为防治病虫害、杂草，直接向土壤施入农药，或是农作物喷洒剂的多余部分直接撒落在地面，以及漂浮在大气中的农药经降雨而落于地面，均可导致农药污染土壤。由于土壤的污染必然导致对农作物的污染，土壤中的农药通过农作物根部吸收，再经过植物体内的迁移、转化等作用分配到整个作物。有的作物食用部分在土壤下面，如花生、土豆、山芋、芋头等，被残留农药污染的可能性更大。因此，人们长期食用农药残留量较高的食物，微量农药可在体内逐步蓄积，使人体生理功能逐步发生变化，从而引起慢性中毒。这种中毒来势缓慢，病症很不明显，常常被人们忽视，然而其潜在危险性很大，如DDT和六六六慢性中毒主要表现为肝大，肝细胞变性、坏死，并伴不同程度贫血、白细胞增多和中枢神经性病变。
家庭中要重视对农药污染或有可能污染食物的处理，适合的烹调方法对食物去农药残留有一定作用，如用高压锅煮米饭可以提高农药的去污，用电饭锅做饭可以消除50%以上的六六六残留。
对于施洒在瓜果、蔬菜上的农药，大部分是在叶子表面和果皮上，一般来说比较容易清洗，蔬菜可以先在清水中浸泡一些时间，然后再仔细清洗；瓜果可以先用洗洁精一类洗涤剂清洗，然后用清水漂洗干净，再削皮去壳食用。例如，西红柿上的DDT，用上述方法仔细清洗后，农药残留的去除率可达90%以上。有些家庭爱吃生、凉拌菜，蔬菜的清洗更要严格，切忌草率马虎。