1964年12月至1965年1月的中央政治局召开的全国工作会议，是党内高层矛盾进一步演变的关节点。会前，总书记******认为是一般性的工作会议，曾好意地说，主席身体不好，就不必参加了。毛很不高兴，执意要参加。在会上，毛讲话时，刘多次插话，这种现象过去是不多见的，毛对此很恼火。当毛讲到，这次运动（四清）就是两个阶级、两条道路的斗争，强调要整党内走资本主义道路的当权派时，刘少奇没有随声附和，而是表示了明确的保留态度。他插话说：“各种矛盾交叉在一起，有四清四不清的矛盾，有党内外矛盾的交叉，很复杂，还是有什么矛盾解决什么矛盾为好，一切从实际出发，不要什么都上升到敌我矛盾。”******当时就非常生气，对刘怒目而视。刘当时还没有察觉，会后有人马上提醒他说主席生气了，刘很后悔，连连责备自己。第二天，******在讲话时大发脾气，说：有两本书，一个叫党章，一个叫宪法，我有参加会议和发言的权利。可是一个人不叫我开会（指邓），一个人不叫我讲话（指刘）。接着刘少奇在政治局生活会上作自我批评，检讨自己对毛不够尊重。但毛认为这不是尊重不尊重的态度问题，而是搞不搞修正主义的政治原则问题。他在此后，又几次不点名地批评刘少奇的“两类矛盾交叉”的提法。******开始考虑要把刘少奇拿下来。
在以后一年多的时间里，虽然刘少奇还是负责中央一线工作，但******已经不再信任他了。毛不仅提出了“赫鲁晓夫现正睡在我们的身旁”这种危言耸听的论断，而且还不止一次地对省市党政主要干部提出“中央出修正主义，你们怎么办？”这样的问题，并提醒他们说“很可能出，这是最危险的。”******认为刘少奇就是正睡在我们身旁的赫鲁晓夫式的人物，他要重新考虑接班人，要把刘拿下来。在一些重要的事情上，他不再与刘少奇及其他常委通气，而是在背后支持江青等极少数人做新的斗争准备，找人搞《评新编历史剧〈海瑞罢官〉》的名堂，以期发动一场新的更大规模的运动。****中央核心领导集团在形式上还维持在统一的领导集体内，但实际上的分裂已经开始了。党内个人崇拜、个人专断的痼疾非但没有因划分一二线的体制而减轻，反而更加难以沟通，而且作为一个集中统一的党，原则性和工作性的问题到中央一层就无法回避，这更加速了权利与责任的离心力量。******最后认定刘少奇就是党内的赫鲁晓夫式的人物。
二、“**********”的发动和刘少奇的被打倒
“**********”开始时，刘少奇等中央一线领导人对******要开展的这场政治运动并没有足够的认识和思想准备。1966年5月29日，刘少奇主持召开 “**********情况汇报会”，****中央政治局主持日常工作的三位常委刘少奇、******、******及有关领导人研究决定，由“中央****小组”组长******率工作组去人民日报社，由****河北********处书记张承先率工作组去北京大学。在几个中央领导同志商定之后，******还当场到隔壁房间用电话向正在杭州的******请示，获得同意。
6月3日，刘少奇主持召开了常委扩大会议，汇报和讨论北京地区“**********”的情况。会议确定，在运动中“内外有别”，“注意保密”，“不搞大规模声讨会”，“不要包围黑帮住宅”等八条方针。决定向北京市的一些大学、中学派出工作组，贯彻八条。
派工作组不仅是当时已经乱起来的客观形式所迫，也是党领导运动的传统方法，而且还有******批准派工作组到人民日报和北京大学的先例可援。刘少奇力求把运动纳入党领导的轨道，支持工作组领导运动。6月20日，刘少奇批发了北大工作组处理5月18日乱批乱斗“牛鬼蛇神”事件的简报，要求各单位参照北大工作组的办法，处理类似事件。 刘少奇还批转了一些地方给中央的有关“假****”闹事的报告。根据这些指示精神，北京市开展了“反干扰”运动，各地也对反工作组事件进行了程度不同的处理，反工作组的激进学生受到打击，有些甚至被审查批判。尽管这种处理方式有些简单生硬，局势终究是平稳下来了。但******的思路是“天下大乱，达到天下大治”，要充分发动群众起来“革命”。刘少奇的做法，自然引起了他的不满。
7月18日，******从武汉回到北京，首先听取******、江青等人关于工作组的汇报。7月24日，25日，******召集中央常委和“中央****小组”成员开会，指责工作组“起坏作用，阻碍运动”，批评了刘少奇、******，作出了撤销工作组的决定。这使刘少奇等中央一线领导陷入极为难堪的境地。7月29日，刘少奇在北京市大专院校和中等学校“**********”积极分子大会上的讲话，表示了这种无所适从的心境。他说：“**********怎么革，你们不晓得来问我，我老实回答你们，诚心回答你们，我也不晓得，我想党中央其他许多同志，也是不晓得。”“现在只能讲一句话，放手发动群众”。
为了弄清“**********”究竟怎样搞，响应******要求高级干部亲自参加北京各学校的运动的号召，刘少奇于8月1日至4日亲自来到北京建工学院蹲点。
8月1日，根据******提议，八届十一中全会召开。8月4日，******在常委扩大会议上讲话，极其严厉地指责派工作组是犯了“镇压”群众的“路线错误”。刘少奇就工作组问题主动承担责任，******接过话头说：“你在北京****嘛，专得好！”当叶剑英讲到我们有几百万军队，不怕什么牛鬼蛇神时，******声色俱厉地说：“牛鬼蛇神，在座的就有！”8月7日，******写的《炮打司令部》的大字报印发大会，更严厉地批评“从中央到地方的某些领导同志”，“站在反动的资产阶级立场上，实行资产阶级****，将无产阶级轰轰烈烈的**********打下去”，并把工作组问题同1962年、1964年中央工作指导方针上的分歧联系起来，明确指出党中央内部有个“资产阶级司令部”，否定了以刘少奇为代表的中央一线领导。刘少奇这才意识到自己“犯了严重错误”。从8月8日下午开始，会议转入讨论******的大字报，批评矛头指向刘少奇、******。这次全会改选了中央领导机构，刘少奇从第2位下降到第8位，实际上已经靠边站了。他不再参与中央的日常工作，不再过问“**********”的事情，开始闭门思过，按******的《炮打司令部》大字报的调子写检查。******《炮打司令部》的大字报通过各种非正式渠道很快流传到社会上，不久即出现针对刘少奇的大字报。
撤销工作组以后，“**********”进入革命造反的激进时期，刘少奇及其派工作组问题被作为一条压制革命的“资产阶级反动路线”。10月9日至28日，******主持召开了以“批判资产阶级反动路线”为主题的中央工作会议。******、****先后作长篇讲话，点名批判刘少奇、******“执行了资产阶级反动路线”。他俩的讲话得到******的批准，大量印发到群众之中。会上一些人指名道姓地批判刘、邓，调子越来越高。10月23日，刘少奇、******在全体会议上作检查。刘少奇的检查有三方面的内容。首先，他讲了工作组50多天的情况，表示要负主要责任。其次，他讲了历史上犯了“一些原则性和路线性的错误”的情况，着重讲1962年和1964年的事情。再次，他检讨了自己犯错误的原因是不理解运动，怕乱，错误估计当时运动的形势，思想上还存在许多唯心和形而上学的观点，最根本的是没有学好和掌握好******思想。刘少奇在检讨中不得不违心地承担了许多责任。******事先早就看过刘少奇检查的初稿。9月14日，他在初稿上批示：“少奇同志：基本上写得很好，很严肃，特别是后半段更好。建议以草案形式印发政治局、书记处、工作组（领导干部）、北京市委、中央****小组各同志讨论一下，提出意见，可能有些收获，然后酌加修改，再作报告，可能稳妥一些，请酌定。”刘少奇当然照办，但当刘少奇的检查作为正式文件下发时，******的批示被删掉了。
******在中央工作会议上的讲话，对刘、邓的问题讲得比较和缓。10月24日晚，他在汇报会上说：“把刘、邓的大字报贴到大街上去不好”，“刘、邓二人是搞公开的，不搞秘密的。对刘、邓要准许革命，准许改。”“对少奇同志不能一笔抹煞”。在10月25日的全体大会上，毛讲话又说：“中央分一、二线，我也有责任，路线错误，改了就是了。”“也不能完全怪刘少奇同志、******同志。他们两个同志犯错误也有原因”。他还说，“北京的问题，到现在可以说基本解决了。”可见，******这时对刘少奇采用的是党内矛盾的处理方法。但会后，群众性的造反行动更加激烈。社会上攻击刘少奇的举动不断升级。10月下旬，北京有的红卫兵组织贴出了打倒刘少奇的标语口号。******此时也不同意把刘少奇问题捅到社会上，还派******去清华、北大制止过贴刘少奇的大字报。******、陶铸等中央领导也多次对群众讲，反对提“打倒刘少奇”的口号。
从1966年12月中旬起，打倒刘少奇的举动骤然升级，刘少奇遭受到来自各方面的更严重的迫害。
1966年12月18日，中央成立了王光美专案组，审查所谓“特务嫌疑”问题。名称为中央办公厅丙组，成员4人。12月18日下午，******在中南海西门传达室召见了清华大学著名造反组织“井冈山兵团”头头蒯大富，唆使他们采取行动搞臭刘、邓。12月24日，戚本禹到北京矿业学院对师生们公开说：“刘、邓是党内最大的走资本主义道路的当权派”，污蔑王光美是“彻头彻尾的反革命分子”。12月25日，蒯大富组织了清华井冈山兵团的5000多人，在北京闹市区游行示威，撒传单贴标语，发表演说，把打倒刘少奇、******的口号首先推向社会。12月27日，“中央****”召开北京部分大中学校师生座谈会，江青在会上鼓动说：“两条********的胜负还没有定，阶级斗争激烈得很，刘少奇的检讨不成样子，在干部中没法通过。”她还教唆红卫兵说，对刘少奇“你们要背对背，不要死揪回来，其他怎么做都行。”他们一伙还污蔑纪录影片《刘少奇主席访问印度尼西亚》是大毒草，要红卫兵立即组织批判。12月30日，江青来到清华大学，单独召见了刘少奇女儿刘涛，策动刘涛起来揭发批判刘少奇。江青对刘涛说：“刘少奇问题的性质早已定了，是****反社会主义。现在不打倒他，是因为全国人民转不过弯来，要一步一步来。你要彻底和他划清界限。”随后，刘涛根据访问生母王前提供的材料，写了长达数万字的揭发批判刘少奇的大字报，主要是生活上的事情。大字报经红卫兵小报大量登载、转载，影响非常大。
11月25日，刘少奇陪同******第八次接见红卫兵，最后一次在公开场合出现。此后，刘少奇实际上失去了人身自由，遭到无情的批判斗争，残酷的迫害接踵而来。
12月23日下午，中南海院内出现了第一批点名攻击刘少奇、王光美的大字报。1967年元旦清晨6点钟，一些人到刘少奇住宅院内，张贴书写“打倒中国的赫鲁晓夫刘少奇”之类的标语。1月3日晚，中南海秘书局20多人冲到刘家，张贴标语，勒令刘少奇、王光美站到走廊门口，进行了40分钟的批斗。当他们强迫刘少奇背语录，嘲笑起哄时，刘少奇义正词严地回答说：“你们可以问我毛主席的哪篇文章，写的什么内容，当时的历史背景，针对什么问题，当时所起的作用，理论上有何创新，这才是毛主席思想的精髓。我是《******选集》编辑委员会主任，无论哪篇文章，我都可以解答。”这是第一次对刘少奇进行的面对面的批斗。
1967年1月6日，清华大学“井冈山兵团”的一些人把刘少奇的女儿刘平平扣留在学校，诈称她在学校作检查后的归途中被车轧伤，需要截肢，把刘少奇、王光美骗到了医院，然后劫持王光美到清华批斗。******得知后，立即打电话批评蒯大富，并派秘书到清华大学限令蒯大富放人。
1月12日晚，中办秘书局七八十人先后冲进刘少奇、******、陶铸的住处，对他们进行了围攻批斗。刘少奇受到低头弯腰的批斗体罚。王光美站在一张独腿桌子上挨批。
1月13日深夜，******在人民大会堂临时住处派秘书徐业夫用车接刘少奇来谈话。刘少奇郑重向******提出两条：“一、这次路线错误的责任在我，广大干部是好的，特别是许多老干部是党的宝贵财富，主要责任由我来承担，尽快把他们解放出来，使党少受损失；二、辞去国家主席，中央委员和《******选集》编委会主任职务，和妻子儿女去延安或老家种地，以便尽早结束**********，使国家少受损失。”******沉默了一会儿，建议刘少奇认真读几本书，还特别介绍了德国动物学家海格尔的《机械唯物主义》和法国18世纪哲学家狄德罗的《机械人》。临行时，******亲自送到门口，嘱咐刘少奇“好好学习，保重身体”。刘少奇的辞职要求，不久前曾向******口头提出过。与******的会见，曾使刘少奇的心情宽松了一时。但五天后，中南海电话局一伙造反派闯进刘少奇的办公室，撤了刘少奇的电话。从此，刘少奇与******、******及中央政治局的一切联系都被切断了。
此时，******的态度与要把刘少奇搞成敌我矛盾的江青一伙还是明显有所不同。1967年1月初，北京建工学院的红卫兵组织“八一战斗团”勒令刘少奇到他们学院作检查。******不同意刘少奇去，于1月6日给******一个批示：“总理：此件请你酌处，我看还是不宜去讲，请你向学生方面做些工作。”******执行了这一批示。2月12日至18日，******三次与******、******谈话，对他们说：刘少奇的《论共产党员的修养》，我看过几遍，是反马列主义的。刘少奇看来九大还要选他当中央委员。现在不要挂牌子、戴高帽子。这表明，******当时还是把刘少奇的问题作为党内矛盾，是要以党内********的方式解决的。
三、残酷的迫害和刘少奇冤案的铸成