一个个门徒都画得那样生动，那样细腻（细腻：细致入微）逼真，使观看的人们以为听到了他们的声音，看到了他们的内心深处；他们的心被世间最难解的和最可怕的事给震憾了，一个神要由此罪孽（罪孽：迷信的人认为应受到报应的罪恶）而死去！……
整幅画面层次清晰，以耶稣的话为契机，引起两边人物的激烈反应，戏剧中心由中央向两边展开，然后又从两边向中央集中。
被邀请来的米兰名流们，被画面深深感染了，一时间都缄口无语（缄口无语（jiān）：闭着嘴不说话）了：在最伟大的事物面前，是说不出话的，因为一时间绝对找不出最恰当的字眼来表达自己观感的。
犹大的头还没有画上去，他的因极度恐慌而向后仰的身子也只画了一个轮廓，他的手指现出痉挛（痉挛（luán）：肌肉紧张，不自然地收缩。多由中枢神经系统受到刺敷引起），下意识地紧紧攥（zuàn）住那个钱袋，由于一个仓促的动作，碰翻了盐缸，盐从里面撒了出来。
十一个门徒，每个人的表情、动作和姿态虽不相同，但却都向着一个中心，都向着他们的师父耶稣，只有犹大表现与众人分离；众人向心，他则离心。他被画在光线的暗影里，而耶稣和其他门徒则画在明亮的光线之中，都沐浴在从窗外照射进来的夕阳余晖之中。
在画面的最中央，应该出现耶稣头像的地方，空白着，有着明显擦来擦去的痕迹，那是用海绵去擦木炭素描留下的。耶稣的其它部分已画得相当完整，他坐在中央。被包围在门徒激烈情绪的漩（xuán）涡之中。
这两个没有画出头像的人物，是两个鲜明而又完全相对立的形象，一个是为了追求真理而勇于献身的崇高形象，一个是卖主求荣的叛徒的卑鄙（卑鄙：恶劣：不道德）形象。然而，这两个人物的头像，就这样空白在饥渴的观众眼睛里……
此刻，列奥纳多正在米兰王宫里，他是来找斯福查公爵申请开挖“斯福查运河”经费的。他主持的这个新的工程，将把塞西亚河与提奇诺河连接起来，形成一个新的水网灌溉伦梅里的草地、田园和牧场。
列奥纳多走后不久，一个侍童进来报告：“亚伯度副院长和一批经院博士、教授和学士们求见。”
“请他们进来吧。”公爵略略有些不耐烦，他不喜欢那个大腹便便的亚伯度老修士。
一通称颂公爵的客套过后，亚伯度副院长说他代表玛利亚修道院全体修士和信徒，代表全体热爱米兰的民众、并代表所有各行各业社会权威人士，恳请公爵降旨限期列奥纳多速速将《圣餐》画完。
列奥纳多被侍童从伯爵夫人那里叫了来。
公爵温和地：“列奥纳多先生，有人在告你的状了，你当真是三四天一笔不动，而坐在膳堂里发呆么？”
“是的，我常常怀疑我自己画的每一处，而且怀疑自己有没有能力画出耶稣和犹大的头像来。”
“什么，你常常怀疑自己？”公爵问。
“是的，一个画家对自己没有怀疑，其成果也就渺（miǎo）小。你的作品若是比你自己估量的还高，那是你的幸事；若是正和你估量的相差不多，那你就该不幸了；若是比你估量的还要低些，那你就大大倒霉了——这时你画的，肯定是失败的平庸之作了。”
亚伯度的胖脸颤了起来：“公爵，他这是在为自己狡辩！他真的是在怀疑自己么？谁都看得出，就他已经画完的信徒和背景还有膳堂，已经是世界上最杰出的，顶顶杰出的图画，除了他，没有任何人能画得出来。可他呢，用了8年多的时间，他就是不去画完！如果他能像我修道院种菜的园丁那样勤奋，就算是一个小时画上一笔，《圣餐》也早就画完啦！”
公爵又转向列奥纳多：“你为什么不能像种菜的园丁一样勤奋呢？”
列奥纳多：“有才能的人，常常在一般人看来无所事事的时候，头脑里却出现了丰硕（丰硕：又多又大）的思想成果。就拿《最后的晚餐》来说，我之所以这么久不能完成，皆因我的头脑中还没有形成最理想的两个头像：一个是救世主的，世上无从寻觅，而我在默想静观中，一直未能想象得出他所应该具有怎样完美无瑕的容颜；另外还缺一个犹大的头，也得煞（shà）费苦心。我只能在赌徒恶棍和下流痞子中间继续寻觅（mì），不过，万一找不到，还有一个办法——”
说到这里，他斜了亚伯度一眼：“我倒想借用这位副院长的头来画犹大！”
“哈哈哈哈！哈哈哈哈……”
全屋的人都忍不住大笑起来，公爵笑得直流眼泪。亚伯度被戏弄得又恼又羞，没向公爵告辞就悻（xìnɡ）悻地走了。从此，他再也不敢催促列奥纳多加速画画了，他当真怕画家把他的头画到犹大的位置上去。
后来，犹大的脑袋终于画好了，他的脸色是阴暗的，而其他门徒的面孔则被明媚的阳光照耀着。他的手紧握着钱包，紧张地等待着出卖的时刻。由于一个仓促的动作，他的手还碰翻了桌上的盐缸，盐从缸里倾泻出来。达·芬奇曾经说过：“灵魂应该通过手势和动作来体现。”犹大的动作充分暴露了他的内心有不可告人的秘密。
这幅留名后世的巨作完成后一年，就差点遭受了灭顶之灾。
那是1499年，也就是达·芬奇在米兰广场上的巨型塑像被毁掉的那一年，法国人在攻城期间，城里的运河被人挖开了，河水泛滥起来。有个人跑到达·芬奇的住处，大声说道：
“达‘芬奇先生，不得了了，教堂也被水淹了，您快去看看您那幅画怎么样了。”
“我没功夫去，再说，图画在墙壁上，水不会淹那么高吧？”达·芬奇不紧不慢地回答。
那人只好回去了，他刚走，达·芬奇就急忙赶到教堂餐厅，看他的那幅耗费了多年心血的画。
教堂餐厅里存有一些积水，有潮湿的气味，一个工作人员告诉他，水曾涨到好几公分高。达·芬奇走到墙边，看见图画的颜色还是完全鲜明的。这种颜料跟其他画家的不同，是他自己发明的一种颜料，这种颜料的缺点是在潮湿的地方不能持久。他拿出放大镜，仔细地审察画面。忽然，他发现底下有一条小小的裂缝，再过去一点，又生了一片霉斑，像白霜一样。
达·芬奇的心情一下子沉重起来，看来，《最后的晚餐》的命运是确定了，这些颜料大概还可以支撑四五十年，这里的潮湿正在逐步侵蚀（侵蚀（shí）：逐渐侵害使变坏）他的最伟大的作品。
巨型塑像毁掉了，《最后的晚餐》也不能保存下去，达·芬奇觉得自己所干的一切都是一场空，他托着沉重的步子回家去了。离开餐厅之前，他最后看了一眼《最后的晚餐》，他忽然感到自己是多么舍不得离开它。
10月底的一天，他被请到宫廷。米兰的新统治者法兰西国王召见他，授予他大建筑师称号。他没有接受聘（pìn）书，说过几天再答复尊敬的路易十六陛下。从王宫出来，快走近家里的时候，远远看到许多人聚在门外。他加快了脚步，一种不祥的预感使他一步步紧张起来，就在这时，他的弟子乔万尼、马柯、安德列和恺（kǎi）撒，几个人抬着一扇破损的大飞翼——飞翼上面躺着一个血肉模糊的人。列奥纳多不用看也知道，伤者肯定是他的助手亚斯特罗。亚斯特罗是一个异常灵巧的铁匠、机械匠。他跟随列奥纳多整整十七个年头了，他亲手参与制造过两个飞行机器，两次失败；两年前开始制造的这个飞行器，他总想试飞，多次得不到列奥纳多的允许，今天他在几个师兄弟的协助下，偷偷将飞行机器抬到城外试飞。这个飞行器已由蝙蝠形状改为燕子形状，无论是翅膀，还是尾舵都比以前的完美精巧多了。亚斯特罗将自己的双臂和躯干紧紧捆在机器上，站在高高的教堂屋顶，高喊：“上帝会派使者来保护我的！他们会用手托着我，我是上帝的儿子，是完全可以驾着伟大的列奥纳多飞行机器飞起来的！”他在屋顶上助跑几步，猛地向前一跃，他飞了起来，翼翅上下呼扇了几下，只扇动了几下就从半空中坠落了下来。若不是飞行器的一扇翅膀挂在树枝上，他肯定没命了。
列奥纳多赶紧走到铁匠亚斯特罗身边，万分沉痛地查看他的伤情，半天说不出一句话。
亚斯特罗醒了过来，睁着那只早年就瞎了的独眼，轻轻说：“对不起你，师父！”
亚斯特罗的脖子摔断了，从此一直瘫痪（瘫痪（tān）：由于神经机能障碍，身体一部分完全或不完全丧失运动能力）到死。
“是我的过错！”列奥纳多痛苦地想，“我用我的幻想和设计，引诱了这样一个小人物，迷惑了他……”
从此，列奥纳多无论走到哪里，都将这个瘫痪的铁匠带到哪里；为了避免以后制造飞行器再犯错误，列奥纳多否定了自己过去的一切设计，开始依照波浪和水流的机械学，研究风力和气流的机械学，设计新的飞行器；图纸画了几十张，结构越来越趋合理、美观、轻巧。可是，在他的有生之年，没有能够再制造出一架新的机器来，他从小就萌生的飞行愿望，只有留在一张张完美无缺的图纸上了。
不久，斯福查公爵带领外国雇佣军来反攻米兰城，列奥纳多的住处被炮弹炸坍，他只好带着几个徒弟到威尼斯避难，又去了罗曼尼、曼托瓦、罗马，还碰到了传染病。漫长的旅途正不知何年何月才能结束之时，佛罗伦萨新上任的大执政官彼罗·索德里尼，派专使向列奥纳多送去聘请书，授予他佛罗伦萨“军事工程师”的头衔。
战乱使他疲惫不堪，一件件不幸的遭遇使他身心交瘁（cuì），在结束了颠沛流离（颠沛流离（pèi）：生活艰难，四处流浪）的生活回到家乡后，绘画情绪锐减，一天天变得懒散起来，什么大事也不想做，每天像做游戏一样研究起自动旋转烤肉机、制碱法等等小玩艺来度时光。
每当听到隔壁传来亚斯特罗一声声呻吟，他就会无限伤感，过去的一切失败又来折磨他：《巨像》的毁灭，《最后的晚餐》将要消失，飞行器的倾跌……
一天，达·芬奇接到佛罗伦萨著名银行家佐贡多的邀请，到他家为他的夫人画像。
佐贡多先生年约45岁，人看上去很有精神，一个亮光光的秃顶。他礼貌地接待了达·芬奇，然后叫他的夫人蒙娜·丽莎出来和画家见面。
当美丽的夫人走进客厅时，连见多识广的达·芬奇也暗暗吃了一惊。她穿一件华美的连衣裙，卷曲的长发披散在双肩，有一种清水出芙（fú）蓉的韵味。她的脖子上、手上挂着一些贵重的宝石，显得雍（yōnɡ）容华贵。她腼腆（腼腆（miǎn tiǎn）：因怕生或害羞而神情不自然）地向画家走来，报以礼节性的微笑，这一瞬间被达·芬奇捕捉到了，这种微笑正是他一直在寻找的微笑。
“以后请您到这里来为她画像吧！”银行家说道。他已经结过三次婚，前两位夫人都在婚后不久去世了，第三次才娶了丽莎小姐，比他小十多岁，他一直以年轻的美妻为荣。
“我可以为她画像，但不能在这里。要画肖像，必须有专门的画室，还是到我的画室去吧。”达·芬奇说道。
从此，蒙娜·丽莎常常和一个女仆来到达·芬奇的画室，让他画肖像。为了避免她在画像时感觉无聊（liáo），达·芬奇请来乐师、歌手、说书人和小丑到画室来，为她表演；同时，也可以使笑意能长久地保持在脸上。
达·芬奇细致而耐心地画着，3年过去了，还没有画完。到了后来，达·芬奇和蒙娜·丽莎之间似乎有了一种微妙的联系，她的脸上最微细的变化，都逃不过达·芬奇的眼睛。
达·芬奇对丽莎夫人产生了一种特别的爱恋，这种爱，既不是当时流行的柏拉图式的精神恋爱，也不是生活中常见的那种男女之爱。他已经50岁出头了，在这之前，他从未对一个女人产生恋爱的感觉，他的全部精力都投入到科学和艺术当中。
达·芬奇看出来了，丽莎夫人不仅想成为他的肖像画上的主人公，还想成为他生活中的朋友。但她已经是别人的妻子了，而自己的年龄又比她大许多。他克制着自己的感情，仅仅以一个画师的身份出现在她面前。
这时候达·芬奇接到宫廷里传来的一个通知，让他离开佛罗伦萨，去管理一个正在紧张修建的运河。这是一件十分重要的事，必须很快出发。达·芬奇知道自己将要暂（zàn）时离开丽莎夫人，心情很不平静，明天就是最后一次为丽莎夫人画像了，他觉得自己竞有些舍不得离开她了。
第二天是个画像的好天气，这天，丽莎夫人准时来到画室。但和往常不一样的是，这次她是单独一个人来，没有带女仆，她那明亮的眼睛，此时像有一丝水雾在幽（yōu）幽地飘着。
画室中只有他们两人。
达·芬奇认真地画着，丽莎夫人带着微笑，直盯着他的眼睛，这也是以前没有过的。突然，他发现丽莎夫人脸上闪过一种奇异的阴影，就好象一个人在镜面上吹气所留下的痕迹一般。他停下来，问道：
“怎么啦？”
她不做声。很久才反问：“您要到运河上去，明天动身吗？”
“不，今天夜里就得走。”
“噢，我马上也要离开这里了。”她说。
达·芬奇看着她的眼睛，明白了，她之所以要离开佛罗伦萨，是因为知道了他要离开。
“佐贡多先生为了一件生意上的事情，要到外地去住三个月，我让他带我去，秋天才回来。”她解释说。
“好吧，”达·芬奇放下画笔，说道：“三个月后，我再来画。”
“不，经过三个月，我也许完全改变了，甚至您都会认不得我了。您说过，人的面貌，尤其是女人的面貌，改变得很快。所以，您不如今天就完成这幅肖像。”