稽查组：负责监督军队各个将士的行为并发现军中所存在的问题，所有被他们判定会损害到军队利益的行为都会被他们上报给，执法组和审讯组。该小组只拥有监督和上报的权利无权对对违规的将士执行抓捕。
执法组：负责对军队中违反了军规的将士进行抓捕的执行小组，同样的他们的抓捕权利只来源于稽查组的举报，如果没有确实的证据或军方的调令他们无权对怀疑对象进行抓捕。
审讯组：相当于军中的军事法庭，负责对军中的违规的将士的处罚仲裁。
这三个小组组成了一个三位一体的监查执法审讯整体，各司其职又紧密配合，保证了执法的公正公平公开。使得军团各个将领都最大程度地约束自己，避免触犯军法而受到惩罚。
教义组：在大陆各军团里大部分都是由皇室和教会的祭祀担任负责对军团将士的思想教育并传授文化等等。以保证各个将士对皇室教会的绝对忠心，只是黑旗军的情况比较特殊因此教义组的成员依然是原来各个兵团的祭祀们所担任，不过根据三大部落合并的特殊情况黑旗军在教义组中又添加了一项更为人性化的沟通融合小组，负责对各部落之间的沟通协调工作，而这一组的成员大部分都是年轻漂亮的各部落的少女。这一决定立刻受到了三大兵团各将士的一致欢迎相当于现代军队中的文工团。当然现在的基地里除了银霜和她身旁的几个侍女还找不到其他的女孩来担任，不过相信要不了多久三大部落肯定会挑出适合的人选补充进来。
这无疑是件令人期待的好事啊！
这让我不得不感叹，玛法世界的军事体制居然如此健全和人性化。恐怕就算是在现代的军队之中也未必比他做得更好了吧。
抚恤组：负责军团阵亡将士的家属抚恤军的发放以及理赔调查等等情况，使得军团将士可以毫无顾忌的投身战斗之中，而不必担心阵亡之后家人生活保障。这也是玛法大陆的战士们为何作战的时候一直都非常的勇猛顽强。这其中抚恤组严格的执法力度发挥了至关重要的作用。
总务组：负责整个政教组的协调沟通工作以及人事安排等等。
后勤部：负责整个军团的后勤供给。这其中包括了！
财务组：负责军团将士的军饷的发放！
军需组：负责统筹整个军团物资的调配作业。
军械组：负责铠甲刀剑以及所有其他战时必须用到的防具武器的保养维护以及生产锻造等等。
粮资组：负责军队粮草的供给分配。
总务组：负责整个后勤组的协调作业以及人事安排等等。