劳动党中央以及国民党中央，从此不再直接参与政事，所有提案均交由人民议会审定通过，由相关的政府部门再次审议，并提交可行性和调查报告给决策委员会，经决策委员会举行听证会审议批准，再反过来由相关的政府部门实施执行。在这种国家体制下，原国共双方的党务人员，大批地充实到各级政府中，彻底地转换了角色，真正地由党棍变为人民服务的公仆。
我军迅速由空中和陆路进入国统区，临时政府也派出工作团随行，立即开展军政方面的改编工作。国民党军一律原地驻扎接受改编，不适合继续留在部队的国军官兵就地复员，适合条件的高级军官，立即送往太原高级军事学院深造，学习现代的兵器知识和军事理论，回来后基本在原部队任职。
决策委员会专门就二马和新疆问题召开会议，国防部长和西北军区司令员张****等军方将领列席会议，人们都对分裂国家的行为感到十分愤慨。情报部的官员报告，通过无线电监听，发现近日青海的二马，同苏联的通讯十分频繁。部份电文已经被破译，苏联国家安全总局（克格勃）为二马提供了八百万卢布的军事援助，并秘密派出军事顾问团到青海。
就在******同二马交涉的同时，已经对分裂势力不抱任何希望，着手开始布置武力统一的工作。他同决策委员会制定了这次军事行动的原则，首先打掉二马的势力，也是从距离上靠近新疆，然后再根据形势相机而动。派国防部长和总参谋长刘剑锋坐镇西北军区，主持讨论制定对二马的打击方案。我军的将领们对于残害红军西路军的二马，早就恨得牙根发痒，尤其是来自未来的战士，在心目中已经把二马同倭国鬼子相并列了，只是没有腾出手来为西路军报仇。
如果二马顺应历史潮流，实行国共合作加入联合政府，还有可能躲过这一劫。遗憾的是愚蠢的二马，恰恰给我军报仇雪恨提供了一个天然的借口，西北军区司令员张****咬牙切齿憋足了劲，要给不识时务的二马以毁灭性地打击。这次行动意义重大，必须要重拳出击迅速解决战斗，不仅仅是对二马分裂势力的打击，也是对国内其他军阀是一个有力震慑，让他们彻底放弃割据一方的妄想，老老实实地接受联合政府的改编。
其他部队听说要向二马开刀，纷纷致电国防部和总参谋部，甚至把关系都走到了和那里，要求参加这次军事行动。尤其是以中国工农红军为老底子的部队，如东北军区的第三十八军，和原晋察冀部队为主的太原卫戍区的部队，都要亲自为西路军的战友报仇雪恨。但是毫无例外地都遭到的拒绝，指定西北军区的部队完成这次任务，要求快、准、狠、净的完成任务。经过周密的考虑和研究，认为此次作战以斩首为主要手段，而后以装甲部队和骑兵为主要突击力量，陆军航空兵提供有力的空中火力支援，机械化步兵随后巩固战果。
张****司令员将他的精锐部队特工旅，作为斩首行动的主力，暗中同华北军区的野狼团较劲，也要上演一出漂亮的特种作战的好戏，打出西北军区特工旅的威风。总参谋长刘剑锋为这次行动调来米8型直升机八十余架，同时命令空降团作为机动力量，随时出击应付一切可能发生的意外情况。我空军的新式飞机，准备对马家军实施空中打击，空一师参与这次行动。在这种强大的力量打击下，不要说是国内的武装力量，就是苏联军队也未见得是对手，何况二马的装备远远未达到国内的一流水平，失败只是个时间的问题。
有人说这是杀鸡用牛刀，刘剑锋总长眼睛一瞪吼道：老子就是要用大铡刀，把这两匹劣种野马碎尸万段，看哪个混蛋今后再敢闹分裂！
1940年5月1日，临时联合政府给二马发出最后通牒，如果仍然坚持分裂的立场，联合政府将授权中国人民解放军，对青海、宁夏等省强制收编，以维护国家领土的完整。遗憾的是二马执迷不悟，只是开始一直未表态的甘肃的马鸿逵致电联合政府，表示愿意接受联合政府的同意改编，但是甘肃夹在青海和宁夏之间，还请蒋二位总统理解鸿逵的苦衷云云。
总统致电总参谋部和西北军区：西北二马一意孤行，北极熊掌伸入境内，看来和平解决无望。着你部立即展开行动，坚决彻底地清除国土上分裂的毒瘤，斩断可恶的熊掌，为祖国的领土完整，前进！的电报迅速传达到各参战部队，我军各部士气高昂纷纷请战担任主攻，各军兵种做好了充分的进攻准备。
5月3日凌晨3时，我军三百余架最新式的轰5型轰炸机，对甘肃和宁夏境内的马家军的阵地、仓库、公路等战略要地，进行了持久猛烈的饱和轰炸。随后我军的装甲部队在陆航武装直升机的配合下，向两省境内展开快速穿插，各路大军越过省界，像一股铁流滚滚杀向马家军的老巢。
中华民国的统一战争正式开始了！