结果不久之后，杨素发动攻击，连萧摩柯都被生擒了。杨琼根本不知道抵抗，他的绝招就是跑，如果条件允许的话他老人家很可能一口气跑到月球上去再也不回来了，在那里建立一个国家继续作威作福。只是当时还没有宇宙飞船。所以他只能跑到晋阳大本营。
政府军尾随而至，王頍打算投奔突厥，但是后来发现杨素用兵的确有一套，所有的出路全都被堵死了，晋阳成了一片孤岛，肯定也是跑不掉了。于是王頍就对自己的儿子说：“我的谋略不比杨素差，只不过杨琼不听我的这才失败，我不能等在这里让他们抓住，让他们长脸，我死了之后，你继续逃命，无论如何，不可以投奔亲戚朋友。”
说完话之后，王頍干脆利落地抹了脖子。小儿子听老爹的话赶紧逃走，几天几夜没有饭吃，只要去投奔亲戚朋友，跟他老爹预料的一样，立即被人出卖，没过几天就被警察给抓走了，斩首示众。
造反派的头子杨琼也被生擒了，现在面临的问题是应该把他怎么办，毕竟也是皇上的亲弟弟，别人没权利处理呀。但是大家的意见却是很统一的那就是杀，以儆效尤。可是杨广毕竟要展示他仁慈的一面，他又开始表演了，不同意，我怎么能杀自己的弟弟呢，我是那样的人嘛，我是一个圣明的君主好不好。至于我杀老爹，那是迫不得已。
杨广只是把杨琼囚禁起来，把他所有的亲属全都贬为平民，刘芳岭南的有二十余万家。当年杨坚曾经跟满朝的文武官员夸口说：“古代的那些帝王，偏爱小老婆，嫡子和庶子只见经常发生矛盾，但现在我的儿子全都是一个娘生的，根本不会出现这样的问题。”可是现在，很明显他已经打了自己的脸，五个儿子基本全都报销了，真不知道他泉下有知，会不会跟独孤伽罗吵翻了天。