于是，战争开始了。
一开始是双方被害人的亲友之间的冲突，但逐渐波及到整个星球，当数个星球都开始战争的时候，其他星球的两大阵营的人也不得不开始了战斗，到后来，作为母星的地球也参战了。整个太阳系空间，数十颗星球，宽达几千光年的空间一起陷入了战乱
当时人类自生的力量已经达到一个恐怖的境地，其中的佼佼者如四大首席长老甚至可以以一己之力摧毁星球，破开空间。如此多，如此强大的力量相互碰撞的直接后果就是空间紊乱，自然崩溃。
第三十七章云南之行第十一节
战争仅仅持续了数十年，一开始双方相持不下，赞成冲出去的人大多数是新生代的年轻人，虽然也有“玄”“黄”二长老等高手，但实力上还是比“天”“地”二长老率领的坚持等待盘古的一方要差很多。一方人多，一方人强，战争呈拉锯的形势。
但没想到的是战争的后期，双方都杀红了眼之后，反对等待盘古的一方有数个人类包括“玄”“黄”二长老突然掌握了一种吸收其他人灵魂力量增强自身的方法，战事就从相持不下变为一边倒了，他们一方的人类大量使用种方法疯狂吸收被杀死的灵魂，整体实力大增。而“天”“地”长老这一方虽然较强，拥有许多长老级别的高手，但只要一死就无法复活，而且力量还被吸收，因此很快就被对方占尽优势。
最后，“天”“地”长老这一派战败了，仅有十几人能够存活，并销声匿迹。但胜利者一方同样付出了沉重的代价，能活下来的，不足千人。
数个星球在战争中被摧毁，盘古传下的经过亿年发展的文明被毁于一旦，大量的能量乱流肆虐，无数的空间裂缝遍布，整个空间变得混乱不堪，地球几乎又回到了最原始的状态。如果不是盘古沉睡前就下了结界，那么所有的一切全都逃不过毁灭的命运。
此时，面对这种景象，再说要冲出去，那就是一个笑话。自己的家成了这样，谁还能安心的出门？
于是胜利者们开始了重建工作，并且在地球废墟上寻找盘古留下的生命种子。这些剩下的人基本上已经失去原来的性情，个个都是力量狂，说是重建其实是为了找到生命种子之后，产生大量的人类，给他们制造新的灵魂。
这帮人个个力量强大无比，并且各有所长，不到千年，地球重新恢复了生机，生命种子也被找到，新的人类开始产生。
不过对于怎样利用这些新的人类，新的灵魂，他们当中产生了分歧，并且越闹越大，最后也分成了两派。由于刚经历一场大战，两方都是伤兵满营，并且相互之间对于各人的力量技巧了若指掌，冲突就没有加大，通过谈判，将地球划为东西两个区，各占一方，互不来往。