1948年12月5日，东北野战军长驱入关，与华北部队配合，发起平津战役，将傅作义的部队包围在北平、天津、张家口之间。在当时进行的和平解放北平的谈判中，傅作义曾先后派代表两次与我谈判，都未能达成协议。这时，邓宝珊应傅作义电邀到达北平，一方面与我党加强联系，一面与傅作义推心置腹进行商谈，使傅作义下了决心，接受中国共产党的和平建议，并委托邓宝珊担任全权代表，出城与中国人民解放军谈判，他出任博作义的谈判代表，频频往返于北平与解放军平津前线驻地之间，终于达成和平解放北平的协议。邓宝珊对促成北平的和平解放作出了重大贡献。
1949年2月12日，毛泽东在河北平山县西柏坡亲切接见了傅作义、邓宝珊，热烈欢迎他们站向人民一边的正义行动，充分肯定了他们为保护千年古都的珍贵文物、建筑和人民生命财产安全，以及伟大的人民解放战争的顺利进行作出的贡献。1949年3月，党中央迁到北平，3月25日下午，毛泽东在西苑机场检阅人民解放军，特邀傅作义、邓宝珊参加了检阅，这是共产党给他们的崇高荣誉。
北平的和平解放，使这一历史文化名城及两百万黎民百姓的生命免遭涂炭。为尔后湖南、新疆、云南、西康的和平起义树立了榜样。当时，北平的《新民报》曾就邓宝珊促成北平和平解放发表文章说；“他是一把钥匙，傅先生这把锁，只有他可以打开。”
1949年，绥远和平解放的时机成熟，但国民党反动派极力进行破坏，曾派前军令部长徐永昌、空军总司令王叔铭前去绥远，企图阻止起义。9月，傅作义、邓宝珊受毛泽东、周恩来的委托，一起亲自去绥远，防止了同民党的破坏，协助董其武实现了绥远国民党军队的和平改编和绥远的和平解放。绥远和平解放后，毛泽东、朱德以及聂荣臻、薄一波曾发电报祝贺，贺词中说：“自从傅将军领导和平解放后，人民表示欢迎，反动派表示反对，反动派还企图破坏绥远军民和平解放的努力，但是终归失败。”在绥远期间，邓宝珊还为宁夏马鸿宾部队的起义做了一些有益的工作。由于邓宝珊所作出的贡献，1955年，他和傅作义一起被授予一级解放勋章，以表彰他在人民解放事业中的劳绩。