当现代物理学的一些概念与经典物理学发生冲突时，德国物理学界的保守势力和亲纳粹分子，无形中接受和应用了纳粹的理论宣传，而将这种学术上的冲突归并为政治和民族观念上的冲突。1905年诺贝尔物理学奖获得者勒纳和1919年诺贝尔物理学奖获得者斯塔克，从20年代起就致力于所谓“日耳曼物理学”的研究和分类，企图为经典物理学找到“日耳曼血统”。勒纳攻击相对论为“犹太人的诡计”，斯塔克宣称量子力学是“徒劳的形式主义”。他们不断地晋见包括希特勒在内的纳粹高级领导人，并在纳粹主管宣传的罗森堡的支持下，不断地在报纸和杂志上发表文章，攻击爱因斯坦、普朗克、索末菲、海森堡和他们的学说，企图将自己的“日耳曼物理学”强加于德国社会。
反对现代物理学运动，不仅损伤了德国的物理学教学和研究，也阻碍了包括军事当局在内的很多人对核能的认识和兴趣。博特所在的海德堡是勒纳“日耳曼物理学”的根据地，尽管它有很好的实验设备和研究人员。但是，海德堡小组于1942年在测量中子在石墨中扩散长度的实验中出现了致命的错误，实验再也没有被重复。博特的几位朋友曾希望建造一台研究原子弹最有力的工具——回旋加速器。考虑到教育部长鲁斯特反对现代科学特别是抽象科学和核研究的态度以及海德堡的现状，博特在很长一段时间内都没有勇气正式提出申请，当时德国全国只有一台回旋加速器，直到战争快要结束时，才在海德堡的医学研究所里开始运转。