（1）佛教
十六国时期佛教传至兰州地区，其中占据兰州地区的前赵、后赵、前秦、后秦、西秦、后凉、南凉，北凉的汉、氐、羌、匈奴、鲜卑人等多崇信佛教。西秦乞伏氏在榆中宛川大兴佛教，供养高僧玄高、昙弘、玄绍等为国师，弟子三百多人，讲经、译经。晋隆安三年（399年），汉僧法显与同学自长安至宛川“夏坐”后，继续西行赴天竺（今印度）取经。晋元兴三年（404年），高僧智猛与15名僧人从长安西行，过金城渡过黄河，赴天竺取经。晋元熙二年（420年），沙门僧猛、昙朗等25人经过金城，赴高昌国（在今新疆吐鲁番）。南北朝时，金城人释玄畅在凉州出家，洞晓经律，深入禅要，刘宋时在扬州弘法。金城人释宝志在红泥沟修行，宋、齐、凉时，在建业（今南京）修习禅业，行迹怪异，驰名南朝。北魏时金城赵柔通晓佛教，著有《祇园精舍图偈注解》。唐高祖武德二年（619年），在西秦霸王薛举的王府中敕建庄严寺（故址在兰州日报社），这是见于记载的兰州城区中最早的一所佛寺。唐太宗贞观三年（629年）八月，高僧玄奘从秦州（今天水市）到兰州，住一宿，过黄河渡口，赴天竺取经。贞观九年（635年），高昌国王麹雅泰之子麹文泰朝觐唐太宗西返时过兰州，出资修建了宝塔寺，寺内建一座十三级木塔，故名木塔寺（故址在木塔巷）。贞观中，敕建普照寺（故址在兰园）。唐代，还在今西固区西柳沟建长庆寺、寺儿沟建万寿寺，在榆中县建龙泉寺。武则天执政时，诏令全国建大云寺，兰州当建有大云寺。金代重修过普照寺。元时，在五泉山建皇庆寺，在今榆中县建兴国寺，重修庄严寺、宝塔寺。相传，藏传佛教萨迦派第四代祖师萨班·贡噶坚赞，携侄子八思巴和恰那多吉赴凉州，与蒙古王阔端会谈西藏归顺中央政府时，途经今永登县连城时，建却嘎林寺，即今寺，为藏传佛教传至兰州地区之始。明代，兰州佛教兴盛。修建了新关（今广武门）昙云寺、南关（今中山路）广福寺、东关（今庆阳路）接引寺等寺院，重修了庄严寺等寺院。永乐十六年（1418年），明成祖为连城鲁土司敕建藏传佛教海德寺（在今永登县城）。清朝修建了金山寺、嘛呢寺等寺院，重修了许多寺院。清代白塔寺住持僧归愿戒行甚严，深研佛经，著有《法颠语录》。入民国，有的佛寺进驻文教、商贸、军事单位。
1926年，薛笃弼省长在庄严寺设置民众教育馆。1928年，甘肃省督办刘郁芳在普照寺达雄殿两侧设置中山市场。抗战时期，五泉山进驻第八战区司令部，满山佛寺成为军事禁区。
1939年，日本飞机两次轰炸普照寺，唐代佛寺成为废墟，仅剩金代泰和铁钟1口。但是，佛教社团相继成立，佛学研究颇有成果。1931年，邓隆与僧众诚在普照寺设立甘肃省佛教会。
1941年设立兰州菩提学会。邓隆著有《西夏译妙法莲花经考释补》，译有《密宗四上师传》，编写《甘肃新通志稿·宗教志》。
周应沣著有《金刚经了解》、《心经了解》。
新中国成立后经调查，兰州地区佛教有汉传佛教后藏传佛教两个支系。汉传佛教有曹洞宗和临济宗。普照寺方丈众诚（1879—1939），为曹洞宗传法弟子，对于经、戒、慧、禅工夫深有造诣。1939年守护普照寺藏经阁时，因日本飞机轰炸而殉难。藏传佛教有格鲁派。
1951年，兰州市人民政府调查登记全市有僧侣的佛教寺院，予以保护；市区登记的佛教信徒757人。僧侣“农禅并重”，参加各项生产劳动。1978年****十一届三中全会后，落实宗教政策，全市佛教宗教活动正常开展。至2000年，兰州市共有五泉山浚源寺等35处佛教寺院开放，信教群众约6万人，比丘32人，比丘尼28人，喇嘛31人。
（2）道教
到唐代，道教传到兰州，有玄元皇帝庙，祭祀老聃。宋代崇尚道教，兰州建有玄妙观、城隍庙。金章宗时，兴隆山有秦致通、李致亨修道。元代，兰州盛行道教正一派，建有关帝庙明代，皇室崇信道教。笃信道教的肃王朱楧移藩兰县（今兰州），建金天观，聘请武当山玉虚宫真人孙碧云为主持，讲经论道，严格道教丛林规矩，开起兰州道教之新风。历代肃王好道，自拟道号，诵经炼丹，兴建凝熙观、天齐庙、火祖庙、斗母宫、北斗宫等道观。清雍正十二年（1734年），甘肃巡抚许容因金天观道俗不分，将火居道士逐出，聘请崂山全真嵛山派马榆山人王性尀为住持，整饬丛林规矩，恢复旧观。从此，兰州盛行嵛山派。乾隆四十四年（1779年），全真龙门派道士刘一明结庐金县（今榆中县）栖云山，精研道学，潜心著述，行医募捐，在兴隆山、栖云山修建宫观庙宇。民国时，刘尔炘重修五泉山，新建道教太昊宫、文昌宫、八卦台。1949年，兰州市乾道79人，坤道23人，宫关22处。1951年，兰州市人民政府调查登记道人、宫观、道教团体，取缔反动会道门，保护道教信仰。道教人士在人民代表会议和人民政协中得到安排。
“****”中，兰州道观或改为他用，或拆毁。宗教活动转入地下。1978年****十一届三中全会后，拨乱反正，落实宗教政策，开放宫观。至2000年，兰州市有金天观等道教活动场所42处，信教群众约2万人，全真派乾道35人，坤道28人，正一派道士136人。
（3）******教
明初，******教传到兰州，修建绣河沿清真寺、南关清真寺。明代以来，汉译******教著作出现。清朝前期，阿拉伯和中亚******教的苏菲派传入中国，门宦制度在甘青地区逐步形成，兰州作为省会，为诸多教派门宦落足之地。据张国常《重修皋兰县志》载，光绪十八年（1892年）回族绅士上报，兰州有清真寺6座：一座在城内西南隅（即绣河沿清真寺）、一座在新关小教场（即新关清真寺）、一座在东关（东关清真寺）、一座在西关（即西关清真寺）、一座在拱兰门内（即南关清真寺）、一座在通济门内（即桥门清真寺）。20世纪20年代，现代思想进入******教，将******教与政治、经济、教育结合起来，兰州回民创办了《******教学刊》。河南、陕西、河州等地回民大量迁居兰州，1942年，兰州有清真寺15座，拱北14处，阿訇48人；榆中县有清真寺4座，拱北3处，阿訇6人。
新中国成立后至1956年，兰州市******教的宗教信仰和合法权益受到国家的保护，政府对******教上层人士在政治上做出安排，成为党和政府与******群众联系的桥梁。1957年以后，极“左”思潮逐年高涨，一些爱国守法的阿訇等宗教职业人员受到迫害，至“****”，具有中国古典建筑风格的明清所建绣河沿清真寺、南关清真寺、西关清真寺、桥门清真寺、新关清真寺等被拆毁。1978年****十一届三中全会以后，拨乱反正，落实宗教政策，重建清真寺，******开始正常的宗教生活。至1990年，兰州市共有清真寺79座。现有格的目、西道堂、伊赫瓦尼、赛莱斐耶等四大教派；虎夫耶、哲赫忍耶、嘎的林耶、库布忍耶等四大门宦。各门宦还有支系，其中有创始于兰州的门宦支系，如灵明堂、刘门等。2000年，有宗教活动场所107处，信教群众约10万人，拱北和道堂老人家4人。
（4）天主教
清光绪八年（1882年），兰州天主教徒张子厚贡献通远门外畅家巷一处院落，设为天主堂，为兰州设立天主堂之始。光绪三十一年（1905年），罗马教廷将甘肃教务区分为甘北和甘南二牧区，凉州为甘北总堂，兰州属于甘北牧区，天主教由凉州向兰州发展，徐姓教徒在兰州西乡新城建天主堂一座，宣统元年（1909年）兰州陈官营也建天主堂一座。1919年，英国传教士在平番县（今永登县）红城子建天主堂一座。1922年，罗马教廷派圣言会德国籍司铎濮登博和赵承明来到兰州，从圣母圣心会比利时籍教士手中接管甘肃天主教教务，改甘南和甘北二教区为秦州和兰州二教区。1924年，濮登博任兰州教区主教。1928年，兰州主教驻在地从兰州迁至兰州。1929年，兰州总主教通过天主教会长张子厚及赵天章、李世斋购买小沟头、颜家沟土地90亩，于次年修建教堂，又在畅家巷、底巷子一带购置土地，修建修道院、主教府、宿舍、医院、学校、面粉厂、铁工厂、马厩、葡萄园等，成为西北最大的天主教建筑群。1936年，兰州主教区有大堂18座、分堂点78个、欧洲神甫23人、信徒1075人。1949年，兰州主教区有教堂28座、欧洲神甫26人、中国神甫16人，兰州铎区有信徒3000多人。
1950年10月，中国基督教知名人士吴耀宗等发表《中国基督教在新中国建设中努力等途经》（《“三自”宣言》），全国基督教徒、天主教徒纷纷响应。12月，兰州市的天主教徒、基督教徒举行座谈会，拥护《“三自”宣言》。1951年12月12日，兰州市天主教“三自”革新运动筹备委员会成立，沈鸿章任主任委员，从此，兰州天主教开始摆脱罗马教廷和帝国主义势力的控制，逐步走向自主革新、自办教会的道路。是年，兰州天主教有神职人员148人、教徒1271人。1952年末，外籍传教士陆续自动回国。1953年2月3日，将从事间谍活动的濮登博驱逐出境。是年，兰州天主教爱国会成立，经过“三自”革新，兰州天主教基本实现自治、自养、自传，宗教信仰受到保护，神职人员生活得到保障。1958年，教堂被封闭，次年，天主教总堂被拆除，教堂附属房屋被征用或改建他用。1962年，将小沟头12号院落归还天主教爱国会作为教堂。“****”中，教堂被封闭，宗教用品被毁，天主教爱国会被迫停止活动，神职人员大多被遣送乡下，或遭批斗。宗教活动转入地下。1978年以后，落实宗教信仰政策，开放教堂。1990年，兰州市有天主教徒4000多人。至2000年，有天主教活动场所4处，信教群众5000多人，政府承认的神甫1人，修女2人。
（5）基督教
清光绪十一年（1885年），基督教差会中华内地会将兰州、西宁、宁夏开辟为宣教区，在兰州水北门租张姓房屋25间作福音堂，是为基督教传入兰州之始，后在山子石建福音堂。光绪二十五年（1899年），内地会牧师在皋兰县搭兴营（今属榆中县）设教堂1处。1913年，美国妇女捐款8万元，由内地会于次年在兰州黄河北岸建成医院以其子命名为威廉·博德恩医院（今兰州市第二医院），为兰州市最早的西医医院。1918年，基督教在兰州召开宣教师联合会，将从兰州到河西的广大地区划为内地会的传教区域。1923年，内地会英国籍教士安献今在南稍门外建华英中学。1925年发生“五卅惨案”，英华中学学生与兰州各校学生发表宣言，散发传单，反对日本帝国主义的暴行。1926年，随着大革命的进展，兰州的外籍传教士撤出中国，内地会教会改为兰州中华基督教会，由中国基督教徒掌管。大革命失败后，内地会外籍传教士又返回兰州。抗战时期兰州成为抗日大后方，新教各派差会相继来到兰州，传教发展很快，举办英文礼拜、交际舞会，吸引青年参加，传播基督教文化。1950年末，兰州基督教界学习座谈，纷纷拥护吴耀宗等基督教界知名人士发表的《“三自”宣言》，随后开展自治、自养、自传的“三自革新”。1951年5月26日，成立兰州市“三自革新”运动委员会筹备委员会，各教会陆续不再接受外国津贴，外国传教士及教会工作人员陆续回国。从此，兰州基督教界摆脱外国差会的控制还影响，各教派按各自信仰习惯，开展正常的宗教生活。1956年，兰州基督教有兰州基督教会等4个宗派，修道院一所，教会团体1个，教徒1000多人，牧师等教会人员15人。1958年以后，神职人员大多参加生产自养劳动，5个教会联合礼拜，教会的部分房产被国家征用。1961年以来，宗教问题上“左”的错误受到一定抑制。“****”中，兰州的基督教会遭受冲击，教会和“三自”委员会完全瘫痪，教堂被封闭，房屋被占用和拆毁，教会财产被冻结，宗教人士被批斗，宗教活动转入地下。1978年以后，拨乱反正，落实宗教政策，教会重修恢复。至1990年，受洗信徒达8680人。至1993年，开放教堂2处，聚会点41处。至2000年，兰州有基督教宗教活动场所53处，信教群众约2万人，牧师6人，教士4人。