慢性前列腺炎有细菌性和无菌性之分，如何才能将二者加以区别，这是一个很实际的问题，因为只有分清了是细菌性前列腺炎还是无菌性前列腺炎，在治疗时才能对症下药，取得良好的效果。通常可以从下面五个方面将二者加以区别：
二者除都具有慢性前列腺炎的一般症状外，慢性细菌性前列腺炎常伴有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激表现，而无菌性前列腺炎则尿路刺激表现常不明显。
直肠指检时，慢性细菌性前列腺炎患者前列腺大小正常或稍增大（饱满），或缩小（纤维化），质地偏硬，常有压痛，而无菌性前列腺炎患者的前列腺大小正常或比正常略大，质地柔软，无明显压痛。
慢性细菌性前列腺炎患者的前列腺液镜检可见白细胞（脓细胞）明显增多，卵磷脂小体减少或消失，而无菌性前列腺炎患者的前列腺液中白细胞数接近正常或稍增多，卵磷脂小体减少不明显。
慢性细菌性前列腺炎患者的前列腺液细菌培养常能培养到致病细菌，而无菌性前列腺炎则培养不到致病细菌。
慢性细菌性前列腺炎患者的尿液及前列腺液分段定位培养呈阳性，而无菌性前列腺炎呈阴性结果。