秦腔音乐除上述唱腔音乐外，还有丰富的曲牌音乐。其数量总计达500多曲。现在常用的也有二三百曲，故而它是秦腔音乐的一个重要组成部分。
一、秦腔曲牌的来源
秦腔曲牌如此丰富，重要的是它在实践中能够吸收别的艺术之长补己之短，有些甚至全然拿来“为我所用”，而且范围广泛不受约束。归纳起来主要有以下几个方面：（一）来自长安地方戏曲固有的曲牌；（二）来自长安民间音乐曲牌；（三）来自对唐宋大曲、曲子及元明清北曲杂剧的曲牌和明清传奇曲牌的吸收、融合、借用与改造。尤其是对后者的吸收、融合与借用，都改变了它们原先作为联曲体唱腔音乐的属性，使之成为为板腔体音乐服务的一种辅助手段。但是，上述曲牌进入秦腔板腔体戏曲音乐一开始并非都是辅助性的伴奏音乐，而有一个与板腔体并为唱腔音乐的一个过渡阶段。这些都可以从元代的秦声杂剧、明代的《钵中莲》和明末清初的《搬场拐妻》等剧本中得知秦腔确有一段板腔体与联曲体共用的历史阶段。一些人不承认秦腔唱腔音乐是板腔体音乐，原因恐怕就在这里。这是一种忽视决定事物性质主要方面的观点。
二、秦腔曲牌的类别与功能
秦腔曲牌，纯属器乐曲。在众多的曲牌中，有的是用这一种乐器来演奏，有的是用另一种乐器来演奏；有的表现这一种情绪，有的表现另一种情绪；有的适于这一种场合，有的适于另一种场合；而且每一种曲牌无论旋律、节奏、调式以及演奏手法等都有异常丰富的变化，尤其结合戏剧运用非常灵活。因此，我们根据各种不同情况将其分为六大类：
（一）弦索曲牌
用丝弦乐器演奏的曲牌。总计百余曲。常用的有50余曲。可表达各种复杂的人物情感。现沉思回忆、怀念用[大柳叶锦][祭南风][小妹子][跳门槛]等，表现悲痛、哀愁用[杀妲己][柳青娘]。表现人物戏曲动作如妇女做女红用[小桃红][梳妆台]，武侠、武将舞时用[夜深沉]，开门用[扭门拴]，拜堂用[靛花门]，打扫书房、摆宴用[抱妆台][一朵鲜花][大开门]，祝寿用[小柳叶锦][大八板]，祭奠、扫墓用[纺棉花][张良归山]，走路与跑步用[花梆子]等等。表现逍遥、欢畅情绪用[弦索小开门]，表现殷切盼望用[义子进山]，表现凄凉、悲切用[苦音永寿庵][慢板杀妲己][中板杀妲己][十月花]，也有丑角专用的如[珍珠倒卷帘][钻烟洞]等。这里只介绍一支最常用的[小桃红]：
（二）唢呐曲牌
用竹管乐器唢呐吹奏的曲牌。在整个秦腔曲牌音乐中，这类曲牌的数量最大，运用的也最多。关中人称这种吹奏乐为“龟兹”，显然同唐代的“龟兹乐”有极为密切的关系。大约有曲牌200多种。
1.祭灵用的有[钉子钉][摆马抱][王昭君][祭沙][三青天歌][闹元宵][山坡羊][大开门][正调柳青娘][反调柳青娘][梅调柳青娘][小宫调柳青娘][千里独行]等22曲。
2.祭奠、婚丧用的有[钻天哨][刮地风][鬼推磨][正调马道仁][反调马道仁][绣荷包]等11曲。
3.练兵用的有[背番子][神童歌][驻马停][红绣鞋][佛曲][将军令]等6曲。
4.发兵作战用的有[乌马江水儿][石榴花][洞兰玉][玉芙蓉][朝阳歌][步步娇]等11曲。
5.排宴用的有[正调抱妆台][凡调抱妆台]和[商调抱妆台]3曲。
6.饮酒用的有[寿筵开][画眉序][元令好][江水儿][哭皇天][北调]等11曲。
7.坐帐专用曲有[一枝花][十三铰子][朝天子][番王令][水龙吟子]等9曲。
8.行路用的有[排歌][中军令][状元令][勒马令][锁南枝][甘州歌][添丫叙][风入松][和尚令]等16曲。
9.打扫、降香用的有[正调水龙吟][队伍歌]等2曲。
10.神仙坐洞用的有[哪吒令][菩萨台]等3曲。
11.行云用的有[赏宫花][功曹令][连云起驾]等3曲。
12.比武用的有[黄龙滚][夏小乐][叠字犯][斗脊背][耍孩儿][马背][收江南][节节高][压一拍]等11曲。
13.江中行船用的有[船歌子]2曲。
14.点将用的有[女点将][毛点将][走马点将][五句点将][八句蝶粉儿][新水令]等7曲。
15.其他杂曲则有[唢呐皮][采桑][七句半][雁儿落][小排朝][三眼腔][巧相逢][尾声]等30曲。
（三）叽呐曲牌
即海笛曲牌。有[指贤塔][庵僧曲][喜滋滋][耍孩儿]4曲。
（四）笙管曲牌
即笙管乐器吹奏的曲牌。分两种：一是带锣鼓的笙管曲牌；二是不带锣鼓的笙管曲牌。共40曲。其中大部分曲牌仍保留在周至县南集贤的香会音乐《北曲四大套》和《南曲四大套》的札子中。第一类的曲牌又叫[引令]，计有[笙管头][引令头][小令引][出山马][普天乐][犯嘴][对美人][金钱柳]等22曲；第二类的有[红纱]（又分三句、五句、七句、十句）、[到春来][到秋来][到冬来][浪满山][月月高][燕儿毛]等22曲。
（五）昆曲曲牌
这是明清以来从昆曲传奇中借鉴而来的。共50曲。常用的30多曲。如[火红袍][封王][刮地风][雁儿落]等。
（六）套曲
这是秦腔曲牌中保留北曲曲牌的重要证据。前述五种类型的曲牌，大都是属小令性质的单只曲牌，但这些小令性质的曲牌也有北曲小令中带过曲的许多特点。有时，一些曲子还常有曲头、曲尾的分别。保留在各类器乐中的套曲有24套，分别是弦索的[打连厢][五更愁][荡花船]；唢呐的[哭长城][西番赞][堆塔][挖菜头][万道金光][双唢呐][巧璃贯]等8套；海笛的[五张条子]，笙管的[青天歌][铜鼓][上小楼][下山虎]等7套，昆曲有[将军令][雁落平沙][小魁]等4套。此外，可以共用的散套有[将军令][雁落平沙][小上坟][玩灯]4套。一般的套曲都由同一宫调下的若干曲牌组成，多的达16曲，少则2曲。以[堆塔]为例其组套是这样的：
[八句粉蝶儿前五句]→[紧起]→[十三铰子]→[一枝花]→[一枝花尾]→[八句粉蝶儿后三句]→[一枝花合头]→[乌马江水儿]→[哪吒令尾]→[石榴花]→[黄龙滚]→[空场]→[夏小乐]→[叠字犯]→[尾声]。共15曲。
秦腔的曲牌音乐，处在长期的艺术实践和不断淘汰与陆续创新中，曲牌的数量与品种时有变化。