聂人凤在讲谈仁皓与廖鸿鹏两人拟定的海军装备发展报告递交给薛希岳首相的同时，还交上了一份海军改组计划书。这份计划书是由聂人凤亲手制订的，而计划的核心内容就是全面改组帝国海军的编制！
从萨季亭元帅开始，帝国海军改组的消息就传了出来。不过，萨季亭还没有来得及实施海军改组计划就黯然离开了。姜邦国在任期间，重点全放在了反击作战上，根本就没有过问海军改组的事情。现在，聂人凤上任，而他首先搞的就是海军的全面改组，将反击计划放到了一边去。显然，聂人凤元帅的态度更稳重，而且更重视基础性的工作，这才是帝国海军的希望所在。
聂人凤提出的海军改组计划非常全面，大到海军司令部的编制，小到普通官兵的安排，各方面几乎都照顾到了。也许，只有聂人凤才能够提出这样的改组计划来，因为他比任何一个人都了解帝国海军，了解海军中存在的问题，以及知道该用什么办法来解决这个问题。当然，这还得算上聂人凤在海军中的地位与人气，没有他的影响力，那么他提出的海军改组计划也就没有任何成功的可能。
下放作战大权是改组计划的核心内容。在帝国海军现行的体制中，舰队，以及各地方基地的控制大权实际上是掌握在海军司令部手里的。这是帝国海军从一战中沿用下来的一套制度，而当初制定这一套制度的目的是要集中海军的所有力量来反击敌人。这套制度让帝国在一战后期获得了数次有决定性意义的海战胜利，从而让帝国避免了战败的结局。不过，现在，这套制度显然不太适合快节奏的战争方式了。
在聂人凤提出的计划中，将帝国海军所活动的海域划分成了四个片区，分别是西太平洋战区，太平洋战区，印度洋战区，以及南大西洋战区。而且，今后还可以根据海军活动范围的扩大，适当的增加新的战区。
在各个战区中，将设置一名战区司令官，而战区司令官将负责该战区内所有海军舰队，海军陆战队，以及海军基地的活动与作战行动，具有决定战区内作战行动的大权，并且只需要向海军司令部汇报作战计划，而不需要由海军司令部来下达作战计划。这实际上就是把原本属于海军司令部的部分大权直接下放到了战区司令官的手里，战区司令官可以根据所在战区的实际情况来调动战区内的舰队，基地部队等等作战力量，遂行作战行动，并且完成作战计划。
在各个战区中，都编制了一支主力舰队，以及数支巡防舰队。而舰队名称则与战区名称相同。比如西太平洋战区所属的舰队就为西太平洋舰队。各舰队设置舰队司令官一名（在战争初期，舰队司令官与战区司令官基本上是由同一人担任），具体负责舰队作战行动，具有实际的舰队指挥大权。而舰队司令官将直接向海军参谋部直接负责。
另外，各战区下设各基地司令部，基地司令部设基地司令一名，这些基地司令直接向战区司令负责，而不需要向海军司令部负责。战区司令可以在战区权限范围之内安排基地司令官，也就是说，战区司令官具备了部分人事大权。
同时，聂人凤还对海军司令部的结构做了调整。海军参谋部得以保留，不过其主要任务是协调各战区的作战行动，以及配合行动，另外负责协调各舰队的行动。因为各战区的舰队并不固定，比如某舰队在西太平洋战区执行作战任务，即为西太平洋舰队，如果后来前往印度洋执行任务，则为印度洋舰队（这是在战争中期单独设置战区司令的一个重要原因）。因此，海军参谋部的主要职责，就是协调各舰队的行动。
海军司令部还另外设置战略处。战略处的主要工作就是制订海军的战略计划，以让各战区司令部，舰队配合完成战略计划。设置情报处，主要负责处理情报，并且直接向各战区司令部，舰队提供情报支援。后勤部降级为后勤处，负责为海军筹备战争物资，并且为各战区，舰队调配战争物资。人事部降级为人事处，主要负责新兵，新军官的安置与分配工作。装备发展处，主要负责监督海军舰艇战机以及弹药等等装备的制造与研制工作。
可以说，聂人凤完全是按照战时体制对海军进行了一次全面改组。新的海军体系的任务就是将海军的战斗力都发挥出来，战胜敌人，并且取得最后的胜利。而这其中，最大的亮点还是新的舰队编制体系。
新的舰队编制中，已经直接取消了以战列舰等主力战舰为核心的体制，舰队的基本组成是各类型的编队，比如航母编队，战列舰编队，巡洋舰编队，驱逐舰编队等。而舰队司令官可以根据实际的情况，从这些编队中挑选某些编队，或者是某些战舰，组成特混舰队，然后以特混舰队的方式执行作战行动。比如，西太平洋舰队可以编制第一特混舰队，而在第一特混舰队中可以出现航母编队，战列舰编队，巡洋舰编队，驱逐舰编队等。而特混舰队的指挥大权直接由舰队司令官掌握，或者是由舰队司令官任命其他人员为特混舰队司令官，由其指挥特混舰队执行作战任务。
在这个新的舰队指挥体系中，舰队司令官的权限在某些方面得到了加强，不过在某些方面也被削弱了。而为了平衡权力，舰队司令官仍然是中将，特混舰队司令官是少将，或者准将，而各编队司令官为准将。新的舰队编制体系的一个重要特点就是，各舰队可以根据实际的情况来灵活配置舰队的战斗力，以期用最小的代价获得最大的胜利。这要比之前的旧式舰队体系先进得多。