（1）与惊厥相鉴别：在新生儿时期，鉴别时须特别注意分娩性损伤、先天性脑部发育不全及败血症等。若为较大的婴儿，须特别注意各种急性病（如肺炎、上呼吸道感染等）起病时的脑部症状、脑炎、热度不高的脑膜炎（如结核性脑膜炎，偶遇脑膜炎球菌性脑膜炎亦可暂时缺乏高热）、婴儿痉挛症、低糖血症及铅中毒等。在儿童时期尚须与癫痫及甲状旁腺功能低下相鉴别。
（2）与喉部梗阻鉴别：手足搐搦症的喉痉挛以吸气性哮吼为主要症状，若无惊厥，则可利用佛斯特征等以助诊断。
（3）与其他引起手足搐搦症的疾病相鉴别：①甲状旁腺功能不全所致的手足搐搦症。如在进行甲状腺手术时误切了甲状旁腺，可使甲状旁腺素缺乏而致血钙低下。新生儿刚离母体，可能有暂时性甲状旁腺功能不足现象。新生儿如用牛奶喂养，由于牛奶中磷的含量较高，以致钙不易吸收，血钙降低而发生手足搐搦。此外，还有原发性甲状旁腺功能不全症，如先天性甲状旁腺发育不全，遗传性甲状旁腺激素基因的分子异常等。以上各种病例都有一个共同的血生化特征，即血磷增高，血钙减低，碱性磷酸酶正常。②碱中毒性手足搐搦症。由于长期呕吐或反复洗胃而发生低氯性碱中毒；由于水杨酸中毒等所致的呼吸深长，发生呼吸性碱中毒；或由于输液不当，静脉滴注大量碳酸氢钠等，都可使钙离子下降而发生症状。③低镁性手足搐搦症。偶见于早产儿及小样儿。母亲往往有妊娠高血压综合征、糖尿病、甲状腺功能亢进。亦见于用枸橼酸盐抗凝的血液换血的新生儿溶血症患儿，此时血液内镁和钙均降低而出现手足搐搦症。也可由于腹泻迁延过久，或因酶的缺乏而致肠吸收不良等影响镁的吸收。亦有由于醛固酮增多症或原发性低血镁而发生惊厥者。患者血清镁降至正常以下，出现面肌抽动、手足徐动、血压高、心动过速等，经补钙无效，但注射或口服镁剂后即可控制症状。④慢性肾脏病过程中继发的手足搐搦症。由于肾功能不全，肾小管排磷的功能减低，血磷增高，以致血钙降低。此类疾病多有白蛋白减低或慢性酸中毒，故很少发生手足搐搦症。但如血清钙极度减低，或因输入碱性溶液使血清pH值上升时，即可出现惊厥或手足搐搦的症状。⑤低钠血症和高钠血症。治疗脱水时如补液不当，可出现低钠血症，发生嗜睡、呕吐、惊厥等神经症状。在脱水及酸中毒纠正过程中，当血钠上升、血钾下降时，出现高钠血症，可发生手足搐搦的症状。新生儿窒息或呼吸窘迫综合征时，如输入大量碳酸氢钠液，也可发生高钠血症而出现惊厥。⑥维生素B6缺乏症和依赖症。婴幼儿时期如缺乏维生素B6或发生维生素B6依赖症，亦可出现抽搐。