胤禛于雍正十三年（1735年）八月二十三日子时，在圆明园猝然去世。据《实录》记载：雍正十三年八月二十日，雍正偶感违和，仍照常听政，并召见臣工。二十一日，病情加重，照常理政。皇四子宝亲王弘历、皇五子和亲王弘昼等，日夜奉侍。二十三日子时，进药无效，雍正驾崩。雍正突然而死，官书不载原因。于是，雍正死因之谜，朝野众说纷纭，主要有以下两种说法。
第一种说法，雍正是被吕四娘谋刺死的。《清宫十三朝》、《清宫遗闻》等书都有雍正遇刺身亡的记载。传说吕四娘是吕留良的女儿，也有说是吕留良的孙女。当年，吕留良因文字狱被死后戮尸，吕氏一门，或被处死，或被遣戍。但吕四娘携母及一仆逃出，隐姓埋名，潜藏民间。吕四娘拜师习武，勤学苦练，尤长剑术，技艺高超。后来，吕四娘乔装改扮，混入深宫，一日，乘机砍掉雍正脑袋。或说，吕四娘的师傅，原是雍正的剑客，后离去，培养了女徒吕四娘，还使用了一种叫“血滴子”的武器。使得清廷只得打造了个黄金头颅，装到雍正尸体上收殓，并严加保密，免得丑事张扬。这个民间传说，流传了二百多年。到1981年，曾发掘雍正泰陵地宫，但未打开。许多学者指出，吕留良之案，吕氏一门，男女老幼，俱已严禁，不能逃逸。就连吕留良父子坟墓，都加以监视，吕女不可能逃脱。所以，吕四娘行刺雍正说，实属子虚乌有，绝不可信。
第二种说法，雍正是服丹药中毒而死的。史书中的雍正虽阴毒异常，但他毕竟是一个封建皇帝，脱离不了当时大的知识和思想背景。所以他一直崇尚方术、迷信占卜，晚年更到处延访修炼之士、寻求长生不死之药。雍正在雍正七年（1729年），得了一场大病。大臣说“皇上下颏偶有些微疙瘩”，是什么病，说不清楚。雍正曾向心腹密臣发出谕旨，要他们推荐好医生、道士：“可留心访问，有内外科好医生与深达修养性命之人，或道士，或讲道之儒士、俗家。……一面奏闻，一面着人优待送至京城，朕有用处。”后来李卫密荐道士贾士芳，到北京为胤禛看病。后将贾道士处死。雍正对道士、丹药感兴趣，特为紫阳道人重建道院。雍正还曾请道士张太虚、王定乾等，到圆明园炼丹，以求吞服灵丹妙药，长生不老。雍正十三年（1735）八月二十一日发病时，养在宫中的两个炼丹道士张太虚与王定乾邀功心切，向雍正进呈他们炼的丹药，没想到雍正吃了很快就“龙驭上宾”了。
雍正死后三天，新君乾隆帝下令驱逐张太虚等道士，并严谕他们不许透露宫中只言片字。这可能同其父食道士烧炼的丹药致死有关。金梁在《清帝外纪？世宗崩》中说：“惟世宗之崩，相传修炼丹饵所致，或出有因。”杨启樵教授认为雍正是“服饵丹药中毒而亡的”。有学者则认为：“此说颇有合于情理处，然而究属推论，未可成为定谳。”或谓：“这类宫闱秘事，要确证论定，难得过硬资料。”