端午在古人心目中是毒日、恶日，在民间信仰中这个思想被传了下来，所以才有种种求平安、禳解灾异的习俗。
其实，这是由于夏季天气燥热，人易生病，瘟疫也易流行。在加上蛇虫繁殖，易咬伤人，所以要十分小心，这才形成此习惯。种种节俗，如采药，以雄黄酒洒墙壁门窗，饮蒲酒等，看似迷信，但又是有益于身体健康的卫生活动。
人们在端午节这一天洒扫庭院，挂艾枝，悬菖蒲，洒雄黄水，饮雄黄酒，激浊除腐，杀菌防病。这些活动反映了中华民族的优良传统。
（一）采药习俗
在我国古代，人们疗疾大多靠民间的验方，老百姓也大多能识好些草药。因此每到端午节时，人们便采集各种各样的草药，以备不时之需。
采药，是最古老的端午节俗之一。采药是因端午前后草药茎叶成熟，药性好，才于此日形成此俗。
《夏小正》记载：“此日蓄药，以蠲除毒气。”《岁时广记》卷“采杂药”引《荆楚岁时记》佚文：“五月五日，竞采杂药，可治百病。”后魏《齐民要术·杂记》中，有五月捉蛤蟆的记载，亦是制药用。人们还常以癞蛤蟆的唾沫，煎汤过午给小儿洗澡，据说可以减轻痘疮的发病。
在不少地区均有端午捉蛤蟆之俗，如江苏在端午日收蛤蟆，刺取其沫，制作中药蟾酥。
杭州人还给小孩子吃蛤蟆，说是可以消火清凉、夏无疮疖。还有在五日于蛤蟆口中塞墨锭，悬挂起来晾干，即成蛤蟆锭，涂于脓疮上可使消散。这种捉蛤蟆制药之俗，源于汉代“蟾蜍辟兵”的传说。
五月捉取蟾蜍的习俗，文献上所见甚早。《淮南子》写道：“鼓造辟兵，寿尽五月之望”。“鼓造”即蟾蜍。也就是说，汉代人捕捉蟾蜍，为的还不是蟾蜍，而是为“辟兵”，蟾蜍何以辟兵，这与古人的信仰有关。
汉人张衡在《灵宪》曾交代月宫中这只蟾蜍的来历：“羿请不死药于西王母，嫦娥窃之以奔月……嫦娥遂托身于月，是为蟾蜍”。
由于蟾蜍被编入嫦娥传说，于是也和不死灵丹挂上了钩。《抱朴子·内篇》介绍不死灵药有五种，称“五芝”，其中“肉芝”就是“万岁蟾蜍”。
方术家所传说的五种神芝，色彩各不相同，服之可以长生不死。在《神农本草经》中，记载的五芝为：“赤芝名丹芝，黄芝名金芝，白芝名玉芝，黑芝名玄芝，紫芝名木芝。”
据说万岁蟾蜍的神奇，来自头上的角，即肉芝，药力在灵芝以上，是长生不老的仙药。不仅“服之长生”，而且神奇非常：“蟾蜍万岁者，头上有角，颔有丹书8字，五月五日午时取之阴干，百日，以其足划地，即为流水。能辟五兵，若敌人射己者，弓矢皆反还自向也。”这就是《淮南子》讲到的蟾蜍辟兵的来历。
在江南的许多地方，在端午节时有采药、驱狼等传统。俗话说：“五月端午草，百样都是药”，“端午节前都是草，端午来到都是药”。
于是，民间有在端午节这天上山采集地椒、野茶、苣苣、蒲公英、匾蓄、刺蓟等药材，以备单方土法治病之用。
湖南湘中一带，在端午日偏重于采集久明光、天泡草、苦瓜叶、马齿苋、蒲公英、苦秣菜、金银花等，以便暑天备用。前三种是洗药，能防疮疖及痱子；后几种是吃药，能防痢、消炎、清肺热。
从前，在一些人烟稀少的地方，常有恶狼出没，小孩及家禽被狼叼走的灾祸时有发生。传说，每逢端午这天狼儿子出天花，死亡率高，成活率低，这样狼就难以大量繁衍。人们也乘狼之危，于端午这天，塞封狼窝，烟熏驱狼，以保人畜平安。
（二）沐兰汤习俗
沐兰汤是端午节的一种卫生习俗。一身着汉服的女性端着一盆艾叶水，人们排好队依次走到主祭面前，主祭用菖蒲草沾盆里的水，在参加活动的人双手、额头、脖颈轻轻拂拭一下，以示驱除晦气。
端午日洗浴兰汤，是《大戴礼》中记载的古俗。当时的兰不是现在的兰花，而是菊科的佩兰，有香气，可煎水沐浴。
《九歌·云中君》亦有“浴兰汤会沭芳”之句。《荆楚岁时记》写道：“五月五日，谓之浴兰节。”《五杂俎》记明代人因为“兰汤不可得，则以午时取五色草拂而浴之”。
后来，一般是煎蒲、艾等香草洗澡。在广东，则用艾、蒲、凤仙、白玉兰等花草；在湖南、广西等地，则用柏叶、大风根、艾、蒲、桃叶等煮成药水洗浴。不论男女老幼，全家都洗，此俗至今尚存，据说可治皮肤病、去邪气。
（三）采茶制茶习俗
在北方一些地区，人们喜于端午采嫩树叶、野菜叶蒸晾，制成茶叶。
在广东潮州一带，人们去郊外山野采草药，熬凉茶喝。这对健康也很有好处。
流行于山西古县松阳民间的传统保健茶饮，其源上溯于春秋战国时期，因每逢端午佳节，百姓上山采选百草，晾匿家中常年备饮，以防病健身、美容养颜、防暑解渴、辟秽驱邪而得名。
雄黄酒性剧热，所以饮雄黄酒后必然燥热难当，须喝浓茶以解之。一般人口较多的家庭，总是泡一茶缸浓茶供家人饮用。
旧时，绍兴号称锡半城，锡箔工人多达数万。端午节中午，箔坊主必置五黄酒宴请工人，下午例行休息。锡箔师傅多善饮酒，往往雄黄酒喝得酩酊大醉。主人照例泡有浓茶供他们解醉，端午茶由此而成为不可缺少的“时令茶”，相沿成习。
端午习俗虽然显得落后和原始，甚至还带有一些迷信色彩，但却反映出古人在特定的历史条件下的民间智慧，很大程度上有益于人们的身体健康，其朴素的卫生防疫意识值得现代人学习。
因此，可以说端午节是我国最早的“卫生防疫节”。