下，只有向阳的屋前薯堆及向阳斜坡的薯堆，春天仍能保持5%~10%以下的损耗率。