东突厥的危机被暂时化解，李世民的精力再度集中到大唐的内政上来。此时有一件事始终压在他的心头，沉重的让他透不过气。说起来，还是他的家务事。说直白了，就是如何处理建成和元吉的身后事。尽管处理了十个侄子，赦免了建成和元吉的余党，但事情还没有完，究竟该如何给这两个手足兄弟盖棺定论呢？难道 “犯上作乱“四个字就能了结一切吗？李世民不断的在心中问着自己。兄弟？死敌？对手？我们兄弟三人到底是什么关系？为什么到头来如此扭曲？沉思数日之后，李世民下诏，追封故太子建成为息王，谥号隐王；追封齐王李元吉为海陵王，谥号剌王，按照亲王之礼，重新安葬。葬礼是给死人办的，同时做给活人看的。李世民就是要用两个兄弟的葬礼向天下表明自己的胸怀。其实葬礼两个兄弟已经不需要了，总不能为了这次隆重的葬礼让两兄弟再死一回。从心底说，是李世民自己需要这样一场宏大的葬礼。只有这样，他才能在心中将玄武门这一页翻过去。出殡的那一天，他登宜秋门望着兄弟的灵柩哭泣，哭得谁也拦不住。在哭声中他回到了兄弟们亲密无间的岁月，在哭声中他想起了当年一起生活的点滴。哎，该死的皇权，该死的王者天下。
在魏征和王珪建议下，李世民亲自护送两兄弟的灵柩到了墓地，并亲眼看着灵柩下了墓穴埋上了黄土。从此一母同胞的兄弟四人只剩下他孤零零的一个人。从此李世民怕过重阳节，因为在这一天，他，“遍插茱萸只一人“。兄弟入土，竞争结束，从此贞观就是李世民一个人的贞观。无论皇位如何得来，无论过程是否流血，这一切已经不重要了，重要的是你要对得起你所得到的东西。因为来自不易，所以倍加珍惜。一般人如此，李世民更是如此，至少他要对得起曾经与他争斗的兄弟，至少他不能让兄弟在九泉之下还戳他的脊梁骨。这一定是一个开天辟地的贞观之世，李世民在心中暗暗发誓！竞争结束了，危机解除了，也该到了为大臣们论功行赏的时候。公元626年九月二十四日，李世民亲自拟定功臣的行赏名单，房玄龄、长孙无忌、杜如晦、尉迟敬德、侯君集五人并列第一，五人均封为国公，实封一千三百户。要说李世民也是个挺民主的领导，评定完功绩后，还不忘跟大家客套一下：朕叙卿等勋赏或未当，宜各自言。意思是说，我评的可能有不得当的地方，大家心里有委屈的，有不服的尽管说出来。无疑，李世民也就是跟大家客套一下。
李世民只是跟大家客套一下，还真有人不跟他客套，这个人就是他的堂叔淮安王李神通。李神通腾地站了起来，直愣愣盯着李世民说道：“当年起兵，我首先响应，如今论功却让房玄龄、杜如晦这些只会耍笔杆子的人排在我前面，我不服！“李神通发炮，其实正中李世民下怀。李世民正等着拿这样一个老牌皇亲开刀。李世民望着自己的堂叔，看似温和而又不失威严的说道：“当初起兵，叔叔是第一个响应，可你也是为了自己躲避祸事；窦建德征战山东时，叔叔你全军覆没；刘黑闼再次作乱时，叔叔你望风而逃。相比之下，房玄龄、长孙无忌这些人运筹帷幄，策划军机，安定社稷，论功在你之上难道不对吗？你虽是朕的叔父，但无功也不能滥赏！“李世民的话说完，李神通眼睛直扫地面，恨不得找个地下室钻进去。其他原本还有牢骚，还有不忿的都把话咽到了肚子里，连皇叔都没有资格争功，其他人就更没有资格了。
总体而言，秦王府资深旧人基本都得到重用，但并非滥用。因为李世民知道，此时的他是大唐皇帝，是一国之主，而不只是秦王府一府之主。这时的李世民要做到胸怀天下，泽被众生，就绝不能因私废公。在此次论功行赏之后，秦王府已经成为过去，李世民用人再也没有府第的区分。无论是前太子府，还是齐王府的人，只要能用，只要有才，那么你就能成为李世民的螺丝钉。魏征在历史上的名望实在太高，高过了长孙无忌，高过了房玄龄，高过了杜如晦，更被树成了“千古良臣“的典范。事实上，我要说，魏征被严重拔高了，甚至被拔高到不像人而像仙的地步。历史上的魏征，其实很务实，很功利，很会投李世民所好。他与李世民的君臣际遇与其说是千古君臣之典范，不如说是君臣二人联袂给世人演出的政治双簧。他俩演的是相声，互为捧逗，彼此都是对方的托。
李世民为什么要起用魏征呢？一是因为魏征确实有才，二是因为魏征身上的符号意义：太子余党。在当时，没有比魏征更大号的太子余党。当年正是他和王珪劝说李建成出征刘黑闼，抢了李世民到手的战功。再后来甚至屡次建议李建成早点动手除掉李世民，对李世民下黑手到这个程度，魏征不是太子余党谁又是呢？原本李世民对于这个魏征也是恨之入骨的，玄武门之变后，李世民找来魏征，冷冷地扔出一句话：“你为什么要离间我们兄弟？“魏征倒是一幅死猪不怕开水烫的坦然模样，故作平静地说道：“太子如果早点听从我的话，就没有今天的灾难了！“历史总是有惊人的相似，魏征与李世民的一问一答，与汉初韩信谋士蒯通与刘邦的问答几乎如出一辙，结局也有惊人的相似。所不同的是，蒯通只是免除了杀身之祸，而魏征却就此搭上了唐朝的权力快车。看着倔强的魏征，李世民突然没有了怒火，甚至发现眼前的这个人有一点可爱。
事实上，现在要杀魏征对于李世民而言太容易了，而杀了魏征又有什么意义呢？毫无意义。李世民死死盯着魏征，他意识到，眼前这个人不就是自己所需要的吗？以他的经历，终其一生是不可能与秦王府的旧将融成一体的，因为他注定进不了秦王府旧将的圈子。如果自己将他大赦，进而重用，那么他能不对自己肝脑涂地吗？此人不正是制衡秦王府旧将势力的最佳人选吗？众里寻他千百度，暮然回首那人却在灯火阑珊处，就是他了！李世民随即和颜悦色，对魏征以礼相待。杠头魏征没有等来杀身成仁的机会，等待的却是李世民的格外垂青，当场被任命为太子宫总管府秘书官。从此以后，你魏征就是我李世民的人了。魏征，你愿意成为李世民的下属，无论生死，无论贫富疾苦吗？魏征在心口刻上了三个字：我愿意。与魏征同时被重用的还有魏征的两位前同事，被李渊发配到隽州（今四川西昌）的王珪和韦挺。王韦二人被紧急从隽州召回，一路忐忑不安下定决心杀身成仁，结果等来的却是李世民的委任状，双双出任门下省谏议大夫，从此与魏征一起成为李世民的朝臣。