131I的治疗量对男女生殖器官影响很小，所以甲亢经131I治疗后不会影响生育能力，所生育的后代早产儿、死胎及先天畸形的发生率也未见增加，不育症的发生率与正常人群无显著差异。
尽管一次131I治疗量的放射损害不及一次胃肠透视放射损伤大，有些学者还是进行了深入的研究，有人观察131I治疗的患者染色体有变异，但可以逐渐恢复正常。
因此，131I治疗后增加基因突变和染色体畸形的危险性很低。但考虑到电离辐射的远期效应及遗传效应，须长期随访观察才能得出正确结论。为了保障下一代和隔代子女的健康，临床仍将妊娠期列为131I治疗的禁忌症。