邓宝珊是甘肃省天水人，1909年他在兰州加入清廷派遣军杨缵绪部来到新疆，在风云激荡的民主革命思潮影响下，于1910年毅然加入孙中山先生领导的同盟会，成为甘肃参加同盟会的第一人，义无反顾地走上了为振兴中华而奋斗的人生旅程。
辛亥革命爆发后，他参加了震动全国的伊犁起义，攻打清政府伊犁将军署和统领衙门所在地惠远城，立下战功。正当他积极响应武昌革命，准备参与组织新疆全省起义时，袁世凯下令解散同盟会并禁止其一切活动。邓宝珊被迫从新疆取道西伯利亚东下，到达陕西华山，与陕西同盟会会员在华山聚义，开展反对袁世凯在陕西心腹的活动。
1924年，积极参加冯玉祥领导的国民军，并任国民军2军7师师长，拥护孙中山的联俄、联共、扶助农工的三大政策，通电欢迎孙中山北上主持国事。在反对北洋军阀的战斗中屡立战功，从此崭露头角于中国政治舞台。
北伐战争时期，他与李大钊来往密切，共同支持孙中山北上。1926年，在谈及对时局的看法时，邓宝珊精辟地说：“今天我们的共同敌人，中山先生讲得很清楚，外部敌人是帝国主义，内部敌人是军阀，我看国共合作，首先应共同打倒帝国主义与军阀，把中国从黑暗压迫中解放出来。国共合作革命必成，分裂必败，我们千万不能干亲者痛、仇者快的蠢事。”冯玉祥响应李大钊代表共产党提出的要求回国参加北伐，任国民联军总司令，邓宝珊出任国民联军援陕前敌副总指挥，统一指挥西安城外的陕西国民军，提出了解西安之围的具体作战计划，并率部与古鸿昌部一起英勇作战，为西安解围出了大力。
“西安事变”发生后，他从国家民族大义出发，积极支持张学良、杨虎城将军提出的八项主张，拥护共产党和平解决事变的决策。张学良将军被扣南京后，杨虎城在西安处境困难，电邀邓宝珊协助处理重大事宜。邓宝珊不顾个人安危，奔赴各方面矛盾斗争激烈的西安，从中极力斡旋，努力做各派之间的工作，为避免内战、稳定局势起到了积极作用。在蒋介石的巨大压力下，杨虎城被迫出国，为了保障杨虎城的人身安全，邓宝珊远赴上海，机智周旋，安排力量予以保护，亲自护送杨虎城在上海登上轮船，表现出了非凡的胆略和勇气，赢得了张学良、杨虎城的钦佩，多年以后他与杨虎城建立了深情厚谊。