在使用石硫合剂过程中，应注意以下几个问题：
（1）该药对人的皮肤和眼睛有害，使用时要注意保护。
（2）药液有腐蚀性，不能用铜、铝、铁等容器盛放，最好用陶器。
（3）气温高于32℃或低于4℃时，不得喷用石硫合剂。对石硫合剂敏感的树种，如桃、李、梅、梨、葡萄等，主要在休眠期或早春萌芽前使用，适宜使用浓度为4～5波美度。苹果、梨萌芽后，开花前，石硫合剂的适宜使用浓度为0.3～0.5波美度。葡萄在萌芽后，开花前只宜喷布0.2～0.3波美度。
（4）在发生红蜘蛛的苹果园中，当叶片受害已很严重时，不宜再喷石硫合剂，以免引起叶片加速干枯、脱落。
（5）石硫合剂属强碱性药剂，如果与其他药剂混用不当，或前后使用间隔时间不足时，不但会降低药效，而且还会引起药害。石硫合剂与波尔多液绝对不能混用，即使前后使用，也需要一定的间隔时间。先喷石硫合剂时，需间隔10～15天，才能喷施波尔多液；先喷波尔多液时，要间隔20天以后，才能用石硫合剂，以避免发生药害。