《三国演义》第七十八回，华佗为曹操治疗头风，华佗说：“大王头脑疼痛，因患风而起。病根在脑袋中，风涎不能出，枉服汤药，不可治疗。某有一法，先饮麻沸汤，然后用利斧砍开脑袋，取出风涎。方可除根。”可惜曹操认为颅脑手术是不可能的，以为“此人欲乘机害我”，急令追拷华佗，枉杀无辜。其实，按当时史料记载，华佗既然能进行肿瘤切除、肠胃吻合、脾切除手术，进行颅脑手术也未尝没有可能。正像他当时能进行全身麻醉做腹部大手术，被一般人认为不可思议，迷惑不解，世所罕见一样。
根据考古学家发现，丹麦出土的一具旧石器时代的人类头颅骨化石上，有做过外科手术的残存小孔，手术切口边缘的骨质已经融合。这是手术后病人继续存活，伤口愈合的痕迹。这具古老的颅骨化石告诉我们；远在一万年以前，人类就开始尝试用石钻打开颅脑，并能用手术方法治疗疾病了，其中有的手术方法和今天颅脑手术中的环钻手术十分相似。
我国古代医学远比西方发达，既然有了用于全身麻醉的麻沸散，华佗为何不能开颅做脑的手术呢？看来这也许是曹操在医学方面的无知和对华佗的多疑了。
《三国演义》中，华佗正因为此而惨遭曹操杀害。第七十八回“治风疾神医身死”中，华佗告诉狱卒：“我今将死，恨有青囊书未传于世，感公厚意无可为报，我修一书，公可遣人送与我家取青囊书来赠公，以继吾术。”可惜华佗的青囊书，结果被付之一炬。华佗的被害和他的著作被焚，是我国医学史上的一大损失。《三国演义》上写道“青囊书不曾年于世，所传者止阉鸡猪等小法，乃烧剩一两叶中所载也。”据历史记载，华佗著作留下来的还有《观形察声并三部脉经》、《枕中灸刺经》、《华佗方》、《五禽六气诀》等。