精油浓度很高，能很快由皮肤渗透到体内，进入血液循环，而每个人的体质是有差异的，有时就容易产生一些不良反应。如玫瑰精油能软化皮肤，一般不会造成过敏，但如果皮肤处于敏感期，用玫瑰精油也可能使皮肤出现红点。柠檬精油虽然有美白作用，但精油中的成分与阳光接触后会产生“光毒反应”，在体内经生物转化产生毒性从而令皮肤过敏。
一般的精油说明书都要求用量在“1～3滴”或“3～5滴”，但有人为了效果显著总喜欢多滴一些。殊不知，过量使用精油可能适得其反。如泡澡时滴5滴熏衣草精油，可做安眠的睡前浴，但是如果滴入了10滴以上，它就变成了兴奋剂，让你整晚也别想睡着。天竺葵精油在情绪暴躁时使用，有安静镇定作用，但用多了，反而会给情绪“火上浇油”。
此外，有些精油过度使用会对身体造成一定的伤害，在熏衣草单方精油中，醋酸沉香醇和沉香醇两种成分占88%，而醇类与酒精一样，过量使用会对肝脏造成损害，导致肝功能下降、交感神经过分受压制而麻痹，表现为血压上升等症状。此外，如果将单方的精油直接涂抹在身上，还容易灼伤皮肤，使皮肤发黑。另外需要注意的是，使用精油时要注意通风，否则不仅影响效果，还会感到不适。