（1）腰背痛：腰背痛是强直性脊柱炎最常见的症状，是病情活动的指标之一。疼痛的位置包括腰部、下背部及腰骶部。因为强直性脊柱炎主要侵犯中轴关节且病变发展趋势大部分是由下而上，所以骶髂关节和腰椎受累几乎见于该病所有患者，其发生率在90％以上。骶髂关节炎症早期一般比较隐匿，所以早期腰痛只表现为腰骶部不适或隐痛，有些患者只在劳累后发作，呈间歇性或两侧交替性酸痛，或表现为臀深部不适感。
随着病情进一步发展，隐痛或间歇痛会变成持续性腰骶部酸痛、刺痛和臀深部钝痛或腰、骶、臀等部位难以言状的酸胀不适感，夜间较重，甚至在睡眠中痛醒。晨起或长时间保持一个姿势，会出现腰部僵硬感，疼痛也会加重，稍事活动后又会减轻。疼痛严重时患者不能下床活动，翻身困难。有些患者出现单侧臀部或大腿后侧疼痛时，容易被误诊为坐骨神经痛或腰肌劳损。强直性脊柱炎臀腿疼痛一般很少放射至膝关节以下。
（2）晨僵：晨僵是指清晨僵硬感，活动后可缓解，是病情活动的指标之一，也是强直性脊柱炎早期常见的症状之一。强直性脊柱炎患者清晨起床时，或久卧久坐之后站起时，腰骶部常感到僵硬不舒、活动不利，有时需持物借力方能活动，活动一段时间后，这种僵硬感会逐渐减轻、缓解或消失。病情轻者持续时间较短，病情严重者可持续全天。
（3）肌腱、韧带骨附着点疼痛：强直性脊柱炎的特征性病理变化是附着点炎症。附着点是指肌肉、韧带与骨骼或关节囊的附着处。附着点炎症是肌腱韧带的疼痛或肿胀。由于附着点都在关节周围，所以常常引起关节周围肿胀。