在确定肥胖后应鉴别是单纯性肥胖或者是继发性肥胖。继发性肥胖有其原发病的临床表现。例如甲状腺功能减退症患者有特殊外貌；多囊卵巢综合征有多毛和男性化。库欣综合征患者其肥胖呈向心性肥胖，并同时有满月面、高血压、痤疮、皮肤紫纹等临床表现。
（1）肥胖与过体重。肥胖是指由于脂肪在体内合成增加导致体重增加，而过体重是指由于肌肉组织的增加所引起的体重增加，如举重运动员、拳击运动员等大都为过体重，并非是脂肪过剩，皮下脂肪厚度并未增加，且无病态表现。
（2）皮质醇增多症肥胖。早期轻症的皮质醇增多症与单纯性肥胖极为相似，其区别点主要是肥胖的向心性非均衡性分布的特征和副性征的表现，皮肤紫纹较粗且颜色较深。血皮质醇测定有助于鉴别。
（3）水、钠潴留性肥胖。本病的特征是以水、钠潴留为主要病理表现，故肥胖具有水湿下注的特性，主要分布在腿部、臀部、腹部，且傍晚或劳累后可呈现明显的下肢浮肿；休息或平卧后减轻，与单纯性肥胖有异。该病以中年及更年期妇女较为多见，男性较少，也可供鉴别。