在回埃及的路上，摩西再次遇见上帝。因为摩西没有给儿子施割礼，上帝愤怒得要将他杀死，这时，他的妻子西坡拉赶紧在路边捡起一片锋利的石片，将儿子的阳皮割下，上帝这才消了气。
上帝安排亚伦去迎接摩西。在上帝山，久别的兄弟相见后，紧紧拥抱，畅叙阔别之情。摩西将上帝的旨意详细地告诉了亚伦后，他们就将以色列的众长老召集来，将上帝的旨意传达给他们，并在百姓们面前施行上帝传授的神迹，获得了百姓们的信赖，人们纷纷跪伏在摩西的面前。
接着，摩西与亚伦一道去见法老，对法老说，以色列人的上帝要他让以色列人走三天的路程，到旷野里去祭祀上帝，否则会遭到瘟疫和刀兵的攻击。法老说：“上帝是谁？我又不认识他，他怎么能叫我让以色列人旷工，到旷野里去祭祀呢？”法老认为，这是以色列人想偷懒而找的借口。
当天，法老吩咐督工，不但不减少以色列人做砖的数目，而且还要叫他们自己去捡草烧砖，加重他们的工作，来惩罚他们。尽管以色列人的官长苦苦哀求法老，但一点也不起作用。于是已苦不堪言的以色列人开始抱怨摩西，说是他使他们引火烧身。
摩西为此感到非常内疚，便向上帝祷告，上帝表示，要惩罚埃及法老，逼他放以色列人离开埃及。
摩西将上帝的这些话传达给了以色列人，但心灰意懒的以色列人根本不相信他的话。上帝便再次要摩西和亚伦去见法老，要求法老放以色列人到旷野去祭祀上帝，并告诉摩西和亚伦，他要使法老的心变硬，坚决不放以色列人，然后他再严惩埃及，通过这些，让埃及人知道上帝的厉害。
尽管这时摩西已八十岁，亚伦已八十三岁，但他们还是照上帝的旨意，去拜见法老。
见到法老后，法老让他们行一件神迹来证实他们的话，于是亚伦按照原先上帝的吩咐，将手杖丢在法老和大臣们面前，手杖立即就变成了蛇。
于是，法老召来埃及的博士和术士，让他们用邪术也丢下自己的手杖变成蛇，但亚伦手杖变的蛇吞下了他们手杖变的蛇。
但是，法老仍不放以色列人离开。于是摩西和亚伦按照上帝的吩咐，开始降灾给埃及，迫使法老屈服。
摩西和亚伦按照上帝的旨意，在法老和众臣面前举杖击打河里的水，河里的水都变成了血，鱼都死了，河水腥臭难闻，埃及遍地都是血，连木器中、石器中都有血。但固执的法老毫不理会，埃及人无水可喝，只好在河边挖井，汲水供人畜饮用。血灾持续了七天，随后河水才变清澈。
摩西和亚伦又按照上帝的旨意去见法老，法老依然不准。于是亚伦用手杖指向江河湖泊，那里的青蛙全都跳了出来，弄得宫殿、房屋、床上、人们的身上，甚至厨房、锅里到处都是青蛙。法老无奈，找来摩西和亚伦，答应了他们的要求，要他们赶快让青蛙都死去。摩西见法老妥协，便向上帝祈祷，第二天，所有的青蛙才都死了。埃及人将死青蛙堆积起来，一时弄得臭气熏天。但是，蛙灾刚过去，法老就立即变卦了。
于是，上帝指示亚伦用杖击地，使尘土变成无数虱子，使全埃及人和牲畜身上都爬满虱子，但是法老仍然不肯妥协。
接着上帝降下了蝇灾，除了以色列人住的歌珊，埃及到处都飞满了讨厌的苍蝇，法老无奈，就把摩西找来，答应了他的要求。
但是蝇灾刚过，法老立即又变了卦。上帝接着就降下了畜疫之灾，于是埃及瘟疫流行，埃及人的牲畜几乎都死了，但以色列人的牲畜一头也没死。
法老仍然不妥协，上帝就开始降疮灾。他吩咐摩西取了几捧炉灰，在法老面前向天上扬起，随后埃及人及牲畜的身上都起了泡疮。
接着上帝又降下雹灾。摩西按上帝的吩咐向天举杖，顿时雷电交加，大块的冰雹砸伤了埃及人及其牲畜，除了未长出的小麦和粗麦，埃及人的农作物几乎全部被毁。
迫于无奈，法老开始求饶，上帝这才止住了冰雹。但冰雹刚住，法老接着就反悔。于是摩西按上帝的吩咐警告法老，如果再不让以色列人去旷野祭祀上帝，上帝就让铺天盖地的蝗虫吃光田间所有的庄稼和树木，并且爬满宫殿和埃及人的房屋，造成空前的灾难。
在众臣的规劝下，法老召见摩西和亚伦，问他们有多少人要去祭祀上帝。摩西说，男女老幼都去，并且带着所有的牲口。
但法老只同意让壮年人去，随后便把摩西和亚伦撵了出去。
于是摩西按上帝的吩咐向全埃及伸出手杖，一天一夜之间，刮起了东风，吹来了无数的蝗虫，布满了天空，整个埃及昏天黑地，田间刚长出的—点农作物和雹灾后树上剩下的一点果子全部都被吃完，连一点青的也没留下。
法老急忙召来摩西和亚伦，向他们求饶，接着上帝便调转风向，将蝗虫全部吹入红海，一只也没留下。
当最后一只蝗虫被吹走后，法老继续翻脸不认账。摩西按上帝的吩咐，向天空伸出手杖，整个埃及顿时—片黑暗，三天三夜，伸手不见五指，只有以色列人的家中才有亮光。
这时法老召来摩西，同意让以色列人去祭祀上帝，但必须将牛群和羊群留下。然而摩西却坚持要带走全部牲畜，以侍奉上帝，这下触怒了法老，他吼叫道：“立即给我滚出去，再让我见到你，我就要你的命！”摩西也反唇相讥道：“说得好，我也绝不会和你再见面了。”
在第十次降灾埃及之前，上帝晓谕摩西和亚伦，要他们告诉以色列人：要以本月为正月，本月初十，每家要按人口比例选一头羊或几家合选一头羊，在十四日那天宰了，把血涂在门框和门楣上。就在这天夜里，上帝巡行击杀埃及人，凡门楣和门框上有血的，就越过这家，把埃及人所有头生的人和牲畜统统杀了，不论是太子还是囚徒的儿子。（后来，每年的这一天，以色列人都要举行庆祝活动，这就是逾越节的来历。）
接着，埃及举国上下哭声震天，这回法老终于彻底妥协了。他连夜召来摩西和亚伦，对他们说：“去吧，把你们的以色列人带出去侍奉你们的耶和华吧，就照你们所说的，连羊群牛群也都带走吧！”
这时，埃及人都迫不及待地催着以色列人离开，说如果他们再不走，埃及人都要死光了。以色列人整顿好行装后，按照摩西的吩咐向埃及人索取金银首饰和衣服，由于埃及人急着要以色列人离开，因而被以色列人索去了大量的财物。