回族医学是中国传统医学同阿拉伯医学相结合的产物，是最早实现“中西结合”的医学产物。当时的欧洲各国尚还处在宗主教会的黑暗统治之下，而阿拉伯人却已经开始发展自己的科学文化，他们创办大学、建立图书馆，培养了大批的科学家和科研人才，使阿拉伯文化达到了巅峰水平，在所有获得发展的科学文化中，阿拉伯的医学，取得的成就最大。
公元七世纪，阿拉伯帝国开始了向外扩张之路，在获得了大片的领土同时，阿拉伯人的文化得以传遍四方，并得以吸收了其他国家的文化，同时十分注意同当时世界上另一个国力空前鼎盛的帝国友好交流和往来，就是大唐。伊斯兰教的创始人穆罕默德，曾经这样说过：“学问远在中国，当求之。”于是在公元651年，穆罕默德遣使到唐王朝，同大唐朝廷建立了友好关系，中国同阿拉伯之间的医学交流也从这时候开始。当时阿拉伯的伊斯兰教医学曾经处于世界领先的位置，对现代的西方医学仍然有着重大的影响力。
中国的回族医学是在同阿拉伯进行医学交流过程中逐步发展起来的。中国同阿拉伯之间的医学交流源远流长，最早可以追溯到西汉年间。
西汉初年，雄才大略的汉武大帝为了消除匈奴对汉朝的威胁，遣使张骞出使西域，促进了中国同西域之间的文化交流。《汉书》记载，张骞曾经到达过大宛、大月氏、大夏、康居等地区，并从大月氏经过安息到达过罗马帝国，足迹遍布今日的伊朗和意大利地区。在这段路程当中，汉朝使团收集到了很多药物，据统计，这些药物中，矿物药品有石硫黄、密陀僧等18种，植物药有木香、豆蔻等58种，动物药羚羊角及龙涎等16种，共有92种草药，大部分是阿拉伯生产的药物，这些药物都被当时的汉朝医者充分地吸收利用。
中国同阿拉伯之间正式的医学交往起源于唐王朝。公元651年，阿拉伯使者抵抵达唐朝首都长安，觐见当时的唐朝皇帝。从此之后，阿拉伯使节每年都会前来朝见唐朝皇帝两次。从唐朝永徽二年到贞元十五年的148年中，阿拉伯遣唐使多达36次。唐玄宗统治后期，唐王朝内部发生了“安史之乱”，叛军迅速占领大片地区，应唐庭之请，阿拉伯派兵参与平叛，这些阿拉伯士兵，有一部分在战后定居中国，他们将很多的阿拉伯生产的香药带到了中国，进一步促进了中国回医药的发展。
唐代阿拉伯人除了输入大量的香料外，一些医疗技术也随之传入中国，在《千金翼方·养性》记载的“悖散汤”本来就是波斯、大秦医方，曾在中国广为流传，对治疗气痢、一切气病、健运脾胃有极为良好的效果。
宋朝时，中国造船术特别是指南针的发明和应用，使得中国航海业十分发达，很多国家特别是阿拉伯商人都居住在中国东南沿海，宋朝设立专门的机构，对这些外国商人进行管理，这时期香料流传入中国，并在中国获得广泛的应用。蒙古族兴起后，吞并了亚欧大陆很多国家，曾经辉煌的阿拉伯帝国被收入到蒙古版图当中，其药学让回族药学蓬荜生辉。由于元朝继续执行南宋的海外贸易政策，推行各民族医学共存的政策，回族医药得以兴旺发达。当时的元朝皇宫内曾专门建有回医药的机构。从此回医药成为中西结合的医学文化，在中国不断地发展和进步。
宋、金、元交替更迭之际，中国医学文化领域，其学术氛围极为活跃，并产生了四大学派。这时期也是回族医学发展的鼎盛时期，并流传下具有中国回族特色的医药大型综合性著作《回回药方》。
中国回族在一千多年的与疾病作斗争的过程中，不但形成了独特的回族医药理论体系，而且形成了至今尚存在的独特的民间疗法。而民间疗法又可分外治法、内治法，其中外治法又可分为刺法、拔法、吹法、挑法等针灸治疗法。新时期背景下，回族医药不断的获得发展，并在医学研究和疾病治疗上，取得突破性的进展。