财务软件的输出功能一般包括查询输出、打印输出和向软盘输出或运用网络输出等方式。输出控制的主要目的是为了保证计算机输出结果的正确性、可靠性、及时性和必要的保密性，保证输出的接触人员是仅限于经过授权的人员。为此，要对打印或下载的文档资料严格控制，对储存输出数据的各种磁盘或其他磁性介质也要采取各种控制措施，并建立输出资料控制制度，由专人负责分发、保管并登记输出资料的使用者、分发日期、打印份数或下载情况；同时对发生的差错、丢失、泄密等事故要进行记录，仔细检查、分析形成事故的原因是操作员的过错还是程序本身的，并能采取相应的避免措施或改进措施。软件应对各种输出要求进行权限设置，未经授权，计算机拒绝执行其输出要求。例如在网上传输要设置网络口令，只有当口令正确时才能执行输出操作；又如对向软盘输出的情况，计算机应首先检查软盘的安全性，以防止计算机病毒的侵蚀。
而与篡改输入数据类似，有些企业直接在输出结果上做文章。如某企业2008年度根据计算机会计系统生成的报表出现了亏损，该企业为了体现良好的公司业绩，就直接对报表数据进行了修改，以此来达到目的。
输出控制的目的是要保证系统能完整、准确地输出经处理的会计信息，未经授权批准的人不能接触输出资料。常见的控制措施包括：
（1）输出权限控制。
即只有经过授权批准的人才能执行输出操作，并要做好操作记录。计算机会计系统的输出主要有三种：一是屏幕显示，二是打印输出，三是存入磁性介质。这三种方式都要设立相应的权限控制。常见的控制措施有：限定使用计算机或终端的人员，通过口令使用输出模块等。
（2）勾稽关系检查。
在财务报表输出前，由计算机检查报表间应有的勾稽关系是否满足，若不满足，则给出错误信息。
（3）输出审视。
打印输出的资料要进行登记，并经有关人员检查后签章才能送出使用或按会计档案的要求保管，未经批准的人不得接触系统的输出资料。由计算机打印输出的账簿必须经操作员、稽查员共同签章。未经稽查员签章的账簿不具有合法性。