板蓝根在临床上清热凉血、抗病毒抗菌作用明显，用量大，堪称中成药之最。1988年，上海甲肝大流行，板蓝根是当时治病防病抗病毒的首选药物。时隔15年后的2003年非典暴发，板蓝根再次被当作是防病治病的首选药。
《本草便读》：板蓝根即靛青根，其功用性味与靛青叶同，能入肝胃血分，不过清热、解毒、辟疫、杀虫四者而已。但叶主散，根主降，此又同中之异耳。
根是用两种分别名为菘蓝和草大青的根干燥以后做成的。这种植物的叶称“大青叶”。由其鲜叶加工制得的深蓝色粉末为青黛。根、叶、粉三者均为常用中药，药性类同，具有清热解毒、凉血消斑之功效。
板蓝根是十字花科菘蓝属2年生植物菘蓝的根茎部分，其叶又称大青叶，同属清热解毒药。板蓝根含有多种氨基酸、谷甾醇、靛青、靛玉红等多种药用成分，具有清热解毒、凉血化斑之功效，对多种细菌性、病毒性疾病如流感、流脑、腮腺炎、钧端螺旋体病、肺炎、肝炎等有良好的预防和治疗效果。
板蓝根含多种抑菌成分，有清热解毒等功效，对感冒、流感、腮腺炎、红眼病、麻疹等常见病，有较好的预防和治疗作用。1988年，上海甲肝大流行，板蓝根是当时治病防病抗病毒的首选药物。时隔15年后的2003年非典暴发，板蓝根再次被当作是防病治病的首选药。
板蓝根的作用大体归纳如下：
一、抗菌抗病毒作用：菘蓝根对多种细菌有作用。水浸液对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌，八联球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤寒甲杆菌、痢疾（志贺氏、弗氏）杆菌、肠炎杆菌等都有抑制作用；丙酮浸出液也有类似作用，且对溶血性链球菌有效（皆用琼脂小孔平板法）。对A型脑膜炎球菌之抑菌作用与大蒜、金银花相似。板蓝根、大青叶抗菌、抗病毒的有效成分，有人认为是靛甙。实验证明，靛甙在体内外皆无抗菌作用；体外抗病毒作用亦不突出；在体内排泄又快，故认为它无明显生理和抗菌的活性作用。其有效成分尚待研究。
二、解毒作用：据报道，犬用板蓝根、黄连粉与藜芦同服（各2.0g/kg），能解藜芦毒，降低死亡率；若藜芦中毒后再用之，则无效；分别单用板蓝根粉或黄连粉，效果亦不好。
三、提高免疫功能：小鼠腹腔注射板蓝根多糖50mg/kg，可显著促进小鼠免疫功能，表现为：能显著增加正常小鼠脾重。白细胞总数及淋巴细胞数，对氢化可的松所致免疫功能抑制小鼠脾指数、白细胞总数和淋巴细胞数的降低有明显对抗作用；显著增强二硝基氯苯所致正常及环磷酰胺所致免疫抑制小鼠的迟发型过敏反应；增强正常小鼠外周血淋巴细胞ANAE阳性百分率，并明显对抗氢化可的松所致的免疫抑制作用；但板蓝根多糖体外实验对刀豆素A诱导的小鼠脾细胞淋转反应无明显增强作用。此外，板蓝根多糖还能明显增强抗体形成细胞功能，增强小鼠静脉注射碳粒廓清速率。
板蓝根在临床上清热凉血、抗病毒抗菌作用明显，用量大，堪称中成药之最。研究结果表明，板蓝根具有显著的清除体内能引起体温升高的热原作用，并已分离得到这种活性物质。板蓝根的退烧作用即是通过杀灭体内的病毒细菌等病原体、清除引起发烧的过氧自由基和热原等因素而实现的。在低烧的情况下，服用板蓝根等中成药，不但能够有效的退烧，同时，还能够促进身体的康复和免疫力抵抗力的增强。早期应用，同时配合对症处理，可大大提高治疗效果。据190例的观察，治愈率在90%以上。绝大多数病例于3天内退热：临床症状除特别严重者外，通常均能在退热后即消失；少数有后遗症，均系疾病过程中持续高热、严重昏迷和抽搐的病例。
从药理学上讲，板蓝根的毒副作用很小，而且因为它是“解毒”药，所以容易被人误认为是无毒的。其实，板蓝根虽然副作用较小，但服法、用量也必须严格遵照包装上的药品说明，盲目滥用起不了防病保健作用。特别是如果长时间大剂量使用板蓝根，在肝脏的解毒能力下降时，就会引起蓄积中毒。出现消化系统和造血系统损害，如上消化道出血、白细胞减少等。这种情况在小儿更为易见，原因是他们的肝脏功能不完善，解毒酶量不足，而且用药剂量不好掌握。出现毒副作用时，应立即停药，急送医院治疗。此外，板蓝根对防治风热性感冒等确有一定作用，但对风寒等其他类型感冒则不一定适合。人在健康状态下过多服用板蓝根，会伤及脾胃。极少数有过敏史者，不要轻易服用。至于感冒症状严重的发热病人，则必须尽快到医院就诊。