当一种药物或别的物质，影响了吸收其他药物的药代或药效动力学过程时，就会出现药物的相互作用。关于药代动力学方面的药物相互作用，其机制是药物吸收、分布、生物转化或排泄过程改变的结果，最常见的形式是涉及生物转化的相互作用，尤其源于细胞色素P450（CYP）酶的诱导或者抑制。现在还认识到药物转运蛋白，如P-糖蛋白，在药物的处置中扮演着关键角色，在有些情况下，药物相互作用的结果对于临床治疗并无显著影响，而在某些病案中它可能导致临床对疾病治疗的失败，或产生严重不良反应，经常有药物因不良反应严重而被迫从市场收回。当然某些情况下，也可以通过降低药物的用量而使药物相互作用发挥有益的治病效果。
近年来，不论在临床治疗还是药物研发方面，人们越来越重视联合用药和复方制剂的作用。联合用药和复方制剂研发似乎已经成为一种趋势。国际上越来越多的研究者开始重视多分组、多靶点、多效用，甚至“网络药”的研发。