卦山共有三泉：龙泉（又称龙池泉）、浆水泉、灵泉（又称石髓、漱石寒泉）。浆水泉位置在卦山书院南侧山崖下；龙泉在天宁寺中院西北角，即千手观音殿西侧；灵泉在石佛堂西侧山崖下（清康熙四十八年《交城县志·地理》：“灵泉：在石佛堂西岩下石坎中，有本府李环洲诗。”）。浆水泉水量较大，龙泉次之，二泉冬不结冰，终年长流。灵泉海拔最高，为间歇泉。关于这三眼泉水，古来传说很多，乡间百姓认为是“琼浆玉液”“神水”，饮来甘洌爽口，登山者均以饮用为快。五月端午庙会时，老年人大多要儿孙们喝上一口，说是“一年不会肚疼”。
龙泉传说池泉中有四龙：东有青龙，南有赤龙，西有白龙，北有黑龙。雨前，四龙争斗，可“听到池泉中隆隆作响”。又白龙为河神，雨后应由白龙值宿，以免河水泛滥。明隆庆年间交城县教谕谷嘉谋（字槐庵，北直晋州人）有“亭岗松柏飞鸣凤，神井风雷起卧龙”诗句，其后一句即指龙泉。
清乾隆间董柴（字也愚，山西介休县人）游卦山，有《龙池泉》《石髓》六句律二首咏泉诗：
龙池泉
石窦泄方池，
声清如语筑。
石窟殊难穷，
幽深隐隈隩（wēiyù）。
山中云雨收，
应来白龙宿。
石髓
滴沥响空山，
石壁见寒溜。
清冷涤尘烦，
襟怀顿非旧。
莫言一勺多，
时足供枕潄。