6月1日库伦活佛通知各国驻京公使称外蒙古为“独立国”中、俄关于蒙事的协商文件，虽已于1913年11月订定，而蒙事会议及勘界之举，却一直没有实行，活佛也没有取消独立。本日驻京英、美、法、德、日各国公使接库伦照会，谓库伦已为独立国，不属中国政府之下。蒙古的君主是哲布尊丹巴呼图克图，也就是佛教的教主。前曾与俄人订立商约，今欲与各国订同等协约，以敦睦谊。请各国委任领事或其他代表，来库伦商订一切，当以俄国商约为先例。照会中还指出蒙古政府前曾两次致书各国，均未得复，本打算派员分赴各国，而蒙员又不谙各国言语，所以深望各国派员前来。末署1914年4月发，各公使得文后，仍拟置不答复。
《东方杂志》发表中国侨民统计数字《东方杂志》第10卷第12号（民国三年六月一日发行）发表了《中国侨民之统数》。其文据概略统计：当时中国国民，持国籍而蕃衍于外者，约540余万人，其中香港307388人，南洋诸岛1360500人，新加坡30万人，暹罗140万人，马来半岛53万人，法属印度19万人，英属缅甸17万人，澳洲14万人，纽芝兰2.5万人，北美合众国90167人，檀香山5000人，西伯利亚50万人，南非虎代坡1.2万人，南美中美13万人，此外散处世界各地者20万人。至于未表明国籍的侨民，则无法统计了。
袁世凯下令实行地方解款中央的税收体制1913年，财政部通令各省划分国税、地方税范围，规定田赋、盐税、关税、厘金、烟酒茶税等为国税，田赋附加地捐及各种杂税为地方税。实行一年以来，各省多把国税项目拨入地方，中央收入反少于以前，财政困难日甚一日。故是日，财政总长周自齐呈请袁世凯下令将国税、地方税名目取消，凡两类收入均应解交各省主管财政官署，以裕财用，而固国本。11日，袁世凯又公布财政厅办事权限条例，规定各省财政厅直隶财政部，凡支配款项及关于一切财政事务均受财政部指挥，遇有重要事件得呈大总统；厅长由大总统任命，综理赋税出纳，催提款项以济中央需要，支配全省经费、办理预算、决算及其他关于财政的事务。至此，北京政府的财政统一体制宣告完成。
湖北省各县设立清乡分所本年5月，湖北省拟定《清乡章程》15条，经袁世凯批准，遂于省设立清乡公所。是日，又开始在全省各县设立清乡分所，负责调查户口，清除匪类。并于汉川、缅阳、潜江、天门、荆门、钟祥、京山、应城、云梦、安陆10县，分区驻扎军队重点清查。规定户族可指名报告或密告，以杜乱党密谋。22日，袁世凯任命范守佑兼充湖北清乡总办。
北京政府设立中国银行广东分行广东纸币充斥，二月间，经官商集议维持办法，设立维持纸币委员会，并拟组织银行，但是款项却无法筹集，而纸币继续下跌。后由广东省官吏向中央筹商此事，并由中央委员至粤调查一切。随后议定在广东设立中国银行分行，委任王芳为行长，经理收回纸币事宜。并向五国银行团商挪用五国借款内整顿盐税款100万镑，约合银1000万两，作为收回广东省纸币用款。是日，该银行开幕。至于收回纸币日期，因挪用之现款未到位，所以未定期开办。
6月2日袁世凯公布《各省所属道区域表》《各省所属道区域表》规定全国共设89道，每道管辖10至20余县。具体的道属情况如下：直隶省置津海道、保定道、大名道、口北道；奉天省置辽沈道、东边道、洮昌道；吉林省置吉长道、滨江道、延吉道、依兰道；黑龙江省置龙江道、黑河道；山东省置济南道、济宁道、东临道、胶东道；河南省置开封道、河北道、河洛道、汝阳道、翼宁道、雁门道、河东道；江苏省置金陵道、沪海道、苏常道、淮扬道、徐海道；安徽省置安庆道、芜湖道、淮泗道；江西省置豫章道、卢陵道、赣南道、浔阳道；福建省置闽海道、厦门道、汀漳道、建安道；浙江省置钱塘道、会稽道、金华道、瓯海道；湖北省置汉江道、襄阳道、荆南道；湖南省置湘江道、衡阳道、武陵道、辰沅道；陕西省置关中道、汉中道、榆林道；甘肃省置阑山道、渭川道、泾原道、宁夏道、西宁道、甘凉道、安肃道；新疆省置迪化道、伊犁道、阿克苏道、喀什葛尔道；四川省置西川道、东川道、建昌道、永宁道、嘉陵道；广东省置粤海道、岭南道、潮循道、高雷道、琼崖道、钦廉道；广西省置南宁道、苍梧道、桂林道、柳江道、田南道、镇南道；云南省置滇中道、蒙自道、普洱道、腾越道；贵州省置黔中道、镇远道、贵西道等。
6月4日朱执信组织反袁斗争失败日前，朱执信于广东吴川、电白、信宜三县秘密组织反袁武装。是日，因消息泄露，广东都督龙济光派军队于黄坡分路围剿，驻广州湾法军亦会同堵截，朱执信败走海上。
藏军占据三十九族地方中英藏事会议，尚无结果，藏军已占据三十九族全部，并欲逼迫川边军队退出昌都，声言已与北京政府议定，以昌都归西藏自治。而边军因未奉政府命令，坚守不退。
6月5日德国驻英大使就西藏问题与英国交涉德国驻英大使李绪诺斯基就中英西姆拉会议事，向英国外交大臣葛雷提出：德国政府认为西藏地区是中国的一部分，因此德国在华所享有之无限制最惠国待遇，现在像过去一样，也适用于西藏。并指出关于蒙古，德国去年11月对俄国也采取了同样立场。
袁世凯公布《官吏犯赃治罪条例》该条例共10条，规定官吏犯枉法赃至500元以上者及卷携公款潜逃至5000元以上者均处死刑；犯枉法赃至1000元以上者处无期徒刑；徒刑得遣赴新疆及极边烟瘴等省。
6月6日《礼拜六》创刊，鸳鸯蝴蝶派在小市民中盛极一时《礼拜六》为小说周刊，由上海中华图书馆印刷发行。该刊主编为王钝根、孙剑秋。1916年4月出满100期后停刊。1922年复刊，至200期终刊。《礼拜六》是20世纪初曾经流行中国文坛的一个文学流派鸳鸯蝴蝶派的代表性刊物，它诞生于这个文学流派的兴盛期，复刊于这个文学流派的中兴期。此刊的编者和主要撰稿人，都是鸳鸯蝴蝶派的知名作家。如：叶圣陶曾以“叶陶”为笔名，发表过《穷愁》等7篇小说；刘半农曾以“半侬”的署名发表过一些译作和创作；后来成为国民党要人的叶楚伧则以“小凤”的署名发表过连载长篇寓言小说《陈大夫移宫记》等等。此刊影响之大，以至于“礼拜六派”后来竟然成了鸳鸯蝴蝶派的别称；当鸳鸯蝴蝶派名声不佳时，它的很多作家仍然乐以这一别称自承。《礼拜六》编者的编辑宗旨和文学观念是把文学的作用归结为游戏、消闲，使文学作品日趋商品化。这种“游戏”的文学观念和作品商业化的倾向，主要反映小市民读者层的精神需求。《礼拜六》的诞生地上海，中国近代商品经济畸形繁荣的最大城市，它拥有的读者，主要是沿海城市中的市民阶层及知识分子。
6月8日袁世凯令成立“陆海军大元帅统率办事处”是日，袁世凯下令将原来总统府的军事处撤销，成立陆海军大元帅统率办事处。统率办事处是最高的军事机关，与文事方面的政事堂并立，一武一文，作为袁世凯独裁统治的左右手。对统率办事处组织章程的拟定，袁世凯的军事顾问坂西利八郎起过重要作用。组织令规定，办事处设办事员，由参谋总长、陆军总长、大元帅特派之高级军官及办事处总务厅长担任。袁世凯任命昌、王土珍、段祺瑞、刘冠雄、萨镇冰、陈宦为办事员，唐在礼为总务厅长，张士钰为副厅长。组织令还规定，办事员轮流在办事处值日，但实际上王士珍担任常务，一切要政都呈袁世凯定夺。办事处设有军政、军令、军械三所，各有主任主持其事。统率办事处的权力十分广泛，凡所讨论的事务涉及外交、内务、财政、交通时，都召该部总长列席，往往当场就作出决定。各部或各省的重要机密事务，也大都呈报办事处。袁世凯的命令、批示，均以大元帅名义发出。
6月10日直隶临榆等县乡民抗捐验契临榆县知事派员下乡，按户查催验契，乡民群起反抗，当场拘押一人，乡民聚众入城，要求释放，并求免税，知事不许，并且派警驱逐，于是乡民更愤，后经活动，全城因而罢市。水年县人民，也因连年荒旱，无力缴税，初推耆老入城请缓，知事不允，接着聚众数十人至县署要求，并击毁公案。行唐县知事催促验契，异常紧迫，乡民入城求缓，知事不见，该乡民遂坚守署门，声称将摘去堂上功德匾额，被县警枪杀10人，击伤五六人。
留美学生在美国发起组织中国科学社。主旨为“传播科学知识，促进实业发展”。该会于次年1月创办《科学杂志》。
6月12日。山东、河南、江苏一带，成立有万佛共和会。该会备有新式外国军械，会中规则颇似义和团。北京政府是日命三省都督严加搜捕，并命相关区域严加防范。
江苏省教育会召开第一次演讲会，介绍德国小学教育、美国农业教育，并由黄炎培报告考察浙江、安徽和江西教育情况。
6月13日。袁世凯令内务部拟订限制古物出口章程。袁世凯申明：中国文化最古，艺术尤精，凡国家所留贻，社会所珍护，非只供考古研究，实关于国粹的保存，近来多有将中国古物采运出口者，似此纷纷售运，漫无考查，若不禁令重申，何以遗传永久？嗣后关于中国古物的售运，应如何区别种类，严密稽查，规定罚例之处，著内务部会同税务处分别核议，呈候施行。并由税务处拟订限制古物出口章程，通饬各海关一体遵照。至保存古物，本是内务部职掌，其京外商民如有嗜利私售情事，尤应严重取缔，并由各地方官实行禁止，以防散佚，而广流传《政府公报》，1914年6月14日。