预防药物-营养物质相互作用的最好方法是教育患儿的看护人，给孩子用药一定要通过药房获得他们所要的药物，一旦发现药物-营养物质的相互作用，应引起注意，如可以改变给药时间，或检查血药浓度或改变药物治疗方案。处理药物吸收问题的办法是将药物与食物最大限度地分开，食物应在药物治疗前后2小时给予。也可以选择合适的剂型，使药物免受胃内pH值影响。例如：奥美拉唑为高度酸性不稳定药物，为肠衣包裹颗粒的胶囊剂，可以保护药物免遭胃酸的溶解，到肠道碱性条件下被吸收。服药前破坏胶囊溶解在液体中，可导致药物在胃内酸性条件下降解。不能吞咽完整胶囊的患儿可选择制备碱性碳酸钠混悬液缓冲胃内容物，以备药物顺利穿过肠道；也可打开胶囊，洒在食物上。
