许多飞碟事件的目击者都说，飞碟飞行的方式极为罕见，与我们常见到的飞机的飞行方式大相径庭。
飞碟主要有以下几种特殊的飞行方式：突然出现、直角转弯、快速移位、任意调转方向、直起直落、速度极快、空中悬浮、发出耀眼的光束、产生电磁波、毫无声息等等。
从飞碟飞行的特殊方法与技术可以看出，它的飞行动力是发达的，人类最先进的科技也难与之相比，因此对其动力原理仍停留在理论推断与幻想之上，以下就是当前人们对飞碟飞行原理的一些常见的猜测：
①认为飞碟是以意念移动的。因为人的思维有超时空性，有些具有特异功能的人，能够用意念使物体移动。可能是人脑可以发出意念场，使物体先解体，然后再通过门窗墙壁等障碍物的原子间的空隙，再将解体物体又还原成原来的样子，从而形成能突破空间阻隔的传送。
②认为飞碟是通过分解传输来获得动力的。这种方式是将物体分解成基本粒子以光速传输，用信息码载入分子机，然后再重组成原来的物体。
③认为飞碟是以电磁力来推动的。利用超传导的电磁石产生强力磁场与高压，并将周围空气产生等离子化现象，借助其反作用力来推进。
④认为飞碟是以重力推动移动的。假如飞碟的科技水平已掌握到利用重力场，能自由地选择重力场对它发生作用，那么很容易就被具有这个重力场的星球吸引过去。
⑤认为飞碟的动力是靠统一场推进的。一些UFO专家根据爱因斯坦的“统一场论”指出，宇宙间的电磁场和引力有着密切的联系，两者互相演变和斥合。场共振即是把电磁场、重力场、强核力、弱核力之间的互相作用力组合起来，并与时空之结构、太空船本身之人造力场相结合，使之协调变动，可使太空船由某一点到另一点迅速加速通过，沿着时空隧道立即到达宇宙的另一个遥远的位置，这一位置在地球人看来需要几万光年才能到达。
当然，以上这些都是猜测和幻想而已，而事实究竟如何，还是一个待解之谜。