东元元年，地球各色人种统一在联邦政府之下，由十二个政党轮流执政，地球进入一个新的纪元。
经过一千年的演化，东元一千年，新的人类在地球诞生，他们天生具有一种非凡的能力，可以与一种古老的力量沟通，这种力量被人们称做暗能量。
与人类类似，在自然界中，一批动物经过一千年的演化也产生了伟大的进化，进化的动物们也拥有了与新人类一样的力量——暗能量。
暗能量虽然强大，但是初生的新人类的躯体无法发挥出十分强大的力量，于是，一些新人类通过锻炼自身的暗能量而变得强悍起来，成为古人类口中的亚超人。
而另一些新人类，他们发觉与自己暗能量属性相似的新动物可以与自己发生共鸣，同时重组躯体而拥有不低于亚超人的力量。
这些进化的动物被他们称做：宠兽。
新人类的数量在整个人类中的比例是十分低的，接近十万分之一，换言之，十万个人中才会有一个幸运儿进化为新人类。
而宠兽的数量则更为稀少，平均二十个新人类中才会有一个拥有宠兽。
新人类诞生之初，由于他们拥有的古老力量而在古人类中产生恐慌，恐惧促使古人类消灭所有能发现的新人类。
新人类面临着灭绝的危险，他们被古人类当做瘟疫，几乎世界各地都传来新人类被当做吸血鬼绑在十字架上烧死的事情。甚至是四五岁的孩子，一旦被发现是新人类也难逃厄运。
新人类不甘灭亡，在几个领袖人物的组织下，开始了对抗古人类灭绝新人类的战争。
战争刚一开始，新人类就占据了上风，虽然人数很少，但是个体作战能力很强，他们从来不与军队正面对抗，一旦军队分散兵力，就会遭到他们强大的攻击。
即便是全世界最强悍的特种部队，遇到新人类也只能惨败。
战争持续到第三年，古人类的两百个专业，一百五十位最顶尖的科学家，研制出足以抗衡新人类的秘密武器——机械兽。
这是一种超级智能机械兽，他们针对古人类最强大的战士体能，模拟进化人类的战斗方式，促使机械兽通过与古人类战士合体，刺激战士的潜能，并在短时间内开发他的脑域细胞。
这种超级智能机械战士不但具有极高的智慧，而且拥有不低于新人类的强大力量，另外合体后的机械兽覆盖在战士的身体表面，就如同是一件坚固非凡的铠甲。
只是机械兽的开发不但需要耗费大量时间，而且所需费用也极为昂贵，以联邦政府的庞大财力也仅仅在三年内陆续开发出一百只超级智能机械兽，此后财政便捉襟见肘，难以为继。
超级智能机械战士的出现立即扭转了古人类不利的局面，新人类遭到迎头痛击，一年内损失了三分之一的数量。
而一百个超级智能机械战士也只剩下四十个。
战争持续了十年，双方均损失惨重，地下的黑暗势力也逐渐露出水面，企图坐收渔翁之利，并趁机颠覆政府。
人类世界在一千年前的大战之后，社会再一次陷入极大的动乱之中。
当新人类只剩下不到一半的人数时，联邦政府的超级智能机械战士也只剩下二十人左右。
第三股力量黑暗势力的介入，引起新人类和联邦政府的高度警惕。
新人类的几个伟大的人物代表新人类与联邦政府进行了一次秘密谈判，第二天，新人类突然在古人类视线中消失。
此后三年，联邦政府积极清除社会中的黑暗势力，在遇到棘手的事情时，总会有新人类和超级智能机械战士的影子出现。
也许他们达成了某种默契，总之新人类再也没有在古人类社会上大规模出现过，他们以普通人的身份居住在古人类中间。
经过漫长的岁月，地球上的生物开始了一次新的进化。
在人类中一部分人掌握了一种新的力量，这种力量被叫做暗能量。而在其他生物体内，同时有一些幸运的生物也拥有了这种力量。
拥有暗能量的生物被人们称之为宠兽。
根据这些宠兽所具有的暗能量属性和大小的不同，宠兽们被分为一到九级，每一级又分为上、中、下三品。
因为宠兽数量稀少，所以任何一只宠兽不论级别高低都是很罕见的。
迄今为止，人类所发现最强的宠兽也不超过五级上品。每一只宠兽孵化时就已经确定了级别，在以后的成长中，它的级别不会再出现任何变化。
但是每三年一出的兽王则不一样，它会随着主人力量的增长而发生变化，但是人力有限，历史记载的最强兽王也只能生长到五级上品。
宠兽因为具有暗能量而能和新人类达到某种程度的联系，这种联系被叫做合体。
合体后的新人类与宠兽会以一种特殊的状况存在，一般是半人半兽，不但激发出了人类的潜能，增强了战斗力，同时人类也具有了一些只有某些动物才能拥有的本领。
上集回顾
向祖神献祭，会给沙漠部落的人们带来力量，同样也会吸引很多凶猛而神秘的怪兽从四面八方涌来。
在兰虎等人的帮助下，怪兽们被击退，但是也让兰虎发现了一个惊天秘密，沙漠部落的祖神——强大无比、拥有控制火焰的力量的远古神兽腾蛇仍然活着，它正在寻找机会试图破开石雕，重现人间。
沙漠部落、军部、向家堡三股势力在沙漠上展开了彼此攻伐。
神秘莫测的桃花源叛徒哈里兽突然出现在地下城中，原来他是受新联盟的委派，前来帮助向家堡消灭沙漠部落和兰虎等人。
修为高强的哈里兽试图用自己精制多年的神剑坯体封印腾蛇，炼制成威力无匹的神剑，腾蛇不甘心被封印，与哈里兽厮杀起来。
腾蛇的强悍远出哈里兽的意料之外，不过腾蛇本体被封印在石雕中，很难抵抗住哈里兽的攻击。最后关头，腾蛇不得不放弃一切，选择臣服于丽珠赤那，哈里兽惨死蛇吻。
沙漠部落派出全部精锐战士，联合云岩城中倾向沙漠部落的军队首领方战，对向家堡发动了最后的反攻。向家堡被攻了个措手不及，向天道狗急跳墙，从自己的地下基地中引来了秘密研制多年的尚未完善的成千上万的各种基因兽，对攻打向家堡的众人展开了报复。
经过惨烈的战斗，沙漠部落攻克了向家堡，向天道仓皇逃走。
兰虎在沙漠绿洲中追上了向天道，此时一直潜藏在暗中的独孤奇率领手下突然出现，试图抢夺向天道手中的基因兽方程式，大战再次爆发。
和太古凶兽火鸦合体的独孤奇强大无比，兰虎岌岌可危。在关键时刻，兰虎激发出体内神兽贪狼的力量，和隼狼、腾蛇联手，终于将独孤奇击败。