当桑顿明确地告诉他除非他们两个人共享专利权，否则不能授予他专利时，愤怒的霍尔上诉到了国务卿詹姆斯？门罗那里，要求就此争议根据《专利法》进行听证。门罗温和地建议他不要再捣乱了，因为“如果是我，哪怕让出我的一半权利而不是完全独享，也要保持与桑顿博士的关系，这样对我更为有利，因为他在这个案子上的影响要么对我有利，要么对我不利。”
霍尔屈服了，这一决定也让他终生遗憾。他后来也曾寻求报复，但却付出了更大的代价。最后，他和桑顿就专利分享一事达成了协议，霍尔获得了制造权，但特许权收入要分给桑顿一部分。霍尔后来拒绝在特许证上签字，因此也拒绝了桑顿的勒索，但是同时也减少了他的枪支的销售[13]。
然而，霍尔这次受难只是一个开始。他急迫地需要一个军方的合同，但是桑顿却成了他的复仇女神，动用他所有的关系来阻止霍尔得到任何的帮助。虽然霍尔在宣传册中声称他的来复枪在缅因州海岸成功地击退了一个“枪弹不入的海怪”，但研发枪支和开办工厂所花的费用已经让他的财力非常紧张，而得不到官方合同又使销售陷入困境。最后，他终于设法从喜欢他的武器的邦福德那里得到了一个小军火合同。在1816年进行的测试中，他的武器赢得了高分，这让他又赢得了一个稍大一点的合同。但让霍尔感到气恼的是，他又被迫放弃了这个合同，因为他正在失去他的工厂。随着1812年英美战争的结束，军方对武器的需求也随之下降了。
在那之后，霍尔也加大了赌注，做出了惠特尼在20年前所做的同样的承诺，即他用机器制造出的武器将实现所有零部件的可互换性，这当然引起了军方的注意。同时，由于霍尔的家族也有一些自己的政治关系，因此也引起了新任的陆军部长约翰？卡尔霍恩的注意。在一系列的干预之下，卡尔霍恩安排了两次独立的测试；最后还按照1818-1819年颁布的军火标准，由军方对霍尔的来复枪进行了为期三个月的严格评估。尽管霍尔认为评估报告“非常谨慎”，但它确实明确地确认了他的主张。事实证明他的来复枪在精确度和火力方面与标准的来复枪不相上下，但是却更加耐用——两项得分比其他任何的步枪都高——而且，由于他的来复枪在装弹方面的便捷性，评估委员会以2：1的投票结果认定它优于标准的来复枪，并以3：2的投票结果认定它优于步枪。评估委员会认为装弹的便捷性“将使来复枪获得无限的发展，装弹困难是限制这种武器获得更广泛的应用的一大障碍。”（因为枪膛中的来复线会阻塞，所以从枪口装弹就成为来复枪的一个特殊的问题。）
评估的结果是霍尔得到了一个类似于布兰查德那样的研发合同。1819年，他最终完成了这个合同；如果不是一个近乎致命的、在霍尔的余生中让他受尽烦恼的“第22条军规”[14]，这一结果也足以慰籍那些为霍尔祈祷的人们了。他在军方得到了一个带薪的职位，负责为设备和人力拨款；除此以外，他可以从每支交付的来复枪中得到1美元的特许权费。但是，合同却必须在哈珀斯费里而不是斯普林菲尔德的军工厂里履行——哈珀斯费里是“南部”的军工厂，虽然技术上比斯普林菲尔德落后，但主要出于政治上的原因，再加上离华盛顿比较近，所以合同要在这里履行。霍尔也做了争辩，但最终别无选择，只能同意；他本人也在哈珀斯费里军工厂里度过了余生。正如他所担心的那样，哈珀斯费里军工厂里的主管都是些政客。当他在缓慢而稳步地研发制造流程——正是这些流程在下一个世纪巩固了大规模制造技术——的时候，这些人不仅对他的工程没有什么兴趣，还经常暗中破坏——挪用他的款项，少拨付给他设备和场地，还无休止地报怨他的方法是浪费和无效的。他后来也承认，由于自己天真地低估了面临的挑战，从而让他的批评者获得了更多的可信性：
我没有料想到会用这么长的时间……来实现用所有完全相似的零部件来组装武器……别人告诉我说，法国的专员们已经宣布这是不可能的……而我也知道在英国和我国，先前所有的努力都是以失败而告终；但是出于一种对自己能力的坚定的信任，我期望在短期内能够实现这一目标……
霍尔做出了独一无二的预言，即要想实现真正的精确制造，就必须重新详细地构思整个流程，即使提供更好的机器也解决不了问题。例如，很重要的一点是要从为待加工的材料找到理想的模型开始，并且从这一模型出发而采取后续的措施。他坚持每个零部件都要使用专用的机器生产，而专用机器也要用专用的机床来生产。往机器上放置或者固定一个部件时也要同样注意，就像注意机器本身的精度一样。每一步工序都要使用精密仪表——在来复枪的生产过程中总共需要使用大约63种独立的仪表，根本不需要工人凭借经验来判断。这些精密仪表通常要装备三组，一组给工人们用，另一组给检验员们用，第三组放在工厂经理的办公室里，用以监测另外两组的磨损情况。对检测情况再进行检测有助于检验出那些不合标准的零部件；最后，一批完工的来复枪还要被拆卸开，把它们的零部件混合在一起再次组装成成品枪，然后才能出厂。在整个的生产过程中，霍尔对许多流程都做出了很大的贡献，特别是打磨和铸造工序；他还创造了新的体系来控制切割工具，并解决了困扰所有前人的难题——铸件在冷却过程中的收缩问题。他还极为关注他的机器里的阻尼振动和杂音问题，重新设计了驱动装置和各种轴杆以使它们保持精确度，还发明了各种仪表来测量机器是否偏离精确度。