经过数亿年的进化，软体动物的头、足和内脏团三部分都有所变化，使得它们身体器官的功能越来越完备，防御敌害的本领也越来越强，更加适合当今的生活环境。如今，它们的身体都变成什么样了呢？
不同软体动物的头部进化的程度不同，有的软体动物的头部很发达，有的软体动物头部不发达，有一些软体动物的头部甚至已经消失了。对于乌贼和田螺等善于运动的软体动物来说，它们的头部十分发达，并长有眼睛和触角等器官；对于石鳖等不善于运动者，它们的头部或许不会长眼睛，而眼睛可能会长在身体的其他部位；对于蚌类、牡蛎等喜欢居住在洞穴之中的软体动物，它们的头部早已经消失了。
“足”是重要的运动器官，对于绝大多数动物来说都是必不可少的，但是，对于一些软体动物来说，有没有足都不妨碍它们运动。软体动物的足部通常位于身体的腹侧，不同软体动物足的进化程度不同。进化比较发达者的足部有多种形状，如斧状、叶状或柱状等。这些形态各异的足不但可以用来爬行，还可以用于挖掘洞穴。像扇贝等软体动物的足已经退化了，以致于不能够再进行运动了。而牡蛎在进化的过程中已经失去了足。章鱼和乌贼的足有些已经进化成了用于捕捉食物的腕。
至于软体动物的内脏团，多数位于足的背侧，且左右对称。不过，螺类的内脏团却是螺旋状扭曲着的。