武夷山从生态、景观、历史文化等方面与其他同类地区和遗产地的价值比较，有以下突出特点：
常绿阔叶林是分布在亚热带地区大陆东岸的植被类型。按地区分布格局可分为亚洲、美洲、非洲和大洋洲常绿阔叶林，其中以亚洲的中国常绿阔叶林分布最为广泛，位于北纬23°40′～32°、东经99°～123°，海拔100米～2800米之间，气候差异明显，形成的亚热带常绿林又占中国常绿阔时林面积的3／4，区内发育有壳斗科(Fagaceae)、樟科(Lauraceae)、山茶科(Theaceae)、木兰科(MagnoLiaceae)、金缕梅科(Hamamelidaceae)、和杜英科(Elaeocarpaceae)树种为标志的中亚热带常绿阔叶林，它是常绿阔叶林的典型代表。而武夷山常绿阔叶林又是中国中亚热带常绿阔叶林分布最为典型、物种最丰富和森林生态系统保存最完整的。
与我国同类遗产地的景观方面相比，黄山雄奇，峨眉山峻秀，泰山古老，但这些遗产地都是山岳风景，或有山无水，或有水不能舟游，或有文少景，或有景缺文。武夷山则集山岳、河川风景于一身，不仅“奇、秀、美、古”兼而有之，而且在山与水的紧密结合、人文与自然和谐统一上达到绝妙的境界。清澈碧绿的九曲绕山而行，曲折萦回。发育典型的丹霞单面山、块状山，柱状山临水而立，千姿百态。又有3000余年的古文化遗存洒落在溪畔峰麓，岩壁洞穴。自然山水之中溶注着浓郁的文化气息。游人乘坐古朴轻巧的竹筏顺溪而下，急速飞跃险滩，缓缓漂过深潭，饱览武夷溪光山色，瞻仰两岸文化古迹，既可享受桂林的诗情画意，又可领略百胜滩的惊险刺激，令人叹为观止。这一独特的资源是其他遗产地所难以比拟的。
与同类历史文化遗存相比，在我国长江流域及东南亚地区的十几处悬棺葬中，武夷山架壑船棺是年代最早、形制最古朴的。武夷山西汉闽越王城遗址出土的文物，更有许多位居全国同类文物的前列，有全国最大的花纹空心砖，全国最长的铁矛头，有全国最重的铁犁，有全国最重的铁门臼、户枢，有全国最早的铁鱼叉、顺形陶水管道、宫中豪华浴池；还有同时期仅见的铁五齿耙。这些文物分别代表当时中国文明的最高水平。
在中国文化史上的地位，武夷山与泰山各有千秋。泰山孕育孔子，孔子集前古学术思想之大成，开创儒学，成为中国文化传统的主要骨干。武夷山造就了朱熹，朱熹集孔子学术思想之大成，构建了完整的儒学思想体系——朱子理学，成为中国封建社会后期700余年间的正统思想。因而国内外学者普遍认为，在中国文化史、传统史、思想史、教育史和礼教史上影响最大的，前推孔子，后推朱熹。综观全史，恐无第三人堪与伦比。自有朱子，而后孔子以下之儒学，乃获生机，发挥新精神，直迄于现代。