一、《鲁迅读过的书》收入鲁迅寓目、阅读过的各类图书凡4235种，分作“国学”、“现代”、“西学”、“综合”四编。所谓“寓目、阅读”，以各种版本《鲁迅全集》中鲁迅提及、引用为准；引用，又包括直接引用和间接引用。因此，本书著录“鲁迅读过的书”，全部且仅仅来源于《鲁迅全集》中出现的书籍。
二、“国学”编以传统“四部”分法为基础，斟酌损益，另有变化。如，按《四库全书总目提要》分类，“儒学”为“诸子”之首，另有儒学专著，则首列“经部”等。今不取此法，将鲁迅读过的书中，经学与儒学合并，为“儒学部”。“小说”、“语文”等，在“四部”中，多列入“诸子”和“经部”，今将其独立出来，分别立部，做“小说部”和“语文部”。
三、图书分类，向为大难。今为分类，也多有踌躇。有些书可以列入甲部也可以列入乙部，此处分类，全出己意，如“第四编综合·艺术部·美术综合类”，[苏]普列汉诺夫之《阶级社会的艺术》、[苏]共产主义大学文学艺术研究所编[日]外村史郎译《马克思恩格斯艺术论》、[日]古川庄一郎等著《马克思列宁主义艺术学研究》、日译本《马克思主义美学》、[苏]卢那察尔斯基《马克思主义艺术理论》等，也可以列入“第三编西学·思想部·马列学说类”。但考虑到“艺术理论”的性质，还是归入到“美术综合类”。如“第二编现代·学术部·传统研究类”中，多属于“第一编国学”内容，但考虑到“现代”的性质，还是归入了后者。
本书分类“跨类”现象尚多，不再一一说明。
四、《鲁迅全集》中有十二篇文章，原作者为瞿秋白，如《南腔北调集》中的《关于女人》、《真假堂吉诃德》；《伪自由书》中的《王道诗话》、《伸冤》、《曲的解放》、《迎头经》、《出卖灵魂的秘诀》、《最艺术的国家》、《内外》、《透底》、《大观园的人才》；《准风月谈》中的《中国文与中国人》等。这些文章均作于1933年，其中有鲁迅的意见在内。鲁迅也曾做过字句上的改动，并请人誊抄后，以自己使用的笔名，寄给报刊发表，后来又分别将它们收入自己的杂文集。所以，这类文章所引用的书目，也在收录之内。
五、有些书籍，是鲁迅间接引用，虽然未注出处，但我发现可能的出处，还是列入鲁迅读过的书，并为之作注说明。如《而已集·答有恒先生》中说：“种牡丹者得花，种蒺藜者得刺，这是应该的，我毫无怨恨。但不平的是这罚仿佛太重一点，还有悲哀的是带累了几个同事和学生。”这里的“种蒺藜”云云，就典出《阅微草堂笔记·滦阳消夏录》：“纪昀借冥府讼事说理云：‘种桃李者得其实，种蒺藜者得其刺。’”因此本书收入《阅微草堂笔记》。又，鲁迅《答客诮》诗云：“无情未必真豪杰，怜子如何不丈夫？知否兴风狂啸者，回眸时看小於菟。”此典源出自明张岱《快园道古》卷四“言语部”：“解大绅应制，作《虎顾众彪图》诗曰：‘虎为百兽尊，谁敢触其怒！唯有父子情，一步一回顾。’文皇见诗感悟，即遣夏原吉迎太子于南京。”这里借虎说事，说的都是民间所谓“虎毒不食子”的道理。因此本书收入《快园道古》。
六、订正了《鲁迅全集》中的一些可能的舛误，如：
1.《吴越春秋》[东汉]赵晔著，《鲁迅全集·集外集拾遗补编·〈越铎〉出世辞》注6谓《吴越春秋》作者为赵煜，或为手民之误。
2.《红萝卜须》[法]儒勒·列那尔（1864-1910）著，又名《胡萝卜须》，《书信·332709致黎烈文》等提及此书。《鲁迅全集》注为“小说”，考虑到《胡萝卜须》“自然记事”的性质，本书处理为“散文集”。
3.《黄子久秋山无尽图卷》[元]黄公望绘。黄公望，元四家之一；
《全集·书刊注释》作“清代黄公望”，显误，径改之。
4.《傅青主诗》即《傅青主自书诗稿墨迹》，诗文书法，[清]傅山作。
《全集》作“《傅青主持》”，显误，径改。
七、凡遇以下情况，酌定收入与否：
1.鲁迅提及但未见者不收。如《秋胡小说》、《伍员入吴故事》等，均系唐五代时人钞，见于敦煌藏经洞，王重民《敦煌变文集》有收录，《中国小说史略》等提及这类书，但鲁迅自认没有看过；又如《中国小说史略·元明传来之讲史（上）》说：“《残唐五代史演义》未见，日本《内阁文库书目》云二卷六十回，题罗本撰，汤显祖批评”；举凡此类，可知鲁迅未见，故本书也不收。《鲁迅全集》中提及散佚且无辑本的书，也应该属于鲁迅未见，故不收。如《周考》、《务成子》、《天乙》等，《中国小说史略》提及，说《汉书·艺文志》有著录，但书今不存，既然不存，当不在“鲁迅读过的书”范围之内，故不收。
2.丛集中收入书籍，一般收入丛书，不收入丛书中的单本书。如《省身录》、《怀刑录》、《历字文》、《日用俗字》、《农桑经》等，皆系蒲松龄著，鲁迅在《中国小说史略》等提及这五种，并注明见于“李恒《耆献类徵》四百三十一”，这样，本书收入《耆献类徵》，而不收入蒲著五种。但在有些时候，也收入“丛编”和单行本。这种情况约有如下几种：《艺术丛编》，是金石图录汇编，已经收入《周金文存》、《广仓砖录》，但《周金文存》和《广仓砖录》仍然作为专条收录。这是因为考虑到“丛编”除了这两种书外，还可能有其他书在；但“丛编”又有较高知名度，所以一并收入。《楚辞》、《文选》也作如此处理。另有一书即含有“跨类”现象者，如《万古愁曲、归玄恭年谱》合集，《万古愁曲》，明末清初归庄撰；《归谱》，为归庄年谱。2书合刻1册。此书含有“集部”和“史部”两种体裁，因此归入“合集”，集中提及两书则分别归入“集部”和“史部”。原因是鲁迅曾多次提及此书。1926年3月2日《日记》提及购置此书，但早在1925年《书信·致刘策奇》中就提及了此书。此外题“昆山归庄玄恭作”的《万古愁曲》共20曲，又有多种版本，鲁迅所见，可能有多种版本，内容或有出入。因此估计鲁迅当见有单行的《万古愁曲》，斟酌再三，还是重复收入。
3.公文类书籍不收，如《教育部文牍汇编》、《教育法规汇编》等，尽管鲁迅也曾提及或引用，但不收。
4.许广平论及而鲁迅不曾论及的书（尽管鲁迅也可能读过）不收。
5.期刊杂志一般不收，如《新青年》、《莽原》、《申报》等。但另有年刊《安阳发掘报告》已经类同于“书”，总出了四期，鲁迅也明说“看见了几本”（《书信·320618致台静农》），这样的期刊，酌情收入一二。
6.舞台剧电影之类不收，如《碎话》等提及京剧《三娘教子》等，就没有列入本书条目。电影、戏曲曲目或根据小说改编的电影、戏曲曲目等，也不收。如《春潮》，是根据屠格涅夫的中篇小说改编的电影，鲁迅在《准风月谈·电影的教训》中是当做电影而非小说提及的，故不收；
《姊妹花》，是郑正秋根据他自己所作舞台剧改编和导演的故事片，鲁迅在《且介亭杂文·论“旧形式的采用”》也是当做电影提及的，所以本书均未收录。但另有陈嘏翻译的《春潮》小说，《且介亭杂文二集·〈中国新文学大系〉小说二集序》中提及，本书就收录为小说。
7.单篇文章，视情况而定，编撰者认为比较重要，足以阐发义理且影响较大的文章，酌情收入；其他从略。如日本作家立野信之（1903-1971）的《果戈理私观》，鲁迅曾译为汉语，发表于《译文》上。但该文较短，也不重要，未列入专条。短篇小说、随笔等，也作如此处理。
8.鲁迅藏书，凡《鲁迅全集》中未曾提及、引用的不收。据北京鲁迅博物馆1959年7月编定的《鲁迅手迹和藏书目录》可知：鲁迅收藏有线装书930种、平装书797种、日文书993种、俄文书77种、西文（德法英等）书754种，总3551种。这之中当有鲁迅曾经寓目、阅读，但《鲁迅全集》未曾提及、引用的书籍，本书未作收录。
9.拓片不收。据北京鲁迅博物馆介绍，馆内现存有鲁迅收藏的历代金石拓片5100余种，6200余张，包括刻石（碑碣、汉画像、摩崖、造像、墓志、阙、经幢、买地券）、吉金（钟鼎、铜镜、古钱）、陶文（古砖、瓦当、砚、印）等，极为丰富。北京鲁迅博物馆和上海鲁迅博物馆还专门整理有《鲁迅辑校石刻手稿》790余种。我在参与策划编辑《新编鲁迅全集》（即将出版）时，曾对这类拓片做了一些考证，也订正了若干可能的舛误，并发现了这些拓片和鲁迅辑校石刻手稿的“义理价值”，但斟酌再三，还是暂时忍痛割爱。
八、本书编撰方法是：一页页阅读《鲁迅全集》，发现鲁迅提及引用某书，就记录某书；而后将书在鲁迅著作中的出处、文字、鲁迅关于它的前后说明也记录下来，再另据鲁迅对该书的提及背景、引用文字和鲁迅自己的评语、说明和意图做一些发挥，构成了一个条目。总共4235种书籍，即4235个条目。全书完成后，再做分类。
九、编撰中参考了《鲁迅全集》各种版本的注释。自1938年起，为《鲁迅全集》做工者代不乏人，从筚路蓝缕到锦上添花，所做学术积累甚为丰厚，也由此留下嘉惠后人之多种文本。在此向各版《鲁迅全集》的整理者致谢，并专此说明。