为了感谢少年两次对他的恩情，红狼决定加入少年的队伍。少年的队伍从这一刻开始变成了四人，而这之后四人也被称为了最强猎人小队。
在安顿好妮娜之后，他们又一次的出发了。这一次他们的任务不光是讨伐赏金怪物和通缉犯，他们的目标里面还多了一样，那就是诺亚的电子军队。为了能够保证人类的生存环境，或者说是为了能让人类苟延残喘下去，被称为最强猎人小队的四人开始不停的狩猎诺亚的电子军团。
在这一个月之后，五大要塞终于是彻底巩固了下来，他们开始派出部队对诺亚的电子军团进行清理。甚至他们跟猎人中心总部进行了协商，将这些电子军团的怪物们也归类到了赏金怪物里面，在这之后越来越多的赏金猎人加入了战斗，甚至就连一些隐退的猎人们也是陆陆续续再次出现在了这片大陆之上，人类的反抗从那一刻就开始了。
随后的时间里，大陆彻底陷入了一片混乱之中，各地都有着不同规模的交战，而且昼夜不停。看着纷乱的战火，少年四人略一商量决定再次前往地狱门一探究竟。毕竟那里是诺亚的老巢，如果他们能够有机会干掉诺亚，那么这一切就都结束了。
时隔多日，少年带着他的伙伴再次来到了地狱门，只是这一次他们的阵容更加的强大，有了红狼和他的红色梅卡瓦的加入，少年觉得他们真的有能力能与诺亚一战。
那时的地狱门因为常年战斗的原因，周围早已变的荒无人烟，有的只是最中间那座高耸入云的高塔，而诺亚就在那其中。
少年一行人在很轻松的干掉了守门的机械守卫之后进入了地狱门，在他们迈入地狱门的刹那，他们就迎来了诺亚的攻击。高塔上面的炮台不停的向着他们轰炸着。不过早有准备的少年开启了S级战车防护屏障，他们就这样顶着漫天的炮弹冲到了高塔里面。
这座高塔里面曾经有着各国联合组织的众多研究人员来控制诺亚，而随着诺亚的暴走，这里的所有人逃的逃，散的散，被杀的被杀，留下的只有空荡荡的一片。
少年在前来这里之前就已经调查清楚了，诺亚并不是藏在最高层，而是在最底下的负二层。不过他们却遇到了难题，通往地下的大门早就被诺亚上了锁，而开启大门的四个锁就需要四个密码。
少年略一犹豫带着自己的伙伴们开始一层层的在高塔内部搜索了起来，为了以防万一他们还顺手除掉了高塔外围的炮塔和里面游荡的机械守卫......
也不知是上天的眷顾还是怎么，不久后少年一行人就在高塔的内部找到了三组像是密码一样的数字。为了印证自己的猜测，少年带着同伴回到了大门口开始输入了密码，结果就如同少年所想的一样，大门上的锁被解开了三个，唯一剩下的一个锁在他们技师的努力之下也是被破解了开了。他们终于可以前往诺亚的所在了，感受着心中复仇的怒火，少年带着伙伴们前往了地下一层。
此时的地下一层早就被诺亚放置满了机械军团，这导致少年一行人步步艰难，不过这也并没有阻止少年想要复仇的愿望。弹药打光了就传真回去补给，然后再次冲到地狱门，再打光了再回去补给，然后再冲到地狱门，少年就用这样的方法清光了负一层的机械军团，而这时他们终于是来到了前往负二层的通道口，那下面所在的就是诺亚了。
少年一行人做好了完全的准备之后，前往了底下负二层。而他们也如愿以偿的在这里见到了诺亚，这个名为人类最智能的计算机。
与负一层的荒凉不同，负二层到处都是电子仪器，而最里面有着一个硕大的平台，上面有着一个像是巨型眼球一样的东西，它的旁边有着无数的电路和小型电子仪器，少年一行人知道，这恐怕就是诺亚了。
少年一行人注意到诺亚的时候，诺亚自然也是早就注意到了他们。诺亚没有选择立刻对少年一行人进行攻击，而是问了他们一个问题。
“人类制造我出来为的是保护和改善地球的环境，可是不论我怎么计算都发现，想要改善和保护地球的环境只有一个办法，那就是除掉人类，人类才是这一切的罪魁祸首。你们觉得，我做错了吗？”
少年听到这个问题后突然愣住了，他一直觉得自己是为了保护人类而战，可是他从没有思考过诺亚为何会选择毁灭人类，或者说他不愿意思考，因为他心里也知道答案，所以他一直选择了逃避。可当这个问题真正摆在面前的时候，少年沉默了，因为他不知道自己该做出怎样的抉择。
就在这时，红狼代替了少年给出了回答，“我不管人类的生死存亡，我要做的就是保护我重要的人，这才是我来到这里的目的！”
听到红狼的这句话之后，少年也终于是不再犹豫了，因为他跟红狼是一样的想法，人类的生死存亡和人类的劣根性都跟他没有关系，他要做的就是保护自己重要的人，这才是他的本心。
于是战斗爆发了，诺亚用出了它所有的手段企图歼灭眼前的这几个人，可惜它毕竟只是一台计算机，在它用尽了手段之后，最终还是被少年一行人给摧毁了。
带着打败诺亚的成就感和一丝失落感，少年一行人离开了地狱门。在互相道别之后，各自回到了自己的家乡隐退了起来，红狼也回到了妮娜的身边。
不过又过了一个月之后，那名少年带着技师和女战士来到了红狼的家找到了他。因为他们发现随着诺亚的消失，大陆上的机械军团并没有就此减少，反而还在缓缓增多。于是少年一行人再次离开了家乡准备前往地狱门，等他们到达地狱门的时候被眼前的一幕惊呆了。地狱门前密密麻麻的守卫着众多的机械军团的怪物，而高塔上面的炮塔也全部被修复。
少年一行人愣住了，他们不明白为何诺亚消失之后这些东西反而增多了。于是少年一行人又一次拼尽全力来到了地下二层，结果他们发现眼前的诺亚竟然完好无损。直到这时他们才得知，原来诺亚竟然还有自我修复功能，而诺亚的核心其实也并不是眼前的这个巨型眼球，而是在更深一层的地下三层。
少年一行人决定这一次要彻底摧毁诺亚，可是这一次他们没有被上天所眷顾。诺亚早就准备好的机械大军被它派了出来，面对着为数众多的机械大军，就算是最强的猎人小队也感到了一些力不从心。无奈之下，他们选择了撤退，而在撤退之前诺亚告诉了他们一个秘密，“一个月之后，人类就会彻底的消失在这个世界上了！”
听到诺亚这句毫无感情的声音，少年一行人感到了一丝恐惧，他们不认为诺亚会说谎，既然诺亚这么说自然是已经在做着什么准备了。为了查清楚诺亚的手段，少年一行人开始不停的在这片大陆之上探查了起来。最终，他们发现了一丝端倪，原来诺亚为了毁灭人类，竟然在每个大陆的各个地方埋设了数量众多的爆炸装置，而这些装置如果统一引爆的话，恐怕这片大陆会顷刻间就沉入海底。