免疫系统就好像一道防护墙，能够保护人体不受外界细菌病毒的侵害，免疫力一旦下降，人体就很容易受到外来病菌的侵袭，进而影响到内分泌和神经系统的正常运作，失眠、内分泌紊乱等一系列问题也就接踵而至了。
医学家和营养学家认为，新鲜的水果、蔬菜及果蔬汁中富含多种维生素、矿物质、微量元素、叶绿素、低聚糖等活性成分，能够有效保护人体的免疫系统。由于断食者在断食期间除了水果蔬菜以外几乎不进食其他类食物，自然使得免疫力和抗病力得到了增强。
另外，研究人员发现，断食后免疫系统中的白细胞会增加。我们都知道，白细胞是免疫系统中的主要“战士”，白细胞数量的增加也就意味着免疫力的提高。当病菌侵入到人体后，会经历这样几个过程：白细胞会前来阻止，消灭病菌，如果难以抵抗，身体内的巨噬细胞也会发挥作用。颈部的淋巴结则是最后一道防线，如果淋巴系统也被突破，病菌就会肆无忌惮进入血液，当然，脾脏、肝脏等和其他器官里的吞噬细胞也会来消灭病菌，如果再遭到破坏，那就真的是回天乏术，药石无灵了。很多晚期癌症患者便是如此，身体机能已经无法再发挥效用。因此，白细胞作为免疫系统中的主要战士，也是第一道防线，其数量的增长是断食提高免疫力最直接有力的证明。日本一家建筑公司深谙此道，每年都会为职工提供两次断食机会，借此增强员工身体免疫力。