顺利完成“十七条协议”签订后，阿沛·阿旺晋美如释重负，他为能给西藏人民争取和平与安宁而欣慰，然而，更加严峻的挑战还在后头。
西藏代表团把“十七条协议”的内容发到亚东，在亚东立即引起了强烈反响，并为此展开了一场激烈斗争。一小撮分裂分子狂妄叫嚣“签订的协议丧失了西藏所有的权利”，责备谈判代表没有将谈判内容逐条请示而擅自做主“是坏了大事”，恐吓谈判代表“留在北京，不得返回西藏”，并借机策动达赖外逃。
阿沛·阿旺晋美与谈判代表顶着压力，按原定计划分两路离京返藏。凯墨和土丹旦达、桑颇从水路取道香港、加尔各答前往亚东，阿沛·阿旺晋美和土登列门经过昌都回到拉萨，此时十四世达赖喇嘛已经从亚东回到拉萨。达赖喇嘛和噶厦虽原则上承认签订的协议内容，但噶厦对执行“十七条协议”的问题仍然拖延应付，迟迟不表明态度。阿沛·阿旺晋美以首席谈判代表的身份同噶厦交涉，并提出“噶厦对执行协议如有困难，请召开西藏全区大会，我们可以到会作详细说明和解释”。
噶厦在无可推托的情况下，才于1951年10月20日召开了由地方政府全体僧俗官员等在内的300多人大会。会上阿沛·阿旺晋美首先发言，他详细介绍了“十七条协议”的签订经过，然后说：“有人说谈判代表出卖了西藏，中央政府收买了我们，中央政府给了我们什么呢？当时中央给了我一张毛主席像，还有黄缎一匹，红茶一箱，其他代表的比我的还少，这么点东西就能把我们收买了吗？”
阿沛·阿旺晋美还表示：“我们五人愿以身家性命和财产保证，协议对达赖喇嘛的宏业、西藏的政教、全藏黎民的利益都是有好处的。如果大会证明协议对上述种种不利，则请惩办我们不经请示、自作主张之罪。”
听了阿沛·阿旺晋美的解释和说明，与会人员一致认为协议很好，表示拥护。于是，大会通过了呈报达赖的如下文稿：“签订的‘十七条协议’，对于达赖之宏业，西藏之佛法、政治、经济诸方面，大有裨益，无与伦比，理当遵照执行。”
达赖喇嘛看了西藏全区大会呈送的报告后，即于1951年10月24日致电毛泽东，表示拥护“十七条协议”，愿意“积极协助人民解放军进藏部队，巩固边防，驱逐帝国主义势力出西藏，保护祖国领土主权的统一”。后来，这份电报被作为重要文物与历史见证，存放在西藏历史档案馆里。