来到主岛的第四天，陈军差不多已经与岛上的四大管事混熟了，特别是建设管事托迩塞，他是一个经验丰富的老船工。
陈军在莫加岛的南边看中了一个内凹的海岸，那里十分有利于建造一个船坞。
在地球近代，船坞可分为干船坞和浮船坞，干船坞造在岸边，浮船坞是浮于水上并可移动的船坞。
陈军命令托迩塞建造的船坞当然是干船坞了。
干船坞三面接陆地一面临水，其基本组成部分为坞口，坞室和坞首。坞口用于进出船舶，设有挡水坞门，船坞的排水设施就建立在坞口两侧的坞墩上；坞室用于放置船舶，在坞室的地板上设置支撑船舶的龙骨墩和边墩；坞首也算是坞室的一部分，这里被陈军设计成了修理室，船工们从这里进出船坞，修理船只的工具也被放置于此。
经过陈军的悉心指导，船坞终于在一个月内完成了。
这个魔幻世界的人们，修理船只时都是把船拖上岸后再修理，船坞的概念他们根本没有。
当黑珍珠号进入干船坞修理时，灌泄水设施向坞内充水，待坞内与坞外水位齐平，打开坞门，利用绳索将黑珍珠号慢速牵入坞内，之后将坞内水体排干，使船舶坐落于龙骨墩上。
如此巧妙的设施，让所有人都佩服于陈军的智慧。
“艾力克，你不愧是博学多才，这样的办法都能被你想到”参与了建造船坞的托迩塞不得不佩服陈军的智慧。
陈军心里暗想“这样就让你们惊奇了，我还有很多的先进理念要拿出来呢。”
不过他嘴上却说道：“书上，我是从书上得到的启发。”
有了船坞，陈军第一件要做的事情当然是给黑珍珠号增加个船尾舵了。
托迩塞很不解：“为什么要在船后尾上装这样一块木板？”
“当然是为了控制船的方向了。”
“控制方向？我们不是有侧浆控制方向吗？”
这里就像是地球古代欧洲一般，使用的都是侧浆，不管是大型船只还是小型船只都是如此。中国应该是最早使用船尾舵的国家了，可追述到汉代以前，欧洲是12世纪才从东方学去的。
陈军制作船尾舵不仅是为了控制方向，还有一个原因就是为了增加纵帆。
纵帆也是中国最早发明，大概在公元3世纪的战国时代就有了，欧洲到13世纪才学去。
利用纵帆有个必要条件，就是要灵活的调整船头方向，这就得靠船尾舵。纵帆的好处是能利用分力、合力的原理，可以‘船使八面风’，就连当头风都能行驶，这也就是所谓的‘调戗使斗风’，调整船头的方向，把当头风逆风变成侧斜风，这样它就能推动船只呈之字形前进了。
陈军还为黑珍珠号增加的三角帆，三角帆的好处是较容易操作。
这下有了三角帆，纵帆和船尾舵后，水手们就能更加放手的利用风力了，这也就导致了桅与帆数目的增加，尤其是风帆数目的增加，因为使用多个比较小的帆，比使用单个大帆操作起来容易。
陈军在黑珍珠号上竖立起了四根桅杆，前桅和主桅挂横帆，后桅挂三角纵帆，最后第四根桅杆挂的是三角帆。还有船头伸出一根斜桅，上面挂一张小帆，并在主帆和前帆上各加一面上桅帆和顶帆，这样就既能充分利用风力，有速度，又比较灵活，便于操纵，可以在各种风向条件下行驶。
风吹在风帆上部时会有升力，升力过大就会使船只倾覆，顶帆和三角帆能让升力适度，有助于船只的稳定航行。
熟悉的运用风帆起码得有一段时间，陈军也并不在行，这需要各个水手自己去摸索，陈军只是给他们具体分工，明确指定了一批专门操作风帆的水手。
操纵风帆和操纵船尾舵的水手必须要统一合作才能发挥出效果，陈军为此专门指定了一位大副，用以管理舵手和操帆手，做好协调。
经过几个星期的操练，水手们都非常熟练的掌握了新型操船技术，船只的速度提升了一倍多，灵活度更是超过之前太多，起码也有个三倍。
“要是我们的主桅帆和前桅帆都能用上高级的魔法风帆，那速度将再快上许多。”托迩塞感慨的说道。
现在黑珍珠号只有主风帆上用了一面魔法风帆，此魔法风帆上有一个疾风魔法阵，由四个吸风阵，八个聚风阵，十六个旋风阵所组成的疾风魔法阵，属于中级魔法风帆。
黑珍珠号是楼船，楼船容易倾覆这是不争的事实，可这也没办法，谁让这个魔幻世界处于冷兵器时代，海船交战最后决胜负的还是依靠接舷近战，这就使得哪艘船载人越多，就越容易获得胜利，所以才会有元宝巨舰这种大型巨无霸的产生。
陈军很想拆掉艏艉的楼堡，可考虑到这也许会影响船只的平衡，最终放弃了。
不过陈军很快就想到了好主意，那就是建造水密隔舱。
陈军把黑珍珠号最底下一层的舱室淘空，然后用整齐的木板封起来，木板之间的缝隙就用腊、鱼油塞住，再盖上一层鱼皮，上面再加一层木板，再用腊，鱼油……，如此反复三次，这样水密舱就完成了
地球上，水密隔舱技术也是发源于中国，16世纪还是17世纪才被欧洲人学去，水密隔舱不但能大大增加船体强度，更重要的是不至一处破损就水漫全船，难以封堵。有了水密隔舱，才算是到了帆船时代的最高水平。
至此，陈军的黑珍珠号已经远远超前于这个魔幻世界的船只技术。
不管是在速度上，稳定性上，耐久度上，还是性能都是超一流的了。