“治法”
疏肝和胃，敛阴止痛。
“组成”
黄芩三两，芍药二两，甘草二两（炙），大枣十二枚（擘）。
“服用方法”
上四味，以水一斗，煮取三升，去滓，温服一升，日再、夜一服。
“方义分析”
黄芩汤功效为疏肝和胃，清热止利，和中止痛。该方药味虽少，但组方精当。其中黄芩苦寒，清热止利为主药；芍药酸寒，敛阴和营，缓急止痛；甘草、大枣益气和中，健脾止泻。四药合用，清热坚阴止利。本方多用于治疗腹痛下重，大便不爽的热痢、泄泻等证。后世治疗痢疾之方，多都由此方化裁而来。故汪昂在《医方集解》称黄芩汤为“万世治痢之祖”。
“方歌”
黄芩汤治太少利，腹痛急迫脉弦细；
黄芩白芍甘草枣，清热和阴平肝逆。
“历代论述”
柯琴曰《伤寒来苏集》：“太阳少阳合病，是热邪陷入少阳之里，胆火肆逆，移热于脾，故自下利，此阳盛阴虚，与黄芩汤苦甘相淆以存阴也。凡太少合病，邪在半表者，法当从柴胡、桂枝加减，此则热淫于内，不须更顾表邪故用黄芩以泄大肠之热，配芍药以补太阴之虚、用甘，枣以调中州之气，虽非胃实亦非胃虚，故不必人参以补中也。”“两阳合病，阳盛阴虚，阳气下陷阴中，故自下利。太阳与阳明合病，是邪初入阳明之里，与葛根汤辛甘发散，以从阳也，又下者举之之法。太阳与少阳合病，是邪已入少阳之里，与黄芩汤酸苦涌泄，以为阴也，又通因通用之法。”
成无己《注解伤寒论》：“虚而不实者，苦以坚之，酸以收之，黄芩、芍药之苦酸，以坚敛肠胃之气。弱而不是者，甘以补之，甘草、大枣之甘，以补固肠胃弱。”
周扬俊《伤寒论三注》：“黄芩涤热且厚肠胃，故为温利主药，以黄芩能泄热也。然用芍药者，为其性酸寒，深入阴分，一泄一收，热去而利止耳。取甘、枣者，以和中也。膀胱与胆二腑既病，胃无独安之理。至有呕者，非姜、半之辛，不能除也。”
“现代研究”
1.实验研究
（1）黄芩汤对伤寒杆菌、甲型副伤寒杆菌、乙型副伤寒杆菌、鼠伤寒杆菌、福氏痢疾杆菌、宋内氏痢疾杆菌等6种肠道菌株有中敏感度或低敏感度抑菌作用，但对大肠杆菌无抑菌作用，说明该方在临床中长期服用，亦不会产生机体肠道菌群失调的副作用，是较为理想、安全、有效的方剂。另有研究，黄芩汤对实验性湿热型溃疡性结肠炎具有较好的免疫调节作用，其机制可能是通过上调TGF-β1、IL-10及Foxp3的表达，活化并增强Tr细胞的功能而减轻肠道黏膜的免疫反应，发挥修复黏膜、缓解临床症状的作用。
（2）黄芩汤具有抑菌、抗炎及免疫调节、解痉止痛、保肝降酶、抗促癌，以及抗病毒、退热和镇静的药效学作用。原方或其加减方常用于治疗细菌性痢疾、急性胃肠炎、阿米巴痢疾等胃肠道疾病。
2.临床研究
治疗湿热痢疾：门诊130例病例，病程均为1～7天。以黄芩汤加减治疗66例，对照组64例行西医常规治疗。结果治疗组治愈62例，好转3例，未愈1例，总有效率98.5%，平均治疗时间3.1天；对照组治愈50例，好转5例，未愈9例，总有效率85.9%，平均治疗时间4.8天。
“病案分析”
孙某，女，68岁，下利黏液脓血便4天，伴恶心呕吐，口干口苦，无里急后重。舌暗红，苔白腻，脉左弦。证属湿热蕴结肠中，上逆犯胃。已经在外院静点左氧氟沙星、庆大霉素4天，效不显。《伤寒论》谓：“太阳与少阳合病，自下利者，黄芩汤主之；若呕者，黄芩加半夏生姜汤主之。”遂处方如下：黄芩12g，白芍12g，赤芍12g，炙甘草6g，法半夏10g，陈皮10g，茯苓15g，木香10g，槟榔10g，生姜4片，大枣4枚，4剂，水煎服。3天后随访，诉服第一剂后就不再腹泻，也无恶心呕吐，仍胃口不开，乃以香连丸善后。随访3月余，诉大便皆正常。
按语：此为痢疾，吐利交作，舌暗红，苔白腻，脉左弦，为饮食不洁，感受时邪，湿热之邪，壅塞肠中，气血与之搏结，肠道传导失司，故利下赤白。兼见口苦咽干等少阳证表现，符合黄芩汤证特点，故三剂而呕利止。