噬菌体的种类繁多，一共可以分为10科，各科名称和特点如下：
1.肌病毒科
肌病毒科噬菌体具有一个正多面体的头，和一条尾巴以及尾巴上一条可收缩的尾鞘。它是一种复合形态的噬菌体，核酸为线型双链DNA。T2、T4噬菌体是这一科的噬菌体代表种。
2.长尾病毒科
长尾病毒科的噬菌体具有一个正多面体的头，和一条长长的尾巴，只是它没有可以收缩的尾鞘，它的核酸为线型双链DNA，其中λ、T5噬菌体为这一种噬菌体的代表种。
3.短尾病毒科
短尾病毒科的噬菌体，具有一个正多面体的头，和一条长约20纳米的短尾巴，核酸为线型双链DNA，其中T7、P22噬菌体为这一科的代表种。
4.被脂病毒科
被脂病毒科噬菌体的毒粒，是一个直径约60纳米的正二十面体，在它的各角顶上有许多刷状刺突，它没有尾巴，衣壳可以分成内外两层，衣壳的两层之间为充满了脂质，核酸为环型双链DNA，PM2噬菌体为它的代表种。
5.覆盖病毒科
覆盖病毒科噬菌体，它是一个直径约65纳米的正二十面体，它的各角顶上分别有一长20纳米的刺突，衣壳也可以分为内外二层，内层含脂质。在其射出核酸时候，会出现一条长约60纳米的类似尾结构，它的核酸为线型双链DNA，其中PRD1噬菌体为它的代表种。
6.微病毒科
微病毒科的噬菌体，它有一个直径约27纳米的正二十面体，它的各角顶上分别有一个类似结节状的刺突，核酸为环型单链DNA，ΦX174噬菌体为它的代表种。
7.丝状病毒科
丝状病毒科的噬菌体，它整个外面呈一长丝或短杆状，核酸为环型单链DNA，其中fd噬菌体为长丝状的代表种，而MVL51噬菌体则为此科短杆状的代表种。
8.光滑病毒科
光滑病毒科的噬菌体，是一个直径约23纳米的正二十面体，核酸为线型正链的单链RNA，它专门感染雄株细菌，MS2噬菌体为此科噬菌体的代表种。
你可以发现，我们介绍的以上8科的病毒粒外面都不具囊膜，而以下两科则均有囊膜。
9.原质病毒科
原质病毒科噬菌体的病毒粒，直径50～120纳米，是一个呈多形性的球形，有柔韧的囊膜而没有衣壳，核酸为环型双链DNA，MV-L2噬菌体为此科噬菌体的代表种。
10.囊病毒科
此科病毒粒是一个正多面体，直径约75纳米，外有柔韧的含脂质的囊膜包裹，内有一个直径约60纳米的核衣壳，核酸为分成3个片段的线型双链RNA，Φ6噬菌体为此科代表种。
肌病毒科、长尾病毒科和短尾病毒科是目前最常见的噬菌体，其中T系大肠杆菌噬菌体是被人们研究得最多的一种烈性噬菌体，而λ大肠杆菌噬菌体则是被人们研究得最深入一种温和性噬菌体。其他各科的噬菌体都很少见。