生态学的研究对象范围很广，小到个体的分子，大到整个生物圈，都在生态学研究的范围之内。
广阔的研究范围，加上研究对象的复杂性，使生态学发展成为一个庞大的科学体系。根据其研究对象的组织水平、类群、生境以及研究性质，可将其划分如下：
①根据研究对象的组织水平划分
生物的组织层次可以从分子到生物圈，与此相应，生态学也分化出分子生态学、个体生态学或生理生态学、种群生态学、群落生态学、生态系统生态学、景观生态学与全球生态学。
②根据研究对象的分类群划分
生态学起源于生物学，生物学的一些特定类群（如植物、动物、微生物）以及上述各大类群中的小类群，甚至每一个种都可以从生态学角度进行研究。因此，可分出植物生态学、动物生态学、微生物生态学、哺乳动物生态学、昆虫生态学以及各个主要物种的生态学。
③根据研究对象的生境类别划分
根据研究对象的生境类别划分为陆地生态学、海洋生态学、淡水生态学、岛屿生态学等。
④根据研究性质划分
根据研究性质划分为理论生态学与应用生态学。涉及各部门的应用，如农业生态学、森林生态学、草地生态学、家畜生态学、城市生态学、保育生态学、恢复生态学、生态工程学、人类生态学、生态伦理学等。
此外，还有学科间相互渗透而产生的边缘学科，如数量生态学、化学生态学、物理生态学、经济生态学等。