这样，将有一大批参加过土地革命的老红军要被淘汰，任何人在感情上都难以接受这个严酷的现实，甚至在中央军委的高层中都有过争论。
115师，120师，129师，这三支八路军的老部队，由于习惯于游击战，不擅长进行阵地战和运动战。再加上部队平均文化水平较低，技术性较强的重武器几乎没有，影响了整体战斗力的发挥，在华北大决战的初期打得较好，在后期围歼的战斗都打成了击溃战。陈光、刘伯承、贺龙三位师长，已经意识到部队同特纵的差距，战后联名向军委和总部打报告，要求从特纵调一部分军事干部来部队。
中国人民解放军空军，从她诞生的那天起就一直伴随着战火，在战斗中迅速地成长成熟起来。经过整编后成立了三个飞行师，一个空降团。空1师和空2师全部由经过时空转运的先进战机组成。歼5五百余架，轰5七百余架，强5三百余架，为了不过早地实力，引起世界列强的猜疑，主要布置在西北地区秘密训练，只有一个飞行团布置在华北，不到万不得已很少参加战斗。
空3师只有少量的喷气式飞机，主要是以缴获的五百余架日机组成，也是最为活跃的飞行部队，每日穿梭在我解放区的上空，除了执行军事任务以外，几乎成了我军飞行员的培训实习基地。大批的飞行学员，在完成日机的飞行训练后，随即转到西北地区的机场，进入喷气式飞机的秘密飞行作训练。太原飞机制造公司经过艰苦的创业攻关，已经按照来自未来的图纸，对目前服役的各种战机进行批量生产了，同时开始对更先进的歼7进行试制。
中央军委正式任命王卫东中将为空军司令员，周建平晋为少将任空军副司令员。中国人民抗日军政大学训练部部长、教育长刘亚楼少将，原准备派往苏联入伏龙芝军事学院学习。因为目前我军无论是在军事理论，还是在武器装备等方面，都已经远远超过了苏联，并在山西太原建立了高级军事学院，我军的所有高级指挥员都将在这里接受轮训，系统地学习来自未来的最先进的军事理论。而且我军迅速扩大，整编急需高级军事干部，认为没有必要再去苏联学习，同李爱国和刘剑锋交换意见后，任命刘亚楼为空军政治委员。
1939年11月4日，中国人民解放军海军在刚刚解放不久的上海宣告成立，中央军委任命原太行舰艇学院副院长，来自未来的战士，曲哲少将任海军司令员，海军司令部暂设上海。曲哲少将是另一个时空中，中国人民解放军海军东海舰队，唐王号导弹驱逐舰副舰长，曾经在南京海军学院深造，对现代海上作战颇有研究。来到这个时空后，由于我军暂时没有海军，在对日军的作战中，曲哲干着急有劲使不上，找到当时的八路军特纵刘剑锋司令员，强烈要求改行到陆军。
当时八路军特纵政委李爱国也在场，看到求战心切的曲哲便说道：现在没有海军，并不等于将来没有，不光是海军，我们还要建立强大的空军，还要发展卫星、火箭、导弹、核武器。你现在的任务是立即开展海军人才的培养，你就把太行山当作大海，培养出合格过硬的人才，如果有一天建立海军你拿不出人来，我拿你小子是问！李爱国政委的一席话使他大彻大悟，立即跑去找到当时面临同样苦恼的周建平，几个来自海军和空军的战士经过讨论，很快太行舰艇学院和太行飞行学院就建立起来，为我军目前的发展做出了巨大贡献。
我军对上海和南京的接收很满意，日军的所有装备和物资都完好地被缴获，使苑永贤司令员乐得几天都没睡好觉，但是台湾的接收却不怎么出色。由于台湾的特殊地理位置，以及气候等诸多因素，尽管我军动用了最先进的飞机进行监视和封锁，大部分日舰还是偷偷地溜走了。在上海和南京光复一个月后，我军集中动员了一批的轮船，满载着南方集团军的部队，在大批的武装直升机的护送下，分别在高雄和台北登陆台湾。
我年轻的空军首次将秘密训练的空降团，投入到光复台湾的行动中，二十余架安24运输机，将空降团投放到港口和交通枢纽，为海路上的登陆作战部队创造条件。在台湾的各个港口，只接收了十余艘因故障不能离港的舰只，和几十艘小型的巡逻艇。但是由于我军先进的空中运输工具，使四十二艘准备驶往倭国运送物资的船只，还没来得及驶出港口便被我军俘获。作为对倭国的报复，连货带船全被我军扣留，滞留在台湾的倭国人被集中起来，关押在露天地，所供的食物和水只够维持生命，每日风吹日晒苦不堪言，等待倭国国内另派船只运送。
刚刚诞生的年轻海军，主要由缴获日军的舰只组成，原属于倭国中国方面舰队的出云、山云、安宅、嗟峨、乌羽、势田、坚田、比良、保津、热海等，约一百三十余艘大小舰艇。
年轻的海军暂时由三个舰队组成，北方舰队部署在山东烟台和塘沽；南方舰队暂时以上海港为基地；台湾舰队驻守台湾。同时利用缴获倭国海军的二百余架飞机，建立了海军航空兵部队，还有相应的潜水、扫雷、布雷、陆战等部队。虽然目前我军海军的力量还很薄弱，但是我军已经拥有日益强大的，应用来自未来的先进技术的工业作为后盾，中国的海军将很快地成长起来。
光复后的上海造船工业，很快地被注入了充足的资金恢复生产，大批来自解放区的造船技术人员涌入上海，各种工业物资也从四面八方调入上海，一批近海防御型舰艇已经开始了生产。
根据我军同德国签订的合作项目，由于我国暂时不具备航空母舰的制造条件，由德国在本国内制造，但是上海的造船工业基础，制造各型的军舰还是可以的。舰艇制造业准备分为两步走，优先生产诸如鱼雷快艇和炮艇等小型舰艇，首先应尽快地将近海防御体系建立起来。同时进行大型舰只的制造，要求起点较高，按照来自未来的图纸建造，包括导弹驱逐舰，并不断提高产量和生产规模。最终的目的是海军具备远海作战的能力，南海的主权可是曲哲司令员的一块最大心病。
总参谋部和总政治部联合发布命令，要求所有整编部队立即投入到军政学习训练中，在三个月的时间里必须完成新颁布的条令条例的学习。此外，还有军事思想、国际形势、新政府、文物保护、城市政策、新土地法、中国近代史等丰富内容。旨在使每一个指战员都明确自己的责任，充分理解现行的法规和政策，并具有一定的战略分析能力。使我军不仅仅是一支战斗队，也是一支出色的工作队，对整个我军战斗力的提高，起到了巨大的促进作用。
军事训练的重点是各军兵种的协同，尤其是同炮兵、装甲兵和陆军航空兵部队之间的配合作战，使军一级指挥员尽快掌握和熟悉自己的部队。陆军的基本训练课目是二百米内硬功夫（射击、投弹、刺杀），打坦克，四防（防空、放炮、防细菌、防化学）。
中国劳动党九大结束以后，最关心的有两件事，其一是成立中国的新政府，其二是派往东北的特遣队，在抗联武装中的工作进展情况。受中央的委托，全面负责这项工作的筹备和铺垫工作，他指示在重庆的汉光实业公司，开始为成立国共两党的新政府，在国民党内部作上层人物的工作。以劳动党中央的名义，邀请国民党总裁******，到山西对抗日工作进行考察。