（1）药物对营养素吸收的影响：药物可引起肠黏膜细胞破坏，从而影响营养素吸收，营养素损失受细胞损伤部位、范围及时间长短的影响。药物可对营养素转运机制进行选择性干扰。药物可破坏胰外分泌功能，胰酶产生或释放减少，并可引起脂肪、蛋白质及淀粉消化不良。有些药物能吸附或干扰胆盐生理活性，使脂肪及脂溶性维生素在肠吸收不良。胆盐是作为脂肪和脂溶性维生素吸收的必需要素。
（2）药物对营养素分布及排泄的影响：血浆蛋白或组织结合部位营养素置换也受某些药物影响。药物与营养素形成复合物，可置换与蛋白质结合的营养素，使其从结合部位解离，或与其产生化合作用；药物与微量元素，如锌或铜形成螯合物；核糖侧链形成复合物等。这些药物与营养素相互作用结果是促使受影响的营养素以游离形式，或与药物生成复合物形式由肾排出。以上任何情况，都可发生营养素不足。
（3）药物对酶的影响：药物抑制辅酶的酶系统，干扰活性维生素生理功能。某些结构不同的药物可激活微粒体药物代谢酶的活性，也可以促进脂溶性或某些水溶性维生素的分解代谢，导致体内贮存下降。