以成为神奇宝贝大师为目标的小智一行人，正在真新镇到常磐市之间的真新森林里继续着他们的旅行。
“嘶嘶……”一声虫鸣传来，小霞就开始飙高音了：“呀呀-------”小智定睛一看，大喊一声：“来者何人？（小智：来者何虫？）”原来是一只绿毛虫啊。小智一看，心想：小霞还是怕虫的人啊，得找个时间教育教育她。小智又大喊一声：“去吧，皮卡丘！一招解决掉它吧！”“皮卡---丘-----！”绿毛虫被烧成了一团灰（小智：不对，只是被做成烤绿毛虫了。）“去吧神奇宝贝球！”小智又扔出一个神奇宝贝球。神奇宝贝球摇都不摇就停下来了。知道小智为什么要捉绿毛虫吗？因为绿毛虫的进化型巴大蝴是超能系的，还很厉害的。神奇宝贝球上一道金光闪过，神奇宝贝币2500和一个虫变异之果进入了现在的空间里，小智给绿毛虫喷了高级伤药之后，让它把变异之果吃了下去，绿毛虫的能力值暴涨，直接进化成了铁甲蛹。有一道金光从铁甲蛹身上闪过，神奇宝贝币和一个大师球进入了小智的空间里。
小智对小霞说：“绿毛虫并不可怕，而且它的进化型巴大蝴还很漂亮，你看。”说着，小智掏出神奇宝贝图鉴，翻出来巴大蝴一页。小霞看见之后十分喜欢，对虫的畏惧也消失了。“当，让小霞不害怕虫，奖励神奇宝贝币1000，开启支线任务送给小霞生日礼物。当，获得给小霞的礼物?。”
“轰隆隆……”一阵阵雷声传来，震耳欲聋，如同大炮轰鸣，使人惊悸。一道道闪电划破漆黑的天幕，宛如哈克龙听到信号，撕开天幕，把天河之水倾注到人间。这时候，我们的主角小智和小霞正在一个山洞里躲雨。小霞抱怨道：“啊呀，这天气怎么说变就变呢？”而小智从背包里拿出三根羽毛，心想：凤王，我来了！
小智的空间里---------
大木博士送的蛋孵出来了，水君，雷公，炎帝跳了出来，吃下蛋壳补充能量，小智就开始问他们三个了。“你们怎么一起出生啊？”小智问。“只有我们三个各自的妈妈一起才能生下一个大蛋，这个蛋里就有我们三个了。”小shuijun抢着说出来。“还有，你得到了我们三个的认可，我们给你三根羽毛，可以召唤一次凤王，尝试收服她，只有一次机会，没有人成功过。”小雷公说着递给了小智三根羽毛。
山洞外，雨慢慢停了，小智和小霞出了山洞，继续朝常磐市的方向走去。“迩------”一声清脆悦耳的鸟鸣传来，小智和小霞抬眼一看，是凤王！小霞轻轻说：“好漂亮啊！”而x小智则是拿出三根羽毛，往地上拍，大喊一声：“来吧，凤王！”“啪”一道白烟传出，凤王就站在了小智和小霞的前方，小霞惊的下巴掉到地上去了。小智快速结印：亥--戊--酉--申--未，这赫然是忍术---通灵之术！一道闪光，接着一只全身翠绿色的龙形神奇宝贝出现在了凤王的面前，这赫然是小智的好伙伴---青光眼龙！青光眼龙直接一招龙系究极奥义---龙神之怒过去，速度连凤王看都没看清楚就打了上去，凤王直接昏迷，两眼转圈？不，一道白烟散出，这只是个替身！是啊，要没有两把刷子怎么称得上一级神兽呢？“迩---”青光眼龙的上方，一道纯正的火焰向青光眼龙袭去，这赫然是凤王的大招--神圣火焰！
青光眼龙一声巨吼，它的威压直接把凤王给定住了，神圣火焰也被打散了。小智扔过去一个大师球，大师球摇了几下之后就不动了，小智高兴的跑过去，举起凤王的神奇宝贝球，大喊一声：“我收服凤王了！”一道金光从凤王的神奇宝贝球闪闪过，神奇宝贝币100000，三个火焰变异之果，一个神奇宝贝蛋进入了小智的空间里，小智乐翻天了，而小霞则在一旁看的目瞪口呆。小智把事情的来龙去脉告诉了小霞，并带小霞参观了他的空间，小霞发誓不说出去。小智放出来了凤王，帮她治好伤后，凤王承认了这个主人，并开始了超越阿尔宙斯的魔鬼训练。