随着环境的恶化，污水废水的处理问题早已迫在眉睫。传统的污水处理方法成本高，并常常导致有二次污染问题。而沼泽是天然的污水处理器。
沼泽中有很多能够净化水质的植物。沼泽中还有许多挺水、浮水和沉水植物，这些植物能够在其组织中富集金属及一些有害物质，参与解毒过程，对污染物质进行吸收、代谢、分解，起到消除环境污染的作用。具体说来，沼泽湿地像一个天然的过滤器，有助于减缓水流的速度，当含有毒物和杂质（农药、生活污水和工业排放物）的流水经过湿地时，流速减慢有利于毒物和杂质的沉淀；一些湿地植物能有效地吸收水中的有毒物质，从而净化水质，污水得以处理。
因为沼泽湿地能够分解、净化环境物，起到“排毒”、“解毒”的功能，因此被人们喻为“地球肾脏”。假如没有了湿地，好比一个人被割去了肾脏，地球将不可能存在。如氮、磷、钾及其他一些有机物质，通过生物体复杂的物理、化学变化并贮存起来，或者通过生物的转移（如收割植物、捕鱼等）等途径，永久地脱离湿地，参与到更大范围的循环中去。
据测定，在湿地植物组织内富集的重金属浓度比周围水中的浓度高出10万倍以上。正因为如此，人们常常利用湿地植物的这一特殊的生态功能来净化污染物中的毒物，有效地清除了污水中的“毒素”，达到净化水质的目的。如水葫莲、香蒲和芦苇等被广泛地用来处理污水，用来吸收污水中浓度很高的重金属镉、铜、锌等。在美国的佛罗里达州，有人作了如下试验，将废水排入河流之前，先让它流经一片柏树沼泽地（湿地中的一种），结果发现，废水中大约有98%的氮和97%的磷不见了，湿地惊人的清除污染物的能力令人惊叹不已。在印度的卡尔库塔市，城内专门设有一座污水处理场，所有生活污水都排入到那里，其污水处理费用相当低，成为世界性的典范。